183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3103 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3103  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.210422  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2704  CoA-binding  83.33 
 
 		 194 aa  326  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2668  CoA-binding  82.38 
 
 		 194 aa  325  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4595  hypothetical protein  74.48 
 
 		 194 aa  296  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2457  CoA-binding  76.44 
 
 		 194 aa  291  3e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.618512  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2693  CoA-binding  75.29 
 
 		 180 aa  256  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4331  CoA-binding domain-containing protein  68.99 
 
 		 182 aa  216  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.282355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0145  CoA-binding domain protein  58.72 
 
 		 181 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4615  CoA-binding domain-containing protein  58.14 
 
 		 180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.305914  normal  0.0136961 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2417  CoA-binding domain protein  61.96 
 
 		 193 aa  192  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2712  CoA-binding domain protein  61.35 
 
 		 193 aa  190  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350227  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2489  CoA-binding domain-containing protein  61.35 
 
 		 193 aa  190  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1177  CoA-binding domain-containing protein  57.06 
 
 		 205 aa  185  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1328  CoA-binding domain protein  62.86 
 
 		 142 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0242548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1241  CoA-binding domain protein  62.86 
 
 		 142 aa  164  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1166  CoA-binding  52.41 
 
 		 145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365479  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1687  hypothetical protein  58.57 
 
 		 150 aa  156  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.863027  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2075  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  51.88 
 
 		 612 aa  154  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.313252  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0866  CoA-binding domain-containing protein  59.29 
 
 		 144 aa  150  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226245  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2493  CoA-binding domain-containing protein  55.97 
 
 		 152 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.244493  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1875  CoA-binding domain protein  55.88 
 
 		 147 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2574  hypothetical protein  53.12 
 
 		 161 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624453  hitchhiker  0.000000425683 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2052  CoA-binding  51.97 
 
 		 154 aa  142  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  53.96 
 
 		 198 aa  141  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  54.48 
 
 		 137 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  52.55 
 
 		 137 aa  134  8e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  51.09 
 
 		 137 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  52.24 
 
 		 137 aa  131  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2798  CoA-binding  49.01 
 
 		 156 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.254267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  51.47 
 
 		 138 aa  128  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  51.47 
 
 		 138 aa  128  7.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  51.47 
 
 		 138 aa  127  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2358  CoA-binding domain-containing protein  50 
 
 		 138 aa  125  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2254  CoA-binding domain-containing protein  47.41 
 
 		 138 aa  124  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0324206  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1684  hypothetical protein  53.28 
 
 		 154 aa  124  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  56.49 
 
 		 139 aa  124  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  49.62 
 
 		 137 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  50 
 
 		 137 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  49.62 
 
 		 137 aa  122  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  49.62 
 
 		 137 aa  122  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  49.62 
 
 		 137 aa  122  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  49.62 
 
 		 137 aa  122  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  49.62 
 
 		 137 aa  122  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  49.62 
 
 		 137 aa  122  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2240  hypothetical protein  48.91 
 
 		 148 aa  121  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394786  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  49.23 
 
 		 137 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_50959  predicted protein  51.49 
 
 		 146 aa  120  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  46.67 
 
 		 144 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0915  CoA-binding domain-containing protein  47.45 
 
 		 148 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.157936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5334  CoA-binding protein  45.9 
 
 		 144 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3313  hypothetical protein  46.58 
 
 		 153 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  40.65 
 
 		 176 aa  114  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3183  CoA-binding domain protein  45.52 
 
 		 153 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3508  CoA-binding domain protein  45.21 
 
 		 154 aa  111  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0120178 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2004  CoA-binding domain protein  43.28 
 
 		 135 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3130  CoA-binding domain-containing protein  42.68 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3857  CoA-binding domain-containing protein  42.68 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.942746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2836  CoA-binding domain-containing protein  50.71 
 
 		 155 aa  108  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.758344  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2251  CoA-binding  47.01 
 
 		 140 aa  107  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  40.77 
 
 		 140 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2340  CoA-binding domain protein  38.26 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02340  predicted CoA-binding protein  41.61 
 
 		 171 aa  106  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  44.93 
 
 		 139 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0272  CoA-binding domain protein  38.46 
 
 		 136 aa  105  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0530  CoA-binding domain-containing protein  42.47 
 
 		 164 aa  104  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  42.86 
 
 		 139 aa  104  8e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4825  CoA-binding domain-containing protein  50.39 
 
 		 130 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1943  CoA-binding  38.84 
 
 		 142 aa  102  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.19202  normal  0.743605 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2525  hypothetical protein  40.14 
 
 		 139 aa  102  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.550629  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2827  hypothetical protein  36.15 
 
 		 133 aa  102  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0856697 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  39.71 
 
 		 149 aa  102  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  43.38 
 
 		 142 aa  101  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3824  CoA-binding domain-containing protein  41.48 
 
 		 150 aa  99  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  38.41 
 
 		 140 aa  99  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  38.35 
 
 		 144 aa  98.2  6e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  44.12 
 
 		 169 aa  98.2  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0390  CoA-binding domain-containing protein  37.14 
 
 		 146 aa  97.8  8e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3436  CoA-binding domain protein  39.19 
 
 		 180 aa  96.7  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1048  CoA-binding domain-containing protein  38.52 
 
 		 139 aa  96.7  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.417839  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1379  CoA-binding domain protein  38.51 
 
 		 161 aa  97.1  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  40.3 
 
 		 135 aa  95.5  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1014  CoA-binding domain protein  42.15 
 
 		 136 aa  95.5  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1948  CoA-binding domain-containing protein  38.57 
 
 		 151 aa  94.7  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  44.6 
 
 		 140 aa  94.4  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2085  CoA-binding domain protein  41.18 
 
 		 154 aa  94  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1562  CoA-binding domain-containing protein  40 
 
 		 139 aa  93.6  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.477139  normal  0.0705808 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0584  CoA-binding domain-containing protein  38.93 
 
 		 175 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1144  CoA-binding  36.3 
 
 		 142 aa  93.2  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3193  CoA-binding domain protein  41.79 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19320  predicted CoA-binding protein  37.16 
 
 		 165 aa  92.8  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0866422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0747  CoA-binding  41.67 
 
 		 140 aa  92.4  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0309601  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1988  CoA-binding domain-containing protein  40.6 
 
 		 140 aa  92.4  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370858  normal  0.185314 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3344  CoA-binding  36.96 
 
 		 145 aa  92  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  45.24 
 
 		 133 aa  91.7  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1672  CoA-binding protein  39.13 
 
 		 143 aa  91.3  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996781  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2396  CoA-binding  39.55 
 
 		 138 aa  91.3  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.972486  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  40.16 
 
 		 134 aa  90.9  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3363  CoA-binding domain protein  38.57 
 
 		 199 aa  91.3  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0719099  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2545  hypothetical protein  41.54 
 
 		 138 aa  90.9  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>