183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2704 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2704  CoA-binding  100 
 
 		 194 aa  394  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2668  CoA-binding  90.62 
 
 		 194 aa  342  2e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3103  hypothetical protein  83.33 
 
 		 194 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.210422  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4595  hypothetical protein  71.65 
 
 		 194 aa  293  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2457  CoA-binding  74.09 
 
 		 194 aa  288  3e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.618512  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2693  CoA-binding  76.47 
 
 		 180 aa  261  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4331  CoA-binding domain-containing protein  63.29 
 
 		 182 aa  205  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.282355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0145  CoA-binding domain protein  57.31 
 
 		 181 aa  192  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2712  CoA-binding domain protein  61.35 
 
 		 193 aa  189  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350227  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2489  CoA-binding domain-containing protein  61.35 
 
 		 193 aa  189  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4615  CoA-binding domain-containing protein  59.39 
 
 		 180 aa  188  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.305914  normal  0.0136961 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2417  CoA-binding domain protein  60.74 
 
 		 193 aa  186  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1177  CoA-binding domain-containing protein  56.47 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1166  CoA-binding  53.79 
 
 		 145 aa  159  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365479  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1328  CoA-binding domain protein  57.86 
 
 		 142 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0242548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1241  CoA-binding domain protein  57.86 
 
 		 142 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2075  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  50.93 
 
 		 612 aa  154  8e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.313252  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1687  hypothetical protein  55 
 
 		 150 aa  148  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.863027  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0866  CoA-binding domain-containing protein  54.29 
 
 		 144 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226245  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2493  CoA-binding domain-containing protein  53.38 
 
 		 152 aa  142  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.244493  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2574  hypothetical protein  52.67 
 
 		 161 aa  142  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624453  hitchhiker  0.000000425683 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1875  CoA-binding domain protein  55.38 
 
 		 147 aa  141  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2052  CoA-binding  51.32 
 
 		 154 aa  141  7e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  52.21 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  51.88 
 
 		 137 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2798  CoA-binding  50 
 
 		 156 aa  131  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.254267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  51.13 
 
 		 137 aa  127  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  48.53 
 
 		 137 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2240  hypothetical protein  52.21 
 
 		 148 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394786  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  50 
 
 		 138 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  50 
 
 		 138 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  50 
 
 		 138 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2358  CoA-binding domain-containing protein  52.63 
 
 		 138 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2254  CoA-binding domain-containing protein  48.51 
 
 		 138 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0324206  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  49.26 
 
 		 137 aa  124  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0915  CoA-binding domain-containing protein  50.74 
 
 		 148 aa  124  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.157936 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  53.44 
 
 		 139 aa  119  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_50959  predicted protein  50.38 
 
 		 146 aa  118  4.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1684  hypothetical protein  48.91 
 
 		 154 aa  118  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5334  CoA-binding protein  45.9 
 
 		 144 aa  116  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  45.86 
 
 		 137 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  45.86 
 
 		 137 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  45.86 
 
 		 137 aa  115  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  45.86 
 
 		 137 aa  115  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  45.86 
 
 		 137 aa  115  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3857  CoA-binding domain-containing protein  44.17 
 
 		 171 aa  115  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.942746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  45.86 
 
 		 137 aa  115  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  45.86 
 
 		 137 aa  115  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  45.86 
 
 		 137 aa  115  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3130  CoA-binding domain-containing protein  43.56 
 
 		 171 aa  115  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  47.24 
 
 		 137 aa  115  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  46.51 
 
 		 144 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  45.11 
 
 		 137 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  40 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2004  CoA-binding domain protein  43.61 
 
 		 135 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3313  hypothetical protein  42.55 
 
 		 153 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2340  CoA-binding domain protein  39.6 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2251  CoA-binding  46.27 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  41.61 
 
 		 139 aa  105  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  41.61 
 
 		 149 aa  105  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  51.11 
 
 		 169 aa  104  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2836  CoA-binding domain-containing protein  48.57 
 
 		 155 aa  104  8e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.758344  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  48.15 
 
 		 142 aa  104  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1943  CoA-binding  42.15 
 
 		 142 aa  103  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.19202  normal  0.743605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4825  CoA-binding domain-containing protein  49.61 
 
 		 130 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3183  CoA-binding domain protein  42.64 
 
 		 153 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3824  CoA-binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 150 aa  101  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3508  CoA-binding domain protein  42.31 
 
 		 154 aa  101  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0120178 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  44.53 
 
 		 139 aa  101  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  36.92 
 
 		 140 aa  101  9e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  39.1 
 
 		 140 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2525  hypothetical protein  40.85 
 
 		 139 aa  99.8  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.550629  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1014  CoA-binding domain protein  42.98 
 
 		 136 aa  99.4  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  44.44 
 
 		 134 aa  99.4  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  46.09 
 
 		 134 aa  99.4  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2827  hypothetical protein  35.38 
 
 		 133 aa  98.6  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0856697 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0530  CoA-binding domain-containing protein  39.04 
 
 		 164 aa  98.6  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  37.59 
 
 		 144 aa  98.6  5e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0272  CoA-binding domain protein  36.15 
 
 		 136 aa  98.6  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  42.54 
 
 		 135 aa  98.2  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02340  predicted CoA-binding protein  37.16 
 
 		 171 aa  97.8  8e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1048  CoA-binding domain-containing protein  39.55 
 
 		 139 aa  97.4  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.417839  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3193  CoA-binding domain protein  40.58 
 
 		 181 aa  95.5  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1948  CoA-binding domain-containing protein  38.3 
 
 		 151 aa  95.1  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0390  CoA-binding domain-containing protein  37.23 
 
 		 146 aa  94.7  7e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0747  CoA-binding  42.42 
 
 		 140 aa  93.2  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0309601  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0584  CoA-binding domain-containing protein  37.58 
 
 		 175 aa  93.2  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0982  CoA-binding domain-containing protein  41.84 
 
 		 136 aa  92  5e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.419448 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2085  CoA-binding domain protein  39.26 
 
 		 154 aa  91.7  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2396  CoA-binding  39.1 
 
 		 138 aa  91.7  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.972486  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1144  CoA-binding  38.17 
 
 		 142 aa  91.3  8e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1379  CoA-binding domain protein  35.37 
 
 		 161 aa  90.5  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  42.31 
 
 		 140 aa  89.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5544  CoA-binding domain protein  37.98 
 
 		 154 aa  90.1  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1672  CoA-binding protein  39.16 
 
 		 143 aa  89.4  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996781  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0160  CoA-binding protein  38.93 
 
 		 139 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0162  hypothetical protein  40.32 
 
 		 145 aa  89  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0169  CoA-binding domain-containing protein  38.93 
 
 		 139 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0150  CoA-binding domain-containing protein  38.93 
 
 		 139 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.100452 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1762  CoA-binding domain protein  38.76 
 
 		 140 aa  88.6  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.823906  normal  0.0190292 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>