196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2251 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2251  CoA-binding  100 
 
 
140 aa  273  6e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  57.14 
 
 
137 aa  151  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  52.24 
 
 
198 aa  145  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_50959  predicted protein  58.52 
 
 
146 aa  145  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2493  CoA-binding domain-containing protein  52.63 
 
 
152 aa  144  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.244493  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  52.99 
 
 
137 aa  143  9e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  51.49 
 
 
137 aa  141  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  53.38 
 
 
138 aa  140  8e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  53.38 
 
 
138 aa  140  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  56.06 
 
 
139 aa  140  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  53.38 
 
 
138 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2358  CoA-binding domain-containing protein  54.35 
 
 
138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  53.33 
 
 
137 aa  138  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  50 
 
 
137 aa  137  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  51.85 
 
 
137 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  52.59 
 
 
137 aa  135  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  52.59 
 
 
137 aa  135  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  51.85 
 
 
137 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  52.59 
 
 
137 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  52.59 
 
 
137 aa  135  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  52.59 
 
 
137 aa  135  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  52.59 
 
 
137 aa  135  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  51.85 
 
 
137 aa  134  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1875  CoA-binding domain protein  50.37 
 
 
147 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2075  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  56.39 
 
 
612 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.313252  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2836  CoA-binding domain-containing protein  55.97 
 
 
155 aa  125  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.758344  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  46.38 
 
 
144 aa  125  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2489  CoA-binding domain-containing protein  51.88 
 
 
193 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2712  CoA-binding domain protein  51.88 
 
 
193 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350227  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0145  CoA-binding domain protein  50.75 
 
 
181 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1328  CoA-binding domain protein  50.39 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0242548  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1687  hypothetical protein  47.06 
 
 
150 aa  118  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.863027  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2240  hypothetical protein  49.65 
 
 
148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394786  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2417  CoA-binding domain protein  50.38 
 
 
193 aa  117  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452114  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4615  CoA-binding domain-containing protein  50.75 
 
 
180 aa  117  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.305914  normal  0.0136961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1164  CoA-binding domain protein  52.59 
 
 
140 aa  117  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1166  CoA-binding  44.44 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365479  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4331  CoA-binding domain-containing protein  50 
 
 
182 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.282355 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0915  CoA-binding domain-containing protein  48.23 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.157936 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1241  CoA-binding domain protein  48.82 
 
 
142 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2574  hypothetical protein  48.55 
 
 
161 aa  114  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624453  hitchhiker  0.000000425683 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2254  CoA-binding domain-containing protein  49.62 
 
 
138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0324206  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3103  hypothetical protein  47.01 
 
 
194 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.210422  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2052  CoA-binding  46.67 
 
 
154 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5544  CoA-binding domain protein  50 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1177  CoA-binding domain-containing protein  50 
 
 
205 aa  111  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2704  CoA-binding  46.27 
 
 
194 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4595  hypothetical protein  46.62 
 
 
194 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2827  hypothetical protein  44.72 
 
 
133 aa  108  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0856697 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0866  CoA-binding domain-containing protein  49.22 
 
 
144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226245  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  46.09 
 
 
139 aa  107  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2457  CoA-binding  45.52 
 
 
194 aa  107  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.618512  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2668  CoA-binding  47.37 
 
 
194 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2693  CoA-binding  43.28 
 
 
180 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149948  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  49.28 
 
 
169 aa  105  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  51.47 
 
 
142 aa  105  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4799  CoA-binding domain protein  49.24 
 
 
137 aa  104  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  44.53 
 
 
134 aa  103  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  44.53 
 
 
134 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3824  CoA-binding domain-containing protein  49.19 
 
 
150 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  47.24 
 
 
149 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2545  hypothetical protein  43.7 
 
 
138 aa  101  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0160  CoA-binding protein  42.86 
 
 
139 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0169  CoA-binding domain-containing protein  42.86 
 
 
139 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1891  CoA-binding domain protein  51.61 
 
 
139 aa  101  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.272605 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  45.8 
 
 
139 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0985  CoA-binding domain protein  48.18 
 
 
152 aa  100  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4825  CoA-binding domain-containing protein  46.83 
 
 
130 aa  100  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2798  CoA-binding  45.19 
 
 
156 aa  99.4  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.254267  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0150  CoA-binding domain-containing protein  42.11 
 
 
139 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.100452 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1948  CoA-binding domain-containing protein  35.82 
 
 
151 aa  98.6  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02340  predicted CoA-binding protein  45.31 
 
 
171 aa  99.4  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0530  CoA-binding domain-containing protein  44.44 
 
 
164 aa  98.2  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1672  CoA-binding protein  48.8 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996781  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1388  CoA-binding domain-containing protein  40.31 
 
 
136 aa  95.9  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.555595  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1049  CoA-binding domain protein  35.07 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  43.33 
 
 
133 aa  94  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2004  CoA-binding domain protein  39.42 
 
 
135 aa  93.6  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3508  CoA-binding domain protein  38.73 
 
 
154 aa  93.6  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0120178 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0937  CoA-binding domain-containing protein  34.59 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.962686  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1048  CoA-binding domain-containing protein  41.67 
 
 
139 aa  92.8  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.417839  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3344  CoA-binding  41.04 
 
 
145 aa  92  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0272  CoA-binding domain protein  35.77 
 
 
136 aa  92  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1630  CoA-binding domain protein  41.94 
 
 
137 aa  91.7  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  33.58 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  39.1 
 
 
140 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  32.33 
 
 
140 aa  91.3  4e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3313  hypothetical protein  39.86 
 
 
153 aa  90.9  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  39.85 
 
 
134 aa  91.3  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1379  CoA-binding domain protein  40.94 
 
 
161 aa  90.9  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3183  CoA-binding domain protein  37.76 
 
 
153 aa  90.5  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1854  CoA-binding domain-containing protein  39.71 
 
 
138 aa  90.1  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0446458  normal  0.0146672 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0671  CoA-binding domain protein  46.92 
 
 
141 aa  89  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3436  CoA-binding domain protein  41.27 
 
 
180 aa  89.4  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  37.88 
 
 
135 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.122107 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2085  CoA-binding domain protein  39.23 
 
 
154 aa  87.8  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3063  CoA-binding  42.75 
 
 
162 aa  87.8  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0742  CoA-binding domain-containing protein  34.68 
 
 
159 aa  87.8  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000457668  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19320  predicted CoA-binding protein  40.48 
 
 
165 aa  87.4  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0866422  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4587  CoA-binding domain protein  39.23 
 
 
142 aa  87.4  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>