196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2827 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2827  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  271  3e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0856697 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0272  CoA-binding domain protein  68.46 
 
 		 136 aa  188  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1943  CoA-binding  45.19 
 
 		 142 aa  127  7.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.19202  normal  0.743605 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5334  CoA-binding protein  51.94 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2493  CoA-binding domain-containing protein  41.04 
 
 		 152 aa  114  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.244493  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2574  hypothetical protein  40.3 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624453  hitchhiker  0.000000425683 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0145  CoA-binding domain protein  43.28 
 
 		 181 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2052  CoA-binding  37.88 
 
 		 154 aa  107  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0216  CoA-binding domain-containing protein  51.88 
 
 		 148 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.583097  normal  0.123815 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1875  CoA-binding domain protein  40.15 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  42.15 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4615  CoA-binding domain-containing protein  41.04 
 
 		 180 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.305914  normal  0.0136961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2712  CoA-binding domain protein  41.67 
 
 		 193 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350227  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2489  CoA-binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 193 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  42.98 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4825  CoA-binding domain-containing protein  37.69 
 
 		 130 aa  103  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4331  CoA-binding domain-containing protein  40.15 
 
 		 182 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.282355 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0866  CoA-binding domain-containing protein  40.91 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226245  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  39.85 
 
 		 142 aa  100  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2417  CoA-binding domain protein  39.39 
 
 		 193 aa  100  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  40.98 
 
 		 138 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  40.98 
 
 		 138 aa  100  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2798  CoA-binding  39.39 
 
 		 156 aa  100  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.254267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  40.98 
 
 		 138 aa  100  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  43.94 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  40.5 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  40.5 
 
 		 137 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3103  hypothetical protein  36.15 
 
 		 194 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.210422  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  40.5 
 
 		 137 aa  98.6  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  38.1 
 
 		 134 aa  98.6  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1166  CoA-binding  41.18 
 
 		 145 aa  98.6  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365479  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  40.5 
 
 		 137 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1988  CoA-binding domain-containing protein  43.28 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370858  normal  0.185314 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  40.16 
 
 		 198 aa  99  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  40.5 
 
 		 137 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  40.5 
 
 		 137 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  39.67 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  40.16 
 
 		 137 aa  98.6  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  41.88 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  39.67 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  40.5 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1328  CoA-binding domain protein  41.35 
 
 		 142 aa  97.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0242548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2004  CoA-binding domain protein  43.51 
 
 		 135 aa  97.4  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  38.35 
 
 		 169 aa  97.4  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  38.1 
 
 		 134 aa  97.1  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1241  CoA-binding domain protein  40.6 
 
 		 142 aa  97.1  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  39.34 
 
 		 137 aa  95.9  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2704  CoA-binding  35.38 
 
 		 194 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_50959  predicted protein  40.16 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0211  CoA-binding protein  45.11 
 
 		 150 aa  94.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2251  CoA-binding  45 
 
 		 140 aa  94  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2693  CoA-binding  37.1 
 
 		 180 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0222  CoA-binding protein  44.36 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.388351  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  34.85 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1762  CoA-binding domain protein  41.98 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.823906  normal  0.0190292 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  38.28 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  37.7 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2254  CoA-binding domain-containing protein  40 
 
 		 138 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0324206  normal  0.212356 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2085  CoA-binding domain protein  35.34 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2240  hypothetical protein  40.77 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394786  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  38.4 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0687  CoA-binding domain-containing protein  38.93 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.44778  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1687  hypothetical protein  38.71 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.863027  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1014  CoA-binding domain protein  42.37 
 
 		 136 aa  90.9  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1672  CoA-binding protein  40.91 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996781  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  38.84 
 
 		 139 aa  90.9  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1177  CoA-binding domain-containing protein  37.96 
 
 		 205 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2668  CoA-binding  34.62 
 
 		 194 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0915  CoA-binding domain-containing protein  40 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.157936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0584  CoA-binding domain-containing protein  37.32 
 
 		 175 aa  90.5  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0199  CoA-binding protein  45.86 
 
 		 150 aa  90.1  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.267161  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3193  CoA-binding domain protein  42.75 
 
 		 181 aa  90.1  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2457  CoA-binding  35.38 
 
 		 194 aa  90.1  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.618512  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4595  hypothetical protein  34.09 
 
 		 194 aa  90.1  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1616  CoA-binding domain protein  37.8 
 
 		 139 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000180037  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3040  coenzyme A binding protein  39.39 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0801155 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0985  CoA-binding domain protein  34.92 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0390  CoA-binding domain-containing protein  36.43 
 
 		 146 aa  88.6  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2075  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  38.81 
 
 		 612 aa  89  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.313252  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1049  CoA-binding domain protein  32.06 
 
 		 138 aa  88.6  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0982  CoA-binding domain-containing protein  36.8 
 
 		 136 aa  88.6  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.419448 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1304  coenzyme A binding protein  34.59 
 
 		 136 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0160  CoA-binding protein  39.39 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0530  CoA-binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 164 aa  87.8  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0169  CoA-binding domain-containing protein  39.39 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3183  CoA-binding domain protein  38.17 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3508  CoA-binding domain protein  38.17 
 
 		 154 aa  87.8  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0120178 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0987  CoA-binding domain-containing protein  38.35 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2559  CoA-binding domain protein  37.8 
 
 		 139 aa  87.4  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  30.3 
 
 		 140 aa  87.4  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1048  CoA-binding domain-containing protein  34.35 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.417839  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0150  CoA-binding domain-containing protein  38.64 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.100452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  33.59 
 
 		 176 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  34.09 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2248  CoA-binding domain-containing protein  34.96 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000439003  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3313  hypothetical protein  35.77 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3286  CoA-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120452  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0162  hypothetical protein  34.38 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  34.59 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1948  CoA-binding domain-containing protein  37.82 
 
 		 151 aa  84  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>