197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2836 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2836  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 
155 aa  301  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.758344  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_50959  predicted protein  59.4 
 
 
146 aa  146  8e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  54.81 
 
 
137 aa  141  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  52.59 
 
 
137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  55.56 
 
 
137 aa  138  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  55.56 
 
 
137 aa  138  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  55.56 
 
 
137 aa  138  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  55.56 
 
 
137 aa  138  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  55.56 
 
 
137 aa  138  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  55.56 
 
 
137 aa  138  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  55.56 
 
 
137 aa  138  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  55.56 
 
 
137 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  54.81 
 
 
138 aa  137  7e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  54.81 
 
 
138 aa  137  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  54.81 
 
 
138 aa  137  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  54.81 
 
 
137 aa  136  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  54.81 
 
 
137 aa  136  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  51.11 
 
 
137 aa  135  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  60 
 
 
139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  50.37 
 
 
198 aa  130  6.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  50.37 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1328  CoA-binding domain protein  55.71 
 
 
142 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0242548  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1875  CoA-binding domain protein  52.48 
 
 
147 aa  127  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1241  CoA-binding domain protein  53.57 
 
 
142 aa  124  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2358  CoA-binding domain-containing protein  55.64 
 
 
138 aa  124  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2251  CoA-binding  55.97 
 
 
140 aa  122  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1177  CoA-binding domain-containing protein  59.42 
 
 
205 aa  121  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0145  CoA-binding domain protein  56.2 
 
 
181 aa  120  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2417  CoA-binding domain protein  56.2 
 
 
193 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452114  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2489  CoA-binding domain-containing protein  56.93 
 
 
193 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2712  CoA-binding domain protein  56.93 
 
 
193 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350227  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4615  CoA-binding domain-containing protein  55.47 
 
 
180 aa  117  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.305914  normal  0.0136961 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2254  CoA-binding domain-containing protein  51.45 
 
 
138 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0324206  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2493  CoA-binding domain-containing protein  49.25 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.244493  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3103  hypothetical protein  50.71 
 
 
194 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.210422  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4331  CoA-binding domain-containing protein  51.41 
 
 
182 aa  113  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.282355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4595  hypothetical protein  49.29 
 
 
194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1687  hypothetical protein  51.77 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.863027  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2457  CoA-binding  48.57 
 
 
194 aa  111  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.618512  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2668  CoA-binding  50.71 
 
 
194 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1948  CoA-binding domain-containing protein  40.44 
 
 
151 aa  110  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  49.23 
 
 
144 aa  110  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2704  CoA-binding  48.57 
 
 
194 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1166  CoA-binding  45.77 
 
 
145 aa  110  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365479  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2240  hypothetical protein  48.55 
 
 
148 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394786  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02340  predicted CoA-binding protein  52.71 
 
 
171 aa  105  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2693  CoA-binding  48.57 
 
 
180 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149948  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0915  CoA-binding domain-containing protein  47.1 
 
 
148 aa  103  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.157936 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3313  hypothetical protein  43.84 
 
 
153 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  43.18 
 
 
134 aa  102  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1630  CoA-binding domain protein  41.48 
 
 
137 aa  102  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2075  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  48.53 
 
 
612 aa  101  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.313252  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  48.87 
 
 
142 aa  100  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2052  CoA-binding  47.41 
 
 
154 aa  100  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1672  CoA-binding protein  51.72 
 
 
143 aa  100  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996781  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3508  CoA-binding domain protein  42.55 
 
 
154 aa  100  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0120178 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0866  CoA-binding domain-containing protein  49.65 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226245  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1684  hypothetical protein  50 
 
 
154 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  44.27 
 
 
139 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4825  CoA-binding domain-containing protein  46.03 
 
 
130 aa  99  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  43.07 
 
 
139 aa  98.6  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3183  CoA-binding domain protein  41.1 
 
 
153 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  39.85 
 
 
135 aa  98.2  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2798  CoA-binding  45.86 
 
 
156 aa  97.1  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.254267  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0584  CoA-binding domain-containing protein  44.44 
 
 
175 aa  96.7  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2574  hypothetical protein  50.38 
 
 
161 aa  96.3  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624453  hitchhiker  0.000000425683 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0079  CoA-binding domain protein  43.33 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  46.62 
 
 
169 aa  94.7  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  43.18 
 
 
176 aa  94.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4587  CoA-binding domain protein  39.1 
 
 
142 aa  93.6  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2525  hypothetical protein  40.58 
 
 
139 aa  93.2  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.550629  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5544  CoA-binding domain protein  43.65 
 
 
154 aa  91.3  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  43.2 
 
 
134 aa  91.3  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0982  CoA-binding domain-containing protein  38.41 
 
 
136 aa  90.9  5e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.419448 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3344  CoA-binding  40.15 
 
 
145 aa  90.5  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0742  CoA-binding domain-containing protein  32.64 
 
 
159 aa  90.1  9e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000457668  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  42.52 
 
 
134 aa  90.1  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3824  CoA-binding domain-containing protein  48.18 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3341  CoA-binding domain-containing protein  34.07 
 
 
140 aa  88.2  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125699  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  38.81 
 
 
140 aa  88.2  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  44.8 
 
 
140 aa  87.4  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  38.35 
 
 
140 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1616  CoA-binding domain protein  38.4 
 
 
139 aa  87  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000180037  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1943  CoA-binding  35.66 
 
 
142 aa  86.7  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.19202  normal  0.743605 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1562  CoA-binding domain-containing protein  35.25 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.477139  normal  0.0705808 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0162  hypothetical protein  40.16 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2827  hypothetical protein  39.06 
 
 
133 aa  85.9  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0856697 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3063  CoA-binding  44.78 
 
 
162 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  39.52 
 
 
133 aa  84.7  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0534  CoA-binding domain-containing protein  39.13 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563863  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0671  CoA-binding domain protein  43.41 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2559  CoA-binding domain protein  37.6 
 
 
139 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0747  CoA-binding  42.31 
 
 
140 aa  83.6  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0309601  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1672  CoA-binding domain-containing protein  29.32 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  32.88 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2085  CoA-binding domain protein  37.21 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0160  CoA-binding protein  42.52 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0169  CoA-binding domain-containing protein  42.52 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0989  CoA-binding domain protein  43 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  38.17 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>