180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2693 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2693  CoA-binding  100 
 
 		 180 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2668  CoA-binding  76.88 
 
 		 194 aa  264  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2704  CoA-binding  76.47 
 
 		 194 aa  262  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4595  hypothetical protein  75.29 
 
 		 194 aa  257  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3103  hypothetical protein  75.29 
 
 		 194 aa  257  6e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.210422  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2457  CoA-binding  78.24 
 
 		 194 aa  254  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.618512  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4331  CoA-binding domain-containing protein  59.43 
 
 		 182 aa  200  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.282355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0145  CoA-binding domain protein  60.61 
 
 		 181 aa  192  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4615  CoA-binding domain-containing protein  59.39 
 
 		 180 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.305914  normal  0.0136961 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2417  CoA-binding domain protein  56.36 
 
 		 193 aa  174  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2712  CoA-binding domain protein  55.76 
 
 		 193 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350227  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2489  CoA-binding domain-containing protein  55.76 
 
 		 193 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1177  CoA-binding domain-containing protein  53.55 
 
 		 205 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1328  CoA-binding domain protein  60.56 
 
 		 142 aa  154  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0242548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1241  CoA-binding domain protein  60.56 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1166  CoA-binding  51.72 
 
 		 145 aa  151  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365479  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2075  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  47.4 
 
 		 612 aa  143  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.313252  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1687  hypothetical protein  52.86 
 
 		 150 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.863027  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2574  hypothetical protein  50.62 
 
 		 161 aa  139  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624453  hitchhiker  0.000000425683 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2052  CoA-binding  50.66 
 
 		 154 aa  139  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  51.09 
 
 		 198 aa  138  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2493  CoA-binding domain-containing protein  51.49 
 
 		 152 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.244493  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0866  CoA-binding domain-containing protein  55.71 
 
 		 144 aa  136  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226245  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1875  CoA-binding domain protein  51.47 
 
 		 147 aa  135  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  50.75 
 
 		 137 aa  134  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  49.64 
 
 		 137 aa  134  7.000000000000001e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2798  CoA-binding  47.68 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.254267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  48.51 
 
 		 137 aa  127  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  45.99 
 
 		 137 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2358  CoA-binding domain-containing protein  50.75 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  47.06 
 
 		 138 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  47.06 
 
 		 138 aa  122  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  47.06 
 
 		 138 aa  121  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  54.55 
 
 		 139 aa  121  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2254  CoA-binding domain-containing protein  47.41 
 
 		 138 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0324206  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1684  hypothetical protein  51.82 
 
 		 154 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2240  hypothetical protein  48.18 
 
 		 148 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394786  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  47.37 
 
 		 137 aa  117  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  46.62 
 
 		 137 aa  117  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  46.62 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0915  CoA-binding domain-containing protein  47.45 
 
 		 148 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.157936 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  46.62 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  46.27 
 
 		 137 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  46.27 
 
 		 137 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  46.27 
 
 		 137 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  46.27 
 
 		 137 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  46.27 
 
 		 137 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  46.27 
 
 		 137 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3857  CoA-binding domain-containing protein  45.22 
 
 		 171 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.942746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3130  CoA-binding domain-containing protein  45.22 
 
 		 171 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_50959  predicted protein  49.25 
 
 		 146 aa  113  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  43.61 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3313  hypothetical protein  46.58 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  48.53 
 
 		 142 aa  108  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  48.53 
 
 		 169 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3183  CoA-binding domain protein  46.62 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5334  CoA-binding protein  43.09 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3508  CoA-binding domain protein  43.84 
 
 		 154 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0120178 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  41.91 
 
 		 149 aa  106  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  37.18 
 
 		 176 aa  104  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  41.79 
 
 		 139 aa  104  7e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3824  CoA-binding domain-containing protein  45.19 
 
 		 150 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2004  CoA-binding domain protein  41.79 
 
 		 135 aa  103  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4825  CoA-binding domain-containing protein  52.76 
 
 		 130 aa  102  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2340  CoA-binding domain protein  38 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  45.52 
 
 		 135 aa  99.4  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  40.88 
 
 		 140 aa  99.4  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2836  CoA-binding domain-containing protein  48.57 
 
 		 155 aa  99  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.758344  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1943  CoA-binding  39.2 
 
 		 142 aa  98.6  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.19202  normal  0.743605 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02340  predicted CoA-binding protein  39.19 
 
 		 171 aa  98.2  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2251  CoA-binding  43.28 
 
 		 140 aa  98.2  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0530  CoA-binding domain-containing protein  39.73 
 
 		 164 aa  98.2  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2525  hypothetical protein  40.71 
 
 		 139 aa  97.1  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.550629  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0272  CoA-binding domain protein  37.6 
 
 		 136 aa  97.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2827  hypothetical protein  37.1 
 
 		 133 aa  95.9  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0856697 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0584  CoA-binding domain-containing protein  40.94 
 
 		 175 aa  95.1  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  43.09 
 
 		 134 aa  93.6  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  36.64 
 
 		 140 aa  94  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1948  CoA-binding domain-containing protein  37.14 
 
 		 151 aa  92.8  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  43.09 
 
 		 134 aa  93.2  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  42.75 
 
 		 139 aa  92.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  40.74 
 
 		 134 aa  92  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1048  CoA-binding domain-containing protein  38.24 
 
 		 139 aa  92  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.417839  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1379  CoA-binding domain protein  36.73 
 
 		 161 aa  91.7  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  36.84 
 
 		 144 aa  91.3  6e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3363  CoA-binding domain protein  39.44 
 
 		 199 aa  90.9  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0719099  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3436  CoA-binding domain protein  36.73 
 
 		 180 aa  89.4  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3344  CoA-binding  38.41 
 
 		 145 aa  89.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0747  CoA-binding  40.44 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0309601  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  45.38 
 
 		 140 aa  89.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0160  CoA-binding protein  36.84 
 
 		 139 aa  89  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0169  CoA-binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 139 aa  89  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0150  CoA-binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 139 aa  89  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.100452 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0390  CoA-binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 146 aa  88.2  6e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1144  CoA-binding  34.81 
 
 		 142 aa  87.4  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  42.86 
 
 		 133 aa  87.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19320  predicted CoA-binding protein  34.69 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0866422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1988  CoA-binding domain-containing protein  37.59 
 
 		 140 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370858  normal  0.185314 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1049  CoA-binding domain protein  35.82 
 
 		 138 aa  85.9  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0687  CoA-binding domain-containing protein  33.58 
 
 		 138 aa  84.7  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.44778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>