228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2541 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  100 
 
 		 137 aa  274  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  94.89 
 
 		 137 aa  263  5.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  83.94 
 
 		 198 aa  238  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  80.29 
 
 		 137 aa  227  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  76.64 
 
 		 137 aa  218  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  77.37 
 
 		 138 aa  212  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  77.37 
 
 		 138 aa  211  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  77.37 
 
 		 138 aa  212  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  71.53 
 
 		 137 aa  204  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  70.8 
 
 		 137 aa  203  7e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  70.8 
 
 		 137 aa  203  7e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  70.8 
 
 		 137 aa  202  9e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  70.8 
 
 		 137 aa  202  9e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  70.8 
 
 		 137 aa  202  9e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  70.8 
 
 		 137 aa  202  9e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  70.8 
 
 		 137 aa  202  9e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  70.8 
 
 		 137 aa  202  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  70.07 
 
 		 137 aa  201  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  62.88 
 
 		 139 aa  160  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  60.77 
 
 		 144 aa  160  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_50959  predicted protein  57.04 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1875  CoA-binding domain protein  51.8 
 
 		 147 aa  146  8e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2358  CoA-binding domain-containing protein  57.14 
 
 		 138 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1948  CoA-binding domain-containing protein  47.41 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2493  CoA-binding domain-containing protein  51.49 
 
 		 152 aa  141  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.244493  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1166  CoA-binding  49.63 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365479  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1241  CoA-binding domain protein  55.64 
 
 		 142 aa  133  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4331  CoA-binding domain-containing protein  53.73 
 
 		 182 aa  133  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.282355 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1687  hypothetical protein  53.08 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.863027  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1328  CoA-binding domain protein  53.73 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0242548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0145  CoA-binding domain protein  51.09 
 
 		 181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3103  hypothetical protein  54.48 
 
 		 194 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.210422  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2075  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  50 
 
 		 612 aa  130  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.313252  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2668  CoA-binding  53.38 
 
 		 194 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4615  CoA-binding domain-containing protein  50.36 
 
 		 180 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.305914  normal  0.0136961 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2251  CoA-binding  51.49 
 
 		 140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  49.25 
 
 		 142 aa  128  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2693  CoA-binding  50.75 
 
 		 180 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2489  CoA-binding domain-containing protein  51.88 
 
 		 193 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2712  CoA-binding domain protein  51.88 
 
 		 193 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350227  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2704  CoA-binding  51.88 
 
 		 194 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  49.61 
 
 		 176 aa  126  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2574  hypothetical protein  50.75 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624453  hitchhiker  0.000000425683 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2836  CoA-binding domain-containing protein  52.59 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.758344  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  50.4 
 
 		 133 aa  124  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5544  CoA-binding domain protein  48.41 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2417  CoA-binding domain protein  50.38 
 
 		 193 aa  123  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  45.19 
 
 		 140 aa  123  9e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2254  CoA-binding domain-containing protein  47.83 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0324206  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4825  CoA-binding domain-containing protein  50.79 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  47.01 
 
 		 169 aa  120  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1177  CoA-binding domain-containing protein  47.83 
 
 		 205 aa  120  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02340  predicted CoA-binding protein  50.39 
 
 		 171 aa  120  7e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0866  CoA-binding domain-containing protein  53.38 
 
 		 144 aa  120  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226245  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  45.67 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2052  CoA-binding  47.01 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4595  hypothetical protein  48.12 
 
 		 194 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2457  CoA-binding  48.51 
 
 		 194 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.618512  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0162  hypothetical protein  47.29 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  47.11 
 
 		 134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  47.93 
 
 		 134 aa  116  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  52.34 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1388  CoA-binding domain-containing protein  48.39 
 
 		 136 aa  115  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.555595  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  45.45 
 
 		 139 aa  114  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0079  CoA-binding domain protein  46.21 
 
 		 145 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  42.65 
 
 		 140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  43.18 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0390  CoA-binding domain-containing protein  40.74 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1049  CoA-binding domain protein  41.67 
 
 		 138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2340  CoA-binding domain protein  43.51 
 
 		 179 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2240  hypothetical protein  43.48 
 
 		 148 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394786  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1672  CoA-binding protein  48.8 
 
 		 143 aa  110  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996781  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4587  CoA-binding domain protein  43.28 
 
 		 142 aa  110  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1144  CoA-binding  39.53 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3824  CoA-binding domain-containing protein  42.96 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  40.6 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0985  CoA-binding domain protein  47.11 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3286  CoA-binding domain-containing protein  45.24 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120452  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3341  CoA-binding domain-containing protein  45.19 
 
 		 140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3508  CoA-binding domain protein  41.48 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0120178 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3313  hypothetical protein  42.96 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1164  CoA-binding domain protein  47.69 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0530  CoA-binding domain-containing protein  50.39 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0915  CoA-binding domain-containing protein  42.03 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.157936 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2421  CoA-binding  50.82 
 
 		 130 aa  107  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000330878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3625  CoA binding domain family protein  45.24 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000648968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3618  CoA-binding domain-containing protein  45.24 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000227272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3394  CoA-binding domain-containing protein  45.24 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0763288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3306  CoA-binding domain-containing protein  45.24 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.007751  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3183  CoA-binding domain protein  42.52 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3659  CoA-binding domain-containing protein  45.24 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000120048  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0687  CoA-binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.44778  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3356  CoA-binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000642937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3610  CoA binding domain family protein  44.44 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5882599999999998e-27 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2248  CoA-binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000439003  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1854  CoA-binding domain-containing protein  44 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0446458  normal  0.0146672 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2396  CoA-binding  43.94 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.972486  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1608  CoA binding domain family protein  44.44 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000441527  hitchhiker  0.00000000000716402 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  45.3 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3707  CoA binding domain family protein  44.44 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000701886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>