205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2052 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_2052  CoA-binding  100 
 
 
154 aa  316  7e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2574  hypothetical protein  72.37 
 
 
161 aa  218  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624453  hitchhiker  0.000000425683 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2798  CoA-binding  70.39 
 
 
156 aa  192  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.254267  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2254  CoA-binding domain-containing protein  57.78 
 
 
138 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0324206  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4331  CoA-binding domain-containing protein  52.63 
 
 
182 aa  157  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.282355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0145  CoA-binding domain protein  55.26 
 
 
181 aa  154  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2240  hypothetical protein  56.3 
 
 
148 aa  151  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394786  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2075  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  50.97 
 
 
612 aa  150  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.313252  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2417  CoA-binding domain protein  53.95 
 
 
193 aa  150  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452114  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2489  CoA-binding domain-containing protein  54.61 
 
 
193 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2712  CoA-binding domain protein  54.61 
 
 
193 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350227  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0915  CoA-binding domain-containing protein  54.81 
 
 
148 aa  148  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.157936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4615  CoA-binding domain-containing protein  53.29 
 
 
180 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.305914  normal  0.0136961 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1177  CoA-binding domain-containing protein  50.96 
 
 
205 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3103  hypothetical protein  51.97 
 
 
194 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.210422  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2704  CoA-binding  51.32 
 
 
194 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2493  CoA-binding domain-containing protein  50.74 
 
 
152 aa  144  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.244493  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2668  CoA-binding  53.29 
 
 
194 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2693  CoA-binding  50.66 
 
 
180 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149948  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1875  CoA-binding domain protein  53.08 
 
 
147 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2457  CoA-binding  48.68 
 
 
194 aa  137  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.618512  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3824  CoA-binding domain-containing protein  55.88 
 
 
150 aa  137  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1166  CoA-binding  45.93 
 
 
145 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365479  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4595  hypothetical protein  47.37 
 
 
194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1241  CoA-binding domain protein  52.94 
 
 
142 aa  130  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  49.62 
 
 
137 aa  130  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1687  hypothetical protein  49.64 
 
 
150 aa  130  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.863027  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1328  CoA-binding domain protein  52.21 
 
 
142 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0242548  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  53.08 
 
 
139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  45.59 
 
 
198 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  47.01 
 
 
137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02340  predicted CoA-binding protein  45.58 
 
 
171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0866  CoA-binding domain-containing protein  51.09 
 
 
144 aa  125  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226245  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  47.76 
 
 
137 aa  124  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  47.01 
 
 
137 aa  123  9e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3857  CoA-binding domain-containing protein  48.1 
 
 
171 aa  123  9e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.942746  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3130  CoA-binding domain-containing protein  48.1 
 
 
171 aa  123  9e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0530  CoA-binding domain-containing protein  44.52 
 
 
164 aa  123  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  47.37 
 
 
137 aa  121  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  47.37 
 
 
137 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  47.37 
 
 
137 aa  121  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  47.37 
 
 
137 aa  121  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  47.37 
 
 
137 aa  121  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  47.37 
 
 
137 aa  121  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  46.62 
 
 
137 aa  120  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  46.62 
 
 
137 aa  120  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  46.62 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3436  CoA-binding domain protein  46.58 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  39.69 
 
 
140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  43.88 
 
 
140 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  48.03 
 
 
137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  45.11 
 
 
138 aa  116  9e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  45.11 
 
 
138 aa  116  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  45.11 
 
 
138 aa  116  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1379  CoA-binding domain protein  43.45 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_50959  predicted protein  49.25 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  43.8 
 
 
149 aa  115  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  44.93 
 
 
139 aa  114  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19320  predicted CoA-binding protein  42.07 
 
 
165 aa  114  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0866422  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  42.76 
 
 
176 aa  114  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  46.15 
 
 
133 aa  113  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2358  CoA-binding domain-containing protein  45.59 
 
 
138 aa  113  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  43.41 
 
 
144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  45.32 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  39.42 
 
 
144 aa  111  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1684  hypothetical protein  47.06 
 
 
154 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0272  CoA-binding domain protein  42.42 
 
 
136 aa  110  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0687  CoA-binding domain-containing protein  38.52 
 
 
138 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.44778  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  41.79 
 
 
139 aa  110  8.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2340  CoA-binding domain protein  39.86 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2827  hypothetical protein  37.88 
 
 
133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0856697 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3313  hypothetical protein  46.15 
 
 
153 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2004  CoA-binding domain protein  44.03 
 
 
135 aa  108  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4825  CoA-binding domain-containing protein  50 
 
 
130 aa  108  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  43.88 
 
 
169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  46.72 
 
 
134 aa  107  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  46.72 
 
 
134 aa  107  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1762  CoA-binding domain protein  43.61 
 
 
140 aa  107  7.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.823906  normal  0.0190292 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  43.18 
 
 
140 aa  107  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2396  CoA-binding  42.65 
 
 
138 aa  106  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.972486  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3183  CoA-binding domain protein  46.88 
 
 
153 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3508  CoA-binding domain protein  46.88 
 
 
154 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0120178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5334  CoA-binding protein  40.62 
 
 
144 aa  104  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2525  hypothetical protein  43.28 
 
 
139 aa  103  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.550629  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0390  CoA-binding domain-containing protein  37.68 
 
 
146 aa  103  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2421  CoA-binding  51.2 
 
 
130 aa  102  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000330878  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2545  hypothetical protein  42.42 
 
 
138 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2251  CoA-binding  44.44 
 
 
140 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  41.01 
 
 
151 aa  101  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  41.18 
 
 
134 aa  101  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0375  CoA-binding domain-containing protein  46.56 
 
 
154 aa  101  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  0.413983 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1943  CoA-binding  38.46 
 
 
142 aa  100  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.19202  normal  0.743605 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1672  CoA-binding protein  41.91 
 
 
143 aa  100  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996781  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5544  CoA-binding domain protein  40.31 
 
 
154 aa  100  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1948  CoA-binding domain-containing protein  37.59 
 
 
151 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0584  CoA-binding domain-containing protein  39.44 
 
 
175 aa  99.8  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4258  CoA-binding  43.41 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0162  hypothetical protein  41.09 
 
 
145 aa  100  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3363  CoA-binding domain protein  39.13 
 
 
199 aa  99.4  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0719099  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3344  CoA-binding  36.69 
 
 
145 aa  98.6  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>