213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1948 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1948  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 151 aa  310  2.9999999999999996e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  48.15 
 
 		 137 aa  144  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  47.41 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  44.44 
 
 		 137 aa  140  9e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  44.85 
 
 		 137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  44.85 
 
 		 137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  44.85 
 
 		 137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  44.85 
 
 		 137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  46.67 
 
 		 138 aa  137  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  46.67 
 
 		 138 aa  137  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  46.67 
 
 		 138 aa  137  4.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  44.12 
 
 		 137 aa  137  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  44.12 
 
 		 137 aa  137  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  44.12 
 
 		 137 aa  137  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  44.12 
 
 		 137 aa  137  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  44.12 
 
 		 137 aa  137  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  45.19 
 
 		 198 aa  137  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  45.19 
 
 		 137 aa  137  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  42.65 
 
 		 137 aa  136  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1687  hypothetical protein  47.14 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.863027  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2358  CoA-binding domain-containing protein  44.36 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2493  CoA-binding domain-containing protein  48.12 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.244493  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1166  CoA-binding  44.44 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365479  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  43.38 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1328  CoA-binding domain protein  47.14 
 
 		 142 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0242548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0866  CoA-binding domain-containing protein  45.71 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226245  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1241  CoA-binding domain protein  46.43 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1875  CoA-binding domain protein  42.75 
 
 		 147 aa  117  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4331  CoA-binding domain-containing protein  43.57 
 
 		 182 aa  113  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.282355 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2254  CoA-binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 138 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0324206  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_50959  predicted protein  41.54 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2489  CoA-binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 193 aa  110  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2712  CoA-binding domain protein  42.86 
 
 		 193 aa  110  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350227  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0145  CoA-binding domain protein  40.41 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2417  CoA-binding domain protein  42.14 
 
 		 193 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  38.93 
 
 		 140 aa  107  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4615  CoA-binding domain-containing protein  39.04 
 
 		 180 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.305914  normal  0.0136961 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1684  hypothetical protein  41.3 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  35.88 
 
 		 144 aa  105  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0162  hypothetical protein  37.98 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2240  hypothetical protein  39.57 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394786  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  37.59 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1177  CoA-binding domain-containing protein  40 
 
 		 205 aa  101  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 169 aa  100  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2836  CoA-binding domain-containing protein  40.44 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.758344  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2396  CoA-binding  39.68 
 
 		 138 aa  98.6  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.972486  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  36.29 
 
 		 139 aa  98.2  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0915  CoA-binding domain-containing protein  38.13 
 
 		 148 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.157936 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2075  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  38.3 
 
 		 612 aa  96.3  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.313252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2248  CoA-binding domain-containing protein  37.6 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000439003  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  37.3 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2052  CoA-binding  37.59 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2574  hypothetical protein  37.76 
 
 		 161 aa  94.7  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624453  hitchhiker  0.000000425683 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3824  CoA-binding domain-containing protein  36.3 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4595  hypothetical protein  36.43 
 
 		 194 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0390  CoA-binding domain-containing protein  36.8 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3286  CoA-binding domain-containing protein  36 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120452  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2668  CoA-binding  37.86 
 
 		 194 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2704  CoA-binding  38.3 
 
 		 194 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3103  hypothetical protein  38.57 
 
 		 194 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.210422  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1048  CoA-binding domain-containing protein  33.58 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.417839  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02340  predicted CoA-binding protein  34.09 
 
 		 171 aa  91.3  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3618  CoA-binding domain-containing protein  35.2 
 
 		 137 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000227272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3306  CoA-binding domain-containing protein  35.2 
 
 		 137 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.007751  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3625  CoA binding domain family protein  35.2 
 
 		 137 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000648968  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2251  CoA-binding  35.82 
 
 		 140 aa  90.9  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1608  CoA binding domain family protein  35.2 
 
 		 137 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000441527  hitchhiker  0.00000000000716402 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  37.9 
 
 		 140 aa  90.9  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3707  CoA binding domain family protein  35.2 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000701886  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3394  CoA-binding domain-containing protein  35.2 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0763288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3356  CoA-binding domain-containing protein  35.2 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000642937  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3659  CoA-binding domain-containing protein  35.2 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000120048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3610  CoA binding domain family protein  35.2 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5882599999999998e-27 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  39.71 
 
 		 140 aa  90.5  8e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2545  hypothetical protein  35.59 
 
 		 138 aa  90.1  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2693  CoA-binding  37.14 
 
 		 180 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2457  CoA-binding  37.86 
 
 		 194 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.618512  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0985  CoA-binding domain protein  34.45 
 
 		 152 aa  88.2  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0989  CoA-binding domain protein  39.02 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5544  CoA-binding domain protein  32.26 
 
 		 154 aa  87.8  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4825  CoA-binding domain-containing protein  34.68 
 
 		 130 aa  87.8  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2559  CoA-binding domain protein  34.38 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1672  CoA-binding protein  33.06 
 
 		 143 aa  86.7  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996781  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3341  CoA-binding domain-containing protein  32.37 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  33.86 
 
 		 176 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  30.43 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1388  CoA-binding domain-containing protein  30.53 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.555595  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  30.51 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1616  CoA-binding domain protein  33.6 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000180037  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3313  hypothetical protein  31.47 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  33.08 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  35 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2827  hypothetical protein  37.82 
 
 		 133 aa  84  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0856697 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2004  CoA-binding domain protein  31.3 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1421  CoA-binding domain-containing protein  30.71 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000954781  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4587  CoA-binding domain protein  30.83 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2421  CoA-binding  36.44 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000330878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  30.51 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3183  CoA-binding domain protein  32.17 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0079  CoA-binding domain protein  32.31 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>