223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0079 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0079  CoA-binding domain protein  100 
 
 
145 aa  289  1e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  48.92 
 
 
137 aa  120  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  47.66 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  46.21 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  47.66 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  47.66 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  47.66 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  47.66 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  47.66 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  47.66 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  46.88 
 
 
137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  45.38 
 
 
138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  46.88 
 
 
137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  45.38 
 
 
138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  45.38 
 
 
138 aa  114  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  46.21 
 
 
137 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  46.97 
 
 
137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  46.92 
 
 
137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  44.7 
 
 
198 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  46.51 
 
 
176 aa  103  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2340  CoA-binding domain protein  50.85 
 
 
179 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  39.17 
 
 
139 aa  100  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4587  CoA-binding domain protein  47.46 
 
 
142 aa  100  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  43.28 
 
 
151 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2493  CoA-binding domain-containing protein  42.97 
 
 
152 aa  96.3  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.244493  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2559  CoA-binding domain protein  41.18 
 
 
139 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  41.53 
 
 
133 aa  94.7  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3341  CoA-binding domain-containing protein  39.84 
 
 
140 aa  94  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125699  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19320  predicted CoA-binding protein  45.97 
 
 
165 aa  93.6  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0866422  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  46.46 
 
 
139 aa  93.2  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2421  CoA-binding  47.41 
 
 
130 aa  92.8  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000330878  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4258  CoA-binding  42.28 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1379  CoA-binding domain protein  45.97 
 
 
161 aa  93.2  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  40.88 
 
 
144 aa  92.8  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  40 
 
 
135 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2358  CoA-binding domain-containing protein  45.59 
 
 
138 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  44.44 
 
 
140 aa  91.3  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1616  CoA-binding domain protein  39.34 
 
 
139 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000180037  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0985  CoA-binding domain protein  40 
 
 
152 aa  90.9  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3436  CoA-binding domain protein  45.97 
 
 
180 aa  89.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0375  CoA-binding domain-containing protein  46.15 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  0.413983 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  40.17 
 
 
149 aa  90.1  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  39.26 
 
 
140 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4825  CoA-binding domain-containing protein  45.38 
 
 
130 aa  87.4  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1166  CoA-binding  41.73 
 
 
145 aa  87.4  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365479  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  35.38 
 
 
134 aa  87.4  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1672  CoA-binding protein  47.01 
 
 
143 aa  86.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996781  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_50959  predicted protein  43.85 
 
 
146 aa  85.5  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2396  CoA-binding  36.44 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.972486  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  39.83 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  41.94 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0728  CoA-binding domain-containing protein  44.17 
 
 
135 aa  85.5  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.298785 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1875  CoA-binding domain protein  41.04 
 
 
147 aa  84.7  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0584  CoA-binding domain-containing protein  42.03 
 
 
175 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0534  CoA-binding domain-containing protein  39.34 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563863  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1762  CoA-binding domain protein  41.43 
 
 
140 aa  84  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.823906  normal  0.0190292 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  38.98 
 
 
134 aa  83.6  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1630  CoA-binding domain protein  37.5 
 
 
137 aa  83.6  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0747  CoA-binding  43.44 
 
 
140 aa  83.6  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0309601  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  43.59 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  33.9 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3286  CoA-binding domain-containing protein  38.14 
 
 
137 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120452  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1948  CoA-binding domain-containing protein  32.31 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2248  CoA-binding domain-containing protein  40.68 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000439003  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2052  CoA-binding  38.35 
 
 
154 aa  82  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4331  CoA-binding domain-containing protein  45.45 
 
 
182 aa  82  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.282355 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2254  CoA-binding domain-containing protein  40.46 
 
 
138 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0324206  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2240  hypothetical protein  42.64 
 
 
148 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394786  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3183  CoA-binding domain protein  44.72 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3344  CoA-binding  38.97 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3508  CoA-binding domain protein  44.72 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0120178 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1687  hypothetical protein  41.32 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.863027  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0671  CoA-binding domain protein  36.72 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02340  predicted CoA-binding protein  40.58 
 
 
171 aa  80.9  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  45.9 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0160  CoA-binding protein  41.53 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1608  CoA binding domain family protein  37.29 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000441527  hitchhiker  0.00000000000716402 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0169  CoA-binding domain-containing protein  41.53 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  40.46 
 
 
169 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2836  CoA-binding domain-containing protein  43.33 
 
 
155 aa  80.5  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.758344  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0915  CoA-binding domain-containing protein  41.86 
 
 
148 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.157936 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3313  hypothetical protein  41.13 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3394  CoA-binding domain-containing protein  37.29 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0763288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3356  CoA-binding domain-containing protein  37.29 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000642937  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3306  CoA-binding domain-containing protein  37.29 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.007751  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3610  CoA binding domain family protein  37.29 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5882599999999998e-27 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3659  CoA-binding domain-containing protein  37.29 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000120048  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1891  CoA-binding domain protein  45.83 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.272605 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3707  CoA binding domain family protein  37.29 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000701886  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3618  CoA-binding domain-containing protein  37.29 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000227272  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1164  CoA-binding domain protein  46.85 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0150  CoA-binding domain-containing protein  40.68 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.100452 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4799  CoA-binding domain protein  42.06 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3625  CoA binding domain family protein  37.29 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000648968  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1328  CoA-binding domain protein  42.75 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0242548  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1388  CoA-binding domain-containing protein  36.97 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.555595  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0530  CoA-binding domain-containing protein  40.83 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3363  CoA-binding domain protein  42.34 
 
 
199 aa  77.8  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0719099  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1562  CoA-binding domain-containing protein  36.15 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.477139  normal  0.0705808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5544  CoA-binding domain protein  39.5 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>