190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3824 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3824  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 150 aa  302  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2240  hypothetical protein  57.35 
 
 		 148 aa  155  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394786  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0915  CoA-binding domain-containing protein  55.88 
 
 		 148 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.157936 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2254  CoA-binding domain-containing protein  55.15 
 
 		 138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0324206  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2052  CoA-binding  55.88 
 
 		 154 aa  139  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2574  hypothetical protein  51.37 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624453  hitchhiker  0.000000425683 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2493  CoA-binding domain-containing protein  45.64 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.244493  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1687  hypothetical protein  48.91 
 
 		 150 aa  121  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.863027  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2798  CoA-binding  47.86 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.254267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2421  CoA-binding  58.68 
 
 		 130 aa  116  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000330878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1241  CoA-binding domain protein  46.76 
 
 		 142 aa  116  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  42.96 
 
 		 137 aa  115  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1328  CoA-binding domain protein  47.06 
 
 		 142 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0242548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1166  CoA-binding  45.19 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365479  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  39.55 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0866  CoA-binding domain-containing protein  47.79 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226245  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  48.87 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1875  CoA-binding domain protein  47.01 
 
 		 147 aa  115  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0145  CoA-binding domain protein  50.39 
 
 		 181 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  45.19 
 
 		 137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2075  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  52.27 
 
 		 612 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.313252  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  45.19 
 
 		 137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  45.59 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  45.19 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  45.19 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  43.07 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  45.19 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  45.19 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  45.19 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  44.44 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  44.44 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  41.43 
 
 		 198 aa  110  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  42.96 
 
 		 137 aa  110  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  42.96 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2525  hypothetical protein  45.71 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.550629  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  48.8 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  42.96 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  42.96 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4331  CoA-binding domain-containing protein  44.14 
 
 		 182 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.282355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4615  CoA-binding domain-containing protein  49.61 
 
 		 180 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.305914  normal  0.0136961 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1177  CoA-binding domain-containing protein  50 
 
 		 205 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  43.61 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2693  CoA-binding  45.19 
 
 		 180 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1630  CoA-binding domain protein  44.44 
 
 		 137 aa  106  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2668  CoA-binding  45.19 
 
 		 194 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2704  CoA-binding  44.44 
 
 		 194 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  42.86 
 
 		 133 aa  105  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  40.71 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3508  CoA-binding domain protein  45.8 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0120178 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  44.36 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  47.2 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3183  CoA-binding domain protein  45.8 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4258  CoA-binding  43.75 
 
 		 143 aa  103  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3103  hypothetical protein  41.48 
 
 		 194 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.210422  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  44.6 
 
 		 139 aa  103  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3313  hypothetical protein  46.56 
 
 		 153 aa  102  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  42.96 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  39.13 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0966  CoA-binding domain protein  37.88 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2417  CoA-binding domain protein  45.93 
 
 		 193 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2004  CoA-binding domain protein  44.2 
 
 		 135 aa  100  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2712  CoA-binding domain protein  46.67 
 
 		 193 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350227  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2489  CoA-binding domain-containing protein  46.67 
 
 		 193 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3341  CoA-binding domain-containing protein  39.26 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125699  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1948  CoA-binding domain-containing protein  36.3 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2545  hypothetical protein  42.86 
 
 		 138 aa  98.6  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0375  CoA-binding domain-containing protein  44.36 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  0.413983 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2358  CoA-binding domain-containing protein  43.7 
 
 		 138 aa  98.2  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4595  hypothetical protein  42.22 
 
 		 194 aa  97.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0747  CoA-binding  42.42 
 
 		 140 aa  96.7  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0309601  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  40.28 
 
 		 140 aa  95.9  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2085  CoA-binding domain protein  37.88 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3344  CoA-binding  44.62 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2340  CoA-binding domain protein  46.21 
 
 		 179 aa  95.5  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5334  CoA-binding protein  42.4 
 
 		 144 aa  93.6  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2457  CoA-binding  40.74 
 
 		 194 aa  93.6  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.618512  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2251  CoA-binding  45.93 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1672  CoA-binding protein  40.44 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996781  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  42.03 
 
 		 169 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_50959  predicted protein  39.26 
 
 		 146 aa  91.7  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0160  CoA-binding protein  40.14 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0169  CoA-binding domain-containing protein  40.14 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0985  CoA-binding domain protein  45.24 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  42.03 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1379  CoA-binding domain protein  45.38 
 
 		 161 aa  90.9  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0584  CoA-binding domain-containing protein  38.06 
 
 		 175 aa  90.9  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02340  predicted CoA-binding protein  45.52 
 
 		 171 aa  90.5  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4825  CoA-binding domain-containing protein  44.19 
 
 		 130 aa  90.5  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0150  CoA-binding domain-containing protein  39.44 
 
 		 139 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.100452 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1144  CoA-binding  34.62 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  40 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1049  CoA-binding domain protein  31.62 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1421  CoA-binding domain-containing protein  36.57 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000954781  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  38.97 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1854  CoA-binding domain-containing protein  38.93 
 
 		 138 aa  88.2  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0446458  normal  0.0146672 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0687  CoA-binding domain-containing protein  33.09 
 
 		 138 aa  87.4  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.44778  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3436  CoA-binding domain protein  43.94 
 
 		 180 aa  87.4  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  33.58 
 
 		 537 aa  87.4  6e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>