188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0747 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0747  CoA-binding  100 
 
 		 140 aa  281  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0309601  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0375  CoA-binding domain-containing protein  64.89 
 
 		 154 aa  165  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  0.413983 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4258  CoA-binding  61.76 
 
 		 143 aa  161  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0584  CoA-binding domain-containing protein  58.74 
 
 		 175 aa  160  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  51.45 
 
 		 139 aa  140  6e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3857  CoA-binding domain-containing protein  57.35 
 
 		 171 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.942746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3130  CoA-binding domain-containing protein  57.35 
 
 		 171 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4825  CoA-binding domain-containing protein  56.15 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  49.24 
 
 		 140 aa  130  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  48.53 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3341  CoA-binding domain-containing protein  47.1 
 
 		 140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3344  CoA-binding  50.71 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  47.79 
 
 		 169 aa  122  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  48.09 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3508  CoA-binding domain protein  51.11 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0120178 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3183  CoA-binding domain protein  51.11 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  50.75 
 
 		 140 aa  121  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  47.79 
 
 		 140 aa  120  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3313  hypothetical protein  49.26 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  50 
 
 		 198 aa  115  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  47.73 
 
 		 134 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  45.45 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02340  predicted CoA-binding protein  49.22 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4587  CoA-binding domain protein  46.32 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  46.27 
 
 		 137 aa  114  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  46.27 
 
 		 137 aa  114  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  47.69 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  47.29 
 
 		 134 aa  114  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  43.18 
 
 		 151 aa  113  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  47.01 
 
 		 137 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  46.27 
 
 		 137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1630  CoA-binding domain protein  44.12 
 
 		 137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2340  CoA-binding domain protein  47.69 
 
 		 179 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3286  CoA-binding domain-containing protein  40.88 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120452  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  46.27 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  43.18 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  46.27 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  46.27 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  46.27 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  46.27 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3394  CoA-binding domain-containing protein  40.88 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0763288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3306  CoA-binding domain-containing protein  40.88 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.007751  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3659  CoA-binding domain-containing protein  40.88 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000120048  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  47.45 
 
 		 139 aa  111  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1048  CoA-binding domain-containing protein  43.08 
 
 		 139 aa  110  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.417839  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  46.97 
 
 		 137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3618  CoA-binding domain-containing protein  40.88 
 
 		 137 aa  110  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000227272  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  46.97 
 
 		 137 aa  110  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3625  CoA binding domain family protein  40.88 
 
 		 137 aa  110  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000648968  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  38.97 
 
 		 140 aa  110  5e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3356  CoA-binding domain-containing protein  40.15 
 
 		 137 aa  110  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000642937  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3707  CoA binding domain family protein  40.15 
 
 		 137 aa  110  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000701886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3610  CoA binding domain family protein  40.15 
 
 		 137 aa  110  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5882599999999998e-27 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1608  CoA binding domain family protein  40.15 
 
 		 137 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000441527  hitchhiker  0.00000000000716402 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  44.27 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2248  CoA-binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 137 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000439003  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2004  CoA-binding domain protein  44.85 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2421  CoA-binding  44.96 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000330878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  46.97 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2254  CoA-binding domain-containing protein  44.7 
 
 		 138 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0324206  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  47.66 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  46.97 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2240  hypothetical protein  43.07 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394786  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0530  CoA-binding domain-containing protein  46.51 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  41.98 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  46.97 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5544  CoA-binding domain protein  46.32 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0390  CoA-binding domain-containing protein  42.64 
 
 		 146 aa  107  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  43.18 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4799  CoA-binding domain protein  48.15 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  39.71 
 
 		 144 aa  107  6e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2525  hypothetical protein  40.6 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.550629  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  46.09 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1049  CoA-binding domain protein  39.26 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0915  CoA-binding domain-containing protein  41.61 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.157936 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0162  hypothetical protein  37.68 
 
 		 145 aa  103  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1762  CoA-binding domain protein  41.43 
 
 		 140 aa  103  9e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.823906  normal  0.0190292 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_50959  predicted protein  46.51 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1144  CoA-binding  40.88 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1672  CoA-binding protein  47.73 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996781  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0742  CoA-binding domain-containing protein  38.35 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000457668  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0728  CoA-binding domain-containing protein  44.78 
 
 		 135 aa  100  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.298785 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1875  CoA-binding domain protein  39.1 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0160  CoA-binding protein  42.22 
 
 		 139 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0169  CoA-binding domain-containing protein  42.22 
 
 		 139 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0150  CoA-binding domain-containing protein  42.22 
 
 		 139 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.100452 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2668  CoA-binding  41.04 
 
 		 194 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1379  CoA-binding domain protein  45.74 
 
 		 161 aa  99  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1616  CoA-binding domain protein  40 
 
 		 139 aa  98.6  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000180037  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19320  predicted CoA-binding protein  46.88 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0866422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3824  CoA-binding domain-containing protein  42.11 
 
 		 150 aa  99.4  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2704  CoA-binding  42.42 
 
 		 194 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2396  CoA-binding  37.5 
 
 		 138 aa  98.2  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.972486  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2559  CoA-binding domain protein  40.3 
 
 		 139 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2085  CoA-binding domain protein  32.62 
 
 		 154 aa  97.8  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3103  hypothetical protein  41.67 
 
 		 194 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.210422  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1687  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  97.8  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.863027  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1388  CoA-binding domain-containing protein  42.31 
 
 		 136 aa  97.1  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.555595  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2493  CoA-binding domain-containing protein  39.1 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.244493  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2798  CoA-binding  39.1 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.254267  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>