177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3857 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3857  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 
171 aa  351  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.942746  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3130  CoA-binding domain-containing protein  99.42 
 
 
171 aa  350  5.9999999999999994e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0584  CoA-binding domain-containing protein  73.43 
 
 
175 aa  201  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0747  CoA-binding  58.82 
 
 
140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0309601  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3344  CoA-binding  53.54 
 
 
145 aa  135  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0375  CoA-binding domain-containing protein  53.28 
 
 
154 aa  134  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  0.413983 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2340  CoA-binding domain protein  41.88 
 
 
179 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  46.31 
 
 
140 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  45.22 
 
 
176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4258  CoA-binding  51.49 
 
 
143 aa  132  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0530  CoA-binding domain-containing protein  46.91 
 
 
164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2075  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  47.98 
 
 
612 aa  131  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.313252  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2052  CoA-binding  48.1 
 
 
154 aa  129  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02340  predicted CoA-binding protein  46.41 
 
 
171 aa  128  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  45.39 
 
 
139 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3183  CoA-binding domain protein  50 
 
 
153 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3508  CoA-binding domain protein  49.66 
 
 
154 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0120178 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4331  CoA-binding domain-containing protein  44.72 
 
 
182 aa  124  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.282355 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2668  CoA-binding  46.5 
 
 
194 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2693  CoA-binding  45.86 
 
 
180 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149948  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3313  hypothetical protein  50.68 
 
 
153 aa  122  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  47.18 
 
 
142 aa  122  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2704  CoA-binding  44.17 
 
 
194 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  44.6 
 
 
134 aa  120  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4825  CoA-binding domain-containing protein  46.04 
 
 
130 aa  119  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  43.17 
 
 
134 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  46.98 
 
 
140 aa  117  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2254  CoA-binding domain-containing protein  46.15 
 
 
138 aa  117  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0324206  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3103  hypothetical protein  42.68 
 
 
194 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.210422  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1379  CoA-binding domain protein  44.44 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2798  CoA-binding  44.23 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.254267  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  47.48 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  40.29 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4595  hypothetical protein  44.59 
 
 
194 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  47.01 
 
 
137 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  47.01 
 
 
137 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  44.93 
 
 
169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2004  CoA-binding domain protein  43.36 
 
 
135 aa  114  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2574  hypothetical protein  42.33 
 
 
161 aa  114  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624453  hitchhiker  0.000000425683 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  47.01 
 
 
137 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2457  CoA-binding  44.03 
 
 
194 aa  114  7.999999999999999e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.618512  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  47.01 
 
 
137 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  47.01 
 
 
137 aa  114  8.999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  47.01 
 
 
137 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  47.01 
 
 
137 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  47.01 
 
 
137 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19320  predicted CoA-binding protein  43.14 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0866422  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  43.97 
 
 
144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0145  CoA-binding domain protein  44.59 
 
 
181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  47.76 
 
 
137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  41.29 
 
 
151 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4615  CoA-binding domain-containing protein  43.83 
 
 
180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.305914  normal  0.0136961 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  46.04 
 
 
198 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  43.17 
 
 
149 aa  112  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3436  CoA-binding domain protein  43.79 
 
 
180 aa  112  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  39.86 
 
 
139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2712  CoA-binding domain protein  44.85 
 
 
193 aa  111  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350227  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1177  CoA-binding domain-containing protein  44.85 
 
 
205 aa  111  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  46.04 
 
 
137 aa  111  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2489  CoA-binding domain-containing protein  44.85 
 
 
193 aa  111  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2421  CoA-binding  49.24 
 
 
130 aa  110  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000330878  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  46.27 
 
 
137 aa  111  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1630  CoA-binding domain protein  40.29 
 
 
137 aa  110  7.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  47.76 
 
 
137 aa  110  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  47.45 
 
 
139 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  45.32 
 
 
137 aa  108  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3341  CoA-binding domain-containing protein  43.7 
 
 
140 aa  108  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125699  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  36.69 
 
 
140 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2240  hypothetical protein  44.83 
 
 
148 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394786  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0985  CoA-binding domain protein  40.28 
 
 
152 aa  108  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  41.04 
 
 
133 aa  107  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2417  CoA-binding domain protein  43.64 
 
 
193 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452114  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5544  CoA-binding domain protein  42.86 
 
 
154 aa  107  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  37.84 
 
 
144 aa  107  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  45.93 
 
 
138 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  45.93 
 
 
138 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  45.93 
 
 
138 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1049  CoA-binding domain protein  36.88 
 
 
138 aa  105  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0915  CoA-binding domain-containing protein  43.45 
 
 
148 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.157936 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3618  CoA-binding domain-containing protein  39.31 
 
 
137 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000227272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3625  CoA binding domain family protein  39.31 
 
 
137 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000648968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3286  CoA-binding domain-containing protein  38.85 
 
 
137 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3394  CoA-binding domain-containing protein  39.57 
 
 
137 aa  101  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0763288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3306  CoA-binding domain-containing protein  39.57 
 
 
137 aa  101  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.007751  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3659  CoA-binding domain-containing protein  39.57 
 
 
137 aa  101  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000120048  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2525  hypothetical protein  38.36 
 
 
139 aa  100  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.550629  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0162  hypothetical protein  39.31 
 
 
145 aa  100  7e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2248  CoA-binding domain-containing protein  40.28 
 
 
137 aa  100  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000439003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1608  CoA binding domain family protein  38.85 
 
 
137 aa  100  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000441527  hitchhiker  0.00000000000716402 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3356  CoA-binding domain-containing protein  38.85 
 
 
137 aa  100  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000642937  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1672  CoA-binding protein  44.76 
 
 
143 aa  100  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3610  CoA binding domain family protein  38.85 
 
 
137 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5882599999999998e-27 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1762  CoA-binding domain protein  40.28 
 
 
140 aa  100  9e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.823906  normal  0.0190292 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3707  CoA binding domain family protein  38.85 
 
 
137 aa  100  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000701886  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  35.25 
 
 
134 aa  100  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1166  CoA-binding  39.73 
 
 
145 aa  99.4  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365479  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1616  CoA-binding domain protein  36.5 
 
 
139 aa  99.4  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000180037  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3965  CoA-binding protein  55.34 
 
 
113 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3351  CoA-binding domain-containing protein  53.4 
 
 
104 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1582  hypothetical protein  53.4 
 
 
104 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>