181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0534 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0534  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 
141 aa  286  7e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563863  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0671  CoA-binding domain protein  77.3 
 
 
141 aa  221  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1164  CoA-binding domain protein  56.03 
 
 
140 aa  143  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1891  CoA-binding domain protein  57.14 
 
 
139 aa  127  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.272605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1854  CoA-binding domain-containing protein  49.63 
 
 
138 aa  116  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0446458  normal  0.0146672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2545  hypothetical protein  46.32 
 
 
138 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3063  CoA-binding  45.32 
 
 
162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1388  CoA-binding domain-containing protein  43.48 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.555595  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5544  CoA-binding domain protein  46.46 
 
 
154 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  44.2 
 
 
139 aa  99.4  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4117  CoA-binding domain protein  50 
 
 
139 aa  98.6  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  41.73 
 
 
176 aa  98.2  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  38.1 
 
 
134 aa  96.3  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  38.13 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  39.69 
 
 
137 aa  94  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4258  CoA-binding  43.18 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  38.1 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  40.46 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  40.46 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2358  CoA-binding domain-containing protein  48.85 
 
 
138 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  40.3 
 
 
137 aa  92  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  40.46 
 
 
137 aa  92  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0985  CoA-binding domain protein  46.15 
 
 
152 aa  91.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  40.3 
 
 
137 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  39.69 
 
 
137 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  39.69 
 
 
137 aa  90.5  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  39.69 
 
 
137 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  39.69 
 
 
137 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  39.69 
 
 
137 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2340  CoA-binding domain protein  37.8 
 
 
179 aa  89.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4825  CoA-binding domain-containing protein  44.72 
 
 
130 aa  89.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  38.93 
 
 
137 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  39.69 
 
 
133 aa  89  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  40.6 
 
 
140 aa  89.4  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  38.93 
 
 
137 aa  89.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  43.7 
 
 
151 aa  88.6  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  39.55 
 
 
137 aa  87.8  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  35.77 
 
 
140 aa  87.8  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0375  CoA-binding domain-containing protein  41.22 
 
 
154 aa  87.4  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  0.413983 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  43.1 
 
 
135 aa  87  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_50959  predicted protein  39.16 
 
 
146 aa  87  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  40 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  40 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  42.55 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  40 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  40 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0079  CoA-binding domain protein  39.34 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2075  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.73 
 
 
612 aa  84.7  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.313252  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4587  CoA-binding domain protein  38.3 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  38.81 
 
 
198 aa  84  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3508  CoA-binding domain protein  36.3 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0120178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0530  CoA-binding domain-containing protein  37.21 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2421  CoA-binding  44.07 
 
 
130 aa  82.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000330878  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2004  CoA-binding domain protein  38.52 
 
 
135 aa  82  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  41.04 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1875  CoA-binding domain protein  35.29 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3313  hypothetical protein  36.3 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4799  CoA-binding domain protein  40.91 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  33.08 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  35.38 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  34.35 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0728  CoA-binding domain-containing protein  37.4 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.298785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3183  CoA-binding domain protein  35.62 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3341  CoA-binding domain-containing protein  34.53 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125699  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0160  CoA-binding protein  37.7 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0169  CoA-binding domain-containing protein  37.7 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1630  CoA-binding domain protein  34.92 
 
 
137 aa  77  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0150  CoA-binding domain-containing protein  36.89 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.100452 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  42.22 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2085  CoA-binding domain protein  30.22 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19320  predicted CoA-binding protein  36.97 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0866422  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4615  CoA-binding domain-containing protein  37.4 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.305914  normal  0.0136961 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2525  hypothetical protein  33.57 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.550629  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1379  CoA-binding domain protein  35.43 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1328  CoA-binding domain protein  41.67 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0242548  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  33.61 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4331  CoA-binding domain-containing protein  39.86 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.282355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0584  CoA-binding domain-containing protein  35.1 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0145  CoA-binding domain protein  36.64 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2240  hypothetical protein  36.03 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394786  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0747  CoA-binding  42.06 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0309601  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1762  CoA-binding domain protein  35.46 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.823906  normal  0.0190292 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0989  CoA-binding domain protein  33.83 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1241  CoA-binding domain protein  39.69 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2836  CoA-binding domain-containing protein  39.13 
 
 
155 aa  72  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.758344  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1177  CoA-binding domain-containing protein  39.58 
 
 
205 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2254  CoA-binding domain-containing protein  35.29 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0324206  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3193  CoA-binding domain protein  33.85 
 
 
181 aa  70.9  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3363  CoA-binding domain protein  35.14 
 
 
199 aa  70.9  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0719099  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2493  CoA-binding domain-containing protein  34.07 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.244493  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1144  CoA-binding  31.71 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  28.57 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1687  hypothetical protein  37.4 
 
 
150 aa  70.1  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.863027  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2052  CoA-binding  36.69 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1166  CoA-binding  33.09 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365479  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02340  predicted CoA-binding protein  33.59 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3436  CoA-binding domain protein  34.45 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1948  CoA-binding domain-containing protein  28.57 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0742  CoA-binding domain-containing protein  28.69 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000457668  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0915  CoA-binding domain-containing protein  34.56 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.157936 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>