More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2077 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2077  CoA-binding protein  100 
 
 		 126 aa  255  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1777  CoA-binding domain protein  68.03 
 
 		 124 aa  176  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0652  CoA-binding domain protein  55 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000133994  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1445  CoA-binding domain-containing protein  50.42 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1015  CoA-binding domain protein  47.46 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2600  CoA-binding domain protein  38.66 
 
 		 130 aa  110  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00073882  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0658  CoA-binding domain-containing protein  37.19 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00210865  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1284  CoA-binding domain-containing protein  45.69 
 
 		 124 aa  94.4  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1327  CoA-binding domain-containing protein  39.64 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000352253  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1655  CoA-binding protein  35.83 
 
 		 134 aa  88.2  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000297514  normal  0.67582 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0758  CoA-binding domain-containing protein  38.05 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4017  CoA-binding domain-containing protein  33.61 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00796943  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1359  CoA-binding domain-containing protein  40.54 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00343617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1828  hypothetical protein  34.96 
 
 		 122 aa  84  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1614  CoA-binding protein  32.79 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0560  CoA-binding domain protein  37.61 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.89222  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1548  hypothetical protein  34.96 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16153  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0651  CoA-binding domain-containing protein  40.21 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0989  CoA-binding domain protein  35.9 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0217  CoA-binding protein  31.97 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  36.84 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1049  CoA-binding domain protein  36.11 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  42.48 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0742  CoA-binding domain-containing protein  37.17 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000457668  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0669  hypothetical protein  32.79 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1891  CoA-binding domain protein  31.03 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.272605 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0653  hypothetical protein  31.97 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3507  CoA-binding domain-containing protein  33.06 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684153  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  36.11 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  34.95 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  34.95 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2340  CoA-binding domain protein  31.9 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  35.14 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0624  CoA-binding domain protein  30.33 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  40.91 
 
 		 697 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  34.26 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  31.4 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3341  CoA-binding domain-containing protein  29.63 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0966  CoA-binding domain protein  30.09 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  35.45 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0985  CoA-binding domain protein  36.84 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0530  CoA-binding domain-containing protein  34.48 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  36.11 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  37.5 
 
 		 704 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0937  CoA-binding domain-containing protein  31.3 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.962686  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  39.53 
 
 		 702 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1630  CoA-binding domain protein  35.09 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  31.19 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0607  CoA-binding protein  29.57 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  37.08 
 
 		 905 aa  66.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4587  CoA-binding domain protein  33.04 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  35.85 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  41.25 
 
 		 697 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  33.04 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0728  CoA-binding domain-containing protein  27.12 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.298785 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1672  CoA-binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3313  hypothetical protein  32.8 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  35.24 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  35.24 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  35.24 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  35.24 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3341  CoA-binding domain-containing protein  29.17 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  32.14 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  32.8 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1379  CoA-binding domain protein  34.86 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5544  CoA-binding domain protein  27.27 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0160  CoA-binding protein  34.23 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  37.89 
 
 		 695 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0169  CoA-binding domain-containing protein  34.23 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  37.89 
 
 		 695 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  32.2 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  34.29 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  34.29 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  34.29 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  34.29 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  34.29 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0290  CoA-binding domain-containing protein  45.05 
 
 		 461 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.388357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  34.29 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0982  CoA-binding domain-containing protein  33.9 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.419448 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  34.48 
 
 		 700 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  30 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  40.66 
 
 		 704 aa  63.2  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2421  CoA-binding  32.38 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000330878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3063  CoA-binding  31.58 
 
 		 162 aa  62  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0150  CoA-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.100452 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2396  CoA-binding  31.86 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.972486  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0687  CoA-binding domain-containing protein  30 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.44778  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1854  CoA-binding domain-containing protein  29.82 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0446458  normal  0.0146672 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7090  hypothetical protein  32.2 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  35.45 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0725  CoA-binding domain-containing protein  32.17 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000455945 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  32.46 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3286  CoA-binding domain-containing protein  30.33 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120452  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02340  predicted CoA-binding protein  33.63 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3508  CoA-binding domain protein  31.97 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0120178 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  32 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0987  CoA-binding domain-containing protein  30.7 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2248  CoA-binding domain-containing protein  31.15 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000439003  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3494  CoA-binding domain-containing protein  26.98 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.965482  normal  0.549268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>