118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3341 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3341  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 
155 aa  319  9.000000000000001e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3494  CoA-binding domain-containing protein  42.52 
 
 
159 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.965482  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0652  CoA-binding domain protein  34.56 
 
 
131 aa  90.5  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000133994  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0995  CoA-binding protein  38.52 
 
 
159 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2600  CoA-binding domain protein  36.51 
 
 
130 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00073882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1056  CoA-binding domain protein  40.8 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2077  CoA-binding protein  29.63 
 
 
126 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0669  hypothetical protein  35.77 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1655  CoA-binding protein  32.26 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000297514  normal  0.67582 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0653  hypothetical protein  35.77 
 
 
133 aa  67  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1052  CoA-binding domain protein  40 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256788  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4017  CoA-binding domain-containing protein  31.2 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00796943  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0985  CoA-binding domain protein  30.4 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1777  CoA-binding domain protein  31.91 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1015  CoA-binding domain protein  28.23 
 
 
131 aa  63.5  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1614  CoA-binding protein  31.45 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  30.16 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  29.6 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0658  CoA-binding domain-containing protein  29.47 
 
 
125 aa  58.2  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00210865  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  28.45 
 
 
134 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0217  CoA-binding protein  31.45 
 
 
134 aa  57.4  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  29.6 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1327  CoA-binding domain-containing protein  27.37 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000352253  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  27.27 
 
 
135 aa  57  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  28.33 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  27.13 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1359  CoA-binding domain-containing protein  27.37 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00343617  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2085  CoA-binding domain protein  28.23 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  24.17 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0624  CoA-binding domain protein  31.97 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  32.32 
 
 
140 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  25.64 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0742  CoA-binding domain-containing protein  25.66 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000457668  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2559  CoA-binding domain protein  29.57 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0966  CoA-binding domain protein  23.01 
 
 
129 aa  52  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3507  CoA-binding domain-containing protein  30.08 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684153  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1445  CoA-binding domain-containing protein  28.57 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1616  CoA-binding domain protein  27.78 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000180037  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  23.89 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0728  CoA-binding domain-containing protein  29.2 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.298785 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3363  CoA-binding domain protein  28.95 
 
 
199 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0719099  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0725  CoA-binding domain-containing protein  25.62 
 
 
139 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000455945 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  27.64 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  28.85 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  23.81 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3193  CoA-binding domain protein  31.54 
 
 
181 aa  48.9  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1630  CoA-binding domain protein  27.42 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2340  CoA-binding domain protein  27.96 
 
 
179 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0987  CoA-binding domain-containing protein  28.35 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1854  CoA-binding domain-containing protein  29.03 
 
 
138 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0446458  normal  0.0146672 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  30.08 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  28.71 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  30.93 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4587  CoA-binding domain protein  26.4 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5544  CoA-binding domain protein  31.45 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1828  hypothetical protein  26.67 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3341  CoA-binding domain-containing protein  25.84 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125699  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3286  CoA-binding domain-containing protein  27.87 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120452  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0079  CoA-binding domain protein  27.73 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  24.04 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3394  CoA-binding domain-containing protein  27.05 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0763288  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  27.17 
 
 
905 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0560  CoA-binding domain protein  25.74 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.89222  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3659  CoA-binding domain-containing protein  27.05 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000120048  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0982  CoA-binding domain-containing protein  27.64 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.419448 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1875  CoA-binding domain protein  30.51 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3618  CoA-binding domain-containing protein  27.05 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000227272  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3356  CoA-binding domain-containing protein  27.05 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000642937  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3306  CoA-binding domain-containing protein  27.05 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.007751  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3625  CoA binding domain family protein  27.05 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000648968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3707  CoA binding domain family protein  27.05 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000701886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3610  CoA binding domain family protein  27.05 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5882599999999998e-27 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1548  hypothetical protein  25.83 
 
 
122 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16153  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1379  CoA-binding domain protein  25 
 
 
161 aa  44.3  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  28.74 
 
 
176 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0554  CoA-binding domain-containing protein  29.13 
 
 
689 aa  43.9  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.794682  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  23.85 
 
 
692 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  22.88 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2560  CoA-binding domain-containing protein  27.64 
 
 
803 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545534 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0829  CoA-binding domain-containing protein  29.79 
 
 
766 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  30.59 
 
 
715 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0687  CoA-binding domain-containing protein  28.35 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.44778  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1562  CoA-binding domain-containing protein  23.31 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.477139  normal  0.0705808 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3774  CoA-binding domain protein  28.03 
 
 
714 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1014  CoA-binding domain protein  30.77 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1608  CoA binding domain family protein  26.23 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000441527  hitchhiker  0.00000000000716402 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  24.79 
 
 
137 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  30.38 
 
 
707 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  24.79 
 
 
137 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  23.44 
 
 
711 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0651  CoA-binding domain-containing protein  24.73 
 
 
145 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0607  CoA-binding protein  27.59 
 
 
136 aa  42  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3436  CoA-binding domain protein  24.78 
 
 
180 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  24.79 
 
 
137 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  26.47 
 
 
711 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2525  hypothetical protein  25.66 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.550629  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1309  CoA-binding domain-containing protein  26.52 
 
 
705 aa  41.6  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000175905 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  28.57 
 
 
700 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1164  CoA-binding domain protein  30 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  24.79 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>