48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1548 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1548  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  241  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16153  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1828  hypothetical protein  94.26 
 
 		 122 aa  232  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1015  CoA-binding domain protein  38.02 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2077  CoA-binding protein  34.96 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1445  CoA-binding domain-containing protein  36.44 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2600  CoA-binding domain protein  34.68 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00073882  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0652  CoA-binding domain protein  34.75 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000133994  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1777  CoA-binding domain protein  32.52 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0651  CoA-binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0758  CoA-binding domain-containing protein  34.45 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1327  CoA-binding domain-containing protein  34.75 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000352253  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1284  CoA-binding domain-containing protein  32.5 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4017  CoA-binding domain-containing protein  29.6 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00796943  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1359  CoA-binding domain-containing protein  33.9 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00343617  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0658  CoA-binding domain-containing protein  28.71 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00210865  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5064  hypothetical protein  26.96 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939937  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0669  hypothetical protein  30.51 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0653  hypothetical protein  29.66 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0363  hypothetical protein  26.32 
 
 		 122 aa  50.4  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3494  CoA-binding domain-containing protein  25.64 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.965482  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3600  hypothetical protein  29.57 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1412  hypothetical protein  27.83 
 
 		 119 aa  50.1  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1614  CoA-binding protein  27.64 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0989  CoA-binding domain protein  28.69 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7090  hypothetical protein  24.79 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0560  CoA-binding domain protein  22.52 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.89222  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0698  hypothetical protein  23.68 
 
 		 128 aa  47.8  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000671001  normal  0.0854698 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1388  CoA-binding domain-containing protein  24.17 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.555595  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0624  CoA-binding domain protein  27.87 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1655  CoA-binding protein  26.67 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000297514  normal  0.67582 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1209  CoA-binding domain-containing protein  26.45 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0019  hypothetical protein  22.73 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.816073  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  25.83 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1009  CoA-binding domain-containing protein  26.05 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3063  CoA-binding  27.17 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3507  CoA-binding domain-containing protein  25.83 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684153  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3341  CoA-binding domain-containing protein  25.83 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3018  hypothetical protein  28.45 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1854  CoA-binding domain-containing protein  28.89 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0446458  normal  0.0146672 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  21.85 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1056  CoA-binding domain protein  26.96 
 
 		 159 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0217  CoA-binding protein  25.2 
 
 		 134 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  24.79 
 
 		 137 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0966  CoA-binding domain protein  23.93 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0687  CoA-binding domain-containing protein  23.91 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.44778  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1164  CoA-binding domain protein  27.91 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  24.58 
 
 		 144 aa  40.4  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1891  CoA-binding domain protein  21.93 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.272605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>