18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3018 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3018  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  251  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1412  hypothetical protein  55.46 
 
 
119 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07570  hypothetical protein  51.69 
 
 
120 aa  125  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5064  hypothetical protein  49.58 
 
 
119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939937  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3600  hypothetical protein  48.74 
 
 
119 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265041  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7090  hypothetical protein  41.53 
 
 
122 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296196  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0363  hypothetical protein  44.07 
 
 
122 aa  101  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0698  hypothetical protein  37.72 
 
 
128 aa  87  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000671001  normal  0.0854698 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0019  hypothetical protein  36.29 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.816073  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2880  hypothetical protein  39.83 
 
 
121 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.476591  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0560  CoA-binding domain protein  33.33 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.89222  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0607  CoA-binding protein  31.4 
 
 
136 aa  50.4  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1015  CoA-binding domain protein  29.66 
 
 
131 aa  50.1  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0742  CoA-binding domain-containing protein  27.59 
 
 
159 aa  48.9  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000457668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2077  CoA-binding protein  25.45 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1828  hypothetical protein  28.45 
 
 
122 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1548  hypothetical protein  28.45 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16153  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1327  CoA-binding domain-containing protein  29.66 
 
 
131 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000352253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>