24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1412 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1412  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  240  6e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5064  hypothetical protein  57.14 
 
 
119 aa  141  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939937  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3600  hypothetical protein  57.98 
 
 
119 aa  133  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265041  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3018  hypothetical protein  55.46 
 
 
123 aa  131  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7090  hypothetical protein  49.15 
 
 
122 aa  126  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296196  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0363  hypothetical protein  50 
 
 
122 aa  121  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07570  hypothetical protein  48.31 
 
 
120 aa  110  9e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0019  hypothetical protein  45.45 
 
 
124 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.816073  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0698  hypothetical protein  41.18 
 
 
128 aa  98.2  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000671001  normal  0.0854698 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2880  hypothetical protein  43.8 
 
 
121 aa  96.7  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.476591  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0560  CoA-binding domain protein  30.56 
 
 
129 aa  61.2  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.89222  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1828  hypothetical protein  30.43 
 
 
122 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1015  CoA-binding domain protein  27.87 
 
 
131 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1548  hypothetical protein  27.83 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16153  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0272  CoA-binding domain protein  30.77 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0607  CoA-binding protein  31.97 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2077  CoA-binding protein  24.55 
 
 
126 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1284  CoA-binding domain-containing protein  25 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1327  CoA-binding domain-containing protein  26.92 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000352253  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2827  hypothetical protein  25.89 
 
 
133 aa  41.6  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0856697 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0758  CoA-binding domain-containing protein  24.3 
 
 
123 aa  40.8  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1445  CoA-binding domain-containing protein  34.75 
 
 
136 aa  40.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0651  CoA-binding domain-containing protein  25.83 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0742  CoA-binding domain-containing protein  26.72 
 
 
159 aa  40  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000457668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>