17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3600 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3600  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  242  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265041  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7090  hypothetical protein  52.54 
 
 
122 aa  143  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296196  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1412  hypothetical protein  57.98 
 
 
119 aa  133  8e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5064  hypothetical protein  52.1 
 
 
119 aa  131  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939937  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0363  hypothetical protein  52.54 
 
 
122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07570  hypothetical protein  51.69 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3018  hypothetical protein  48.74 
 
 
123 aa  113  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0019  hypothetical protein  37.6 
 
 
124 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.816073  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2880  hypothetical protein  37.39 
 
 
121 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.476591  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0698  hypothetical protein  30.25 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000671001  normal  0.0854698 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1015  CoA-binding domain protein  28.21 
 
 
131 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1828  hypothetical protein  29.57 
 
 
122 aa  50.8  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1548  hypothetical protein  29.57 
 
 
122 aa  50.4  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16153  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2077  CoA-binding protein  27.27 
 
 
126 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0758  CoA-binding domain-containing protein  21.05 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0560  CoA-binding domain protein  22.41 
 
 
129 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.89222  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1327  CoA-binding domain-containing protein  24.79 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000352253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>