65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1828 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1828  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  241  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1548  hypothetical protein  94.26 
 
 
122 aa  232  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16153  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1015  CoA-binding domain protein  38.02 
 
 
131 aa  91.7  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1445  CoA-binding domain-containing protein  38.98 
 
 
136 aa  87  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2077  CoA-binding protein  34.96 
 
 
126 aa  84  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2600  CoA-binding domain protein  35.48 
 
 
130 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00073882  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0652  CoA-binding domain protein  35.59 
 
 
131 aa  77.4  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000133994  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1777  CoA-binding domain protein  32.52 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4017  CoA-binding domain-containing protein  31.2 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00796943  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1284  CoA-binding domain-containing protein  32.5 
 
 
124 aa  63.5  0.0000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0651  CoA-binding domain-containing protein  30.65 
 
 
145 aa  60.8  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0758  CoA-binding domain-containing protein  33.61 
 
 
123 aa  60.8  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1327  CoA-binding domain-containing protein  33.05 
 
 
131 aa  60.1  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000352253  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0658  CoA-binding domain-containing protein  28.21 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00210865  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1359  CoA-binding domain-containing protein  32.2 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00343617  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1412  hypothetical protein  30.43 
 
 
119 aa  55.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0669  hypothetical protein  29.66 
 
 
133 aa  54.7  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7090  hypothetical protein  24.79 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296196  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1614  CoA-binding protein  27.64 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0653  hypothetical protein  28.81 
 
 
133 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3494  CoA-binding domain-containing protein  25.64 
 
 
159 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.965482  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5064  hypothetical protein  26.96 
 
 
119 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939937  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0698  hypothetical protein  24.56 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000671001  normal  0.0854698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3600  hypothetical protein  29.57 
 
 
119 aa  50.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265041  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0560  CoA-binding domain protein  23.42 
 
 
129 aa  50.4  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.89222  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0989  CoA-binding domain protein  29.51 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1388  CoA-binding domain-containing protein  25.83 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.555595  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  25.21 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1655  CoA-binding protein  26.67 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000297514  normal  0.67582 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0019  hypothetical protein  23.64 
 
 
124 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.816073  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0363  hypothetical protein  25.44 
 
 
122 aa  47.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  24.17 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0624  CoA-binding domain protein  27.05 
 
 
132 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1009  CoA-binding domain-containing protein  25.21 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0607  CoA-binding protein  26.32 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3341  CoA-binding domain-containing protein  26.67 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  22.69 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1854  CoA-binding domain-containing protein  24.79 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0446458  normal  0.0146672 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1056  CoA-binding domain protein  26.96 
 
 
159 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1209  CoA-binding domain-containing protein  25.62 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  23.28 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3507  CoA-binding domain-containing protein  25.83 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684153  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3018  hypothetical protein  28.45 
 
 
123 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0217  CoA-binding protein  25.2 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3063  CoA-binding  27.17 
 
 
162 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  25.42 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  23.53 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1891  CoA-binding domain protein  22.81 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.272605 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  22.41 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  22.41 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0966  CoA-binding domain protein  23.08 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  22.41 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  22.41 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  22.41 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  22.41 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  22.41 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  28.57 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0687  CoA-binding domain-containing protein  24.14 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.44778  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  26.27 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.137279 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  22.41 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  21.55 
 
 
137 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2880  hypothetical protein  23.01 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.476591  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1164  CoA-binding domain protein  24.14 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1672  CoA-binding domain-containing protein  24.6 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0937  CoA-binding domain-containing protein  23.93 
 
 
153 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.962686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>