120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0698 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0698  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  261  2e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000671001  normal  0.0854698 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2880  hypothetical protein  57.14 
 
 		 121 aa  130  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.476591  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0019  hypothetical protein  50 
 
 		 124 aa  120  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.816073  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1412  hypothetical protein  41.18 
 
 		 119 aa  98.2  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3018  hypothetical protein  37.72 
 
 		 123 aa  87  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07570  hypothetical protein  36.67 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7090  hypothetical protein  43.09 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0363  hypothetical protein  34.15 
 
 		 122 aa  84  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0560  CoA-binding domain protein  34.55 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.89222  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5064  hypothetical protein  35.29 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3600  hypothetical protein  30.25 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0607  CoA-binding protein  34.78 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0652  CoA-binding domain protein  34.78 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000133994  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1015  CoA-binding domain protein  28.57 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  30.63 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1614  CoA-binding protein  31.25 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1655  CoA-binding protein  30.33 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000297514  normal  0.67582 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  29.09 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1777  CoA-binding domain protein  26.89 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4017  CoA-binding domain-containing protein  30.36 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00796943  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1048  CoA-binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.417839  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2077  CoA-binding protein  26.89 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0217  CoA-binding protein  27.35 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2559  CoA-binding domain protein  26.13 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  30.56 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0651  CoA-binding domain-containing protein  26.19 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0653  hypothetical protein  28.57 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1445  CoA-binding domain-containing protein  28.95 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0669  hypothetical protein  28.57 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3103  hypothetical protein  31.19 
 
 		 194 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.210422  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1144  CoA-binding  30 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  27.36 
 
 		 537 aa  53.1  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  29.09 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1988  CoA-binding domain-containing protein  27.2 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370858  normal  0.185314 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2600  CoA-binding domain protein  27.43 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00073882  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1327  CoA-binding domain-containing protein  26.73 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000352253  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0624  CoA-binding domain protein  27.68 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1164  CoA-binding domain protein  29.25 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1828  hypothetical protein  24.56 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0658  CoA-binding domain-containing protein  26.27 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00210865  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2704  CoA-binding  30.43 
 
 		 194 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  24.32 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3507  CoA-binding domain-containing protein  29.46 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684153  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1359  CoA-binding domain-containing protein  27 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00343617  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2493  CoA-binding domain-containing protein  32.11 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.244493  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1616  CoA-binding domain protein  24.32 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000180037  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  28.45 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0742  CoA-binding domain-containing protein  23.08 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000457668  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0966  CoA-binding domain protein  22.73 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  36.49 
 
 		 700 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  26.13 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0989  CoA-binding domain protein  28.04 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1891  CoA-binding domain protein  27.45 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.272605 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1166  CoA-binding  28.44 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365479  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  27.59 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  28.97 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  26.42 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  26.27 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2668  CoA-binding  30.28 
 
 		 194 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1548  hypothetical protein  23.68 
 
 		 122 aa  47.8  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16153  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3363  CoA-binding domain protein  33.02 
 
 		 199 aa  47.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0719099  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0987  CoA-binding domain-containing protein  25.21 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  26.55 
 
 		 198 aa  47  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0079  CoA-binding domain protein  28.04 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0937  CoA-binding domain-containing protein  22.76 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.962686  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2457  CoA-binding  28.83 
 
 		 194 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.618512  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_50959  predicted protein  27.43 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4587  CoA-binding domain protein  27.1 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2240  hypothetical protein  28.7 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394786  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2358  CoA-binding domain-containing protein  24.55 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1421  CoA-binding domain-containing protein  21.82 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000954781  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  27.68 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3286  CoA-binding domain-containing protein  21.62 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120452  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3040  coenzyme A binding protein  25.89 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0801155 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3341  CoA-binding domain-containing protein  26.85 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  25.45 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3444  CoA-binding protein-like protein  23.68 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0272  CoA-binding domain protein  22.95 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0846  CoA-binding domain-containing protein  20 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0747  CoA-binding  29.47 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0309601  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2693  CoA-binding  28.44 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2251  CoA-binding  35.94 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0725  CoA-binding domain-containing protein  30.56 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000455945 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0758  CoA-binding domain-containing protein  24.17 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0982  CoA-binding domain-containing protein  27.68 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.419448 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  26.61 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0162  hypothetical protein  23.15 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2254  CoA-binding domain-containing protein  26.09 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0324206  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4595  hypothetical protein  26.61 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  25.88 
 
 		 718 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1049  CoA-binding domain protein  25 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1630  CoA-binding domain protein  21.93 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1328  CoA-binding domain protein  32.46 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0242548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4258  CoA-binding  25.89 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1388  CoA-binding domain-containing protein  24.79 
 
 		 136 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.555595  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0829  CoA-binding domain-containing protein  26.51 
 
 		 766 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0916  CoA-binding domain-containing protein  19.09 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.7124  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0375  CoA-binding domain-containing protein  24.11 
 
 		 154 aa  41.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  0.413983 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0866  CoA-binding domain-containing protein  29.03 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226245  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6163  CoA-binding domain-containing protein  32.43 
 
 		 442 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>