97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3507 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3507  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 
134 aa  276  9e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684153  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1614  CoA-binding protein  61.94 
 
 
134 aa  185  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4017  CoA-binding domain-containing protein  63.64 
 
 
132 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00796943  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0217  CoA-binding protein  62.41 
 
 
134 aa  179  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0624  CoA-binding domain protein  64.39 
 
 
132 aa  178  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1655  CoA-binding protein  58.96 
 
 
134 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000297514  normal  0.67582 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0669  hypothetical protein  53.79 
 
 
133 aa  152  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0653  hypothetical protein  54.96 
 
 
133 aa  152  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2077  CoA-binding protein  33.06 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2600  CoA-binding domain protein  31.2 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00073882  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0758  CoA-binding domain-containing protein  30.91 
 
 
123 aa  72  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0560  CoA-binding domain protein  33.33 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.89222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1445  CoA-binding domain-containing protein  31.97 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06185  conserved hypothetical protein  35.48 
 
 
493 aa  70.9  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0429141 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0652  CoA-binding domain protein  33.33 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000133994  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1056  CoA-binding domain protein  35.71 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0658  CoA-binding domain-containing protein  28.83 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00210865  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1777  CoA-binding domain protein  28.69 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0995  CoA-binding protein  31.34 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0651  CoA-binding domain-containing protein  38.2 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1015  CoA-binding domain protein  27.64 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1327  CoA-binding domain-containing protein  33.72 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000352253  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1359  CoA-binding domain-containing protein  34.12 
 
 
131 aa  62  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00343617  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3494  CoA-binding domain-containing protein  28.45 
 
 
159 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.965482  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55314  predicted protein  24.5 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1052  CoA-binding domain protein  33.57 
 
 
159 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256788  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  30.4 
 
 
140 aa  57  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0607  CoA-binding protein  31.03 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1284  CoA-binding domain-containing protein  26.45 
 
 
124 aa  55.1  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0728  CoA-binding domain-containing protein  32.23 
 
 
135 aa  53.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.298785 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  30.71 
 
 
134 aa  52.8  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1421  CoA-binding domain-containing protein  26.45 
 
 
134 aa  53.5  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000954781  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  31.82 
 
 
134 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  31.82 
 
 
134 aa  51.2  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3341  CoA-binding domain-containing protein  30.08 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  28.8 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1164  CoA-binding domain protein  26.72 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0698  hypothetical protein  29.46 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000671001  normal  0.0854698 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  29.09 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  24.78 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0985  CoA-binding domain protein  24.62 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1630  CoA-binding domain protein  26.92 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4587  CoA-binding domain protein  29.09 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0846  CoA-binding domain-containing protein  20.49 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  24.6 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  22.81 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3341  CoA-binding domain-containing protein  24.58 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125699  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1762  CoA-binding domain protein  25 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.823906  normal  0.0190292 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  34.21 
 
 
701 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  26.85 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1854  CoA-binding domain-containing protein  23.14 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0446458  normal  0.0146672 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0966  CoA-binding domain protein  23.81 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1166  CoA-binding  28.46 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365479  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0725  CoA-binding domain-containing protein  27.97 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000455945 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  27.36 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  22.9 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  25 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0989  CoA-binding domain protein  27 
 
 
140 aa  44.3  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1049  CoA-binding domain protein  27.69 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1548  hypothetical protein  25.83 
 
 
122 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16153  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1828  hypothetical protein  25.83 
 
 
122 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0742  CoA-binding domain-containing protein  25.3 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000457668  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  25 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  25 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  34.29 
 
 
704 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  23.68 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3286  CoA-binding domain-containing protein  24.35 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120452  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  22.76 
 
 
537 aa  42.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2085  CoA-binding domain protein  30.12 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2574  hypothetical protein  32.11 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624453  hitchhiker  0.000000425683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0505  CoA-binding domain protein  43.59 
 
 
887 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  24.53 
 
 
137 aa  41.2  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  24.53 
 
 
137 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3306  CoA-binding domain-containing protein  24.35 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.007751  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3618  CoA-binding domain-containing protein  24.35 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000227272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  24.53 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1048  CoA-binding domain-containing protein  24.55 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.417839  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  24.53 
 
 
137 aa  41.2  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  24.53 
 
 
137 aa  41.2  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  24.53 
 
 
137 aa  41.2  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3625  CoA binding domain family protein  24.35 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000648968  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0916  CoA-binding domain-containing protein  19.67 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.7124  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2880  hypothetical protein  26.79 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.476591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3394  CoA-binding domain-containing protein  23.48 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0763288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3659  CoA-binding domain-containing protein  23.48 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000120048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1608  CoA binding domain family protein  23.48 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000441527  hitchhiker  0.00000000000716402 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  24.79 
 
 
660 aa  40.8  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1891  CoA-binding domain protein  26.72 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.272605 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  24.53 
 
 
137 aa  41.2  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  24.53 
 
 
137 aa  41.2  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3356  CoA-binding domain-containing protein  23.48 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000642937  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0863  hypothetical protein  37.68 
 
 
707 aa  40.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0968097 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3610  CoA binding domain family protein  23.48 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5882599999999998e-27 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3707  CoA binding domain family protein  23.48 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000701886  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2004  CoA-binding domain protein  23.2 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1144  CoA-binding  24.79 
 
 
142 aa  40  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0162  hypothetical protein  23.28 
 
 
145 aa  40  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>