169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0624 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0624  CoA-binding domain protein  100 
 
 
132 aa  268  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4017  CoA-binding domain-containing protein  68.18 
 
 
132 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00796943  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0217  CoA-binding protein  62.6 
 
 
134 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3507  CoA-binding domain-containing protein  64.39 
 
 
134 aa  178  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684153  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1614  CoA-binding protein  61.54 
 
 
134 aa  174  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1655  CoA-binding protein  62.31 
 
 
134 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000297514  normal  0.67582 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0669  hypothetical protein  56.49 
 
 
133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0653  hypothetical protein  54.2 
 
 
133 aa  159  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2600  CoA-binding domain protein  37.6 
 
 
130 aa  97.8  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00073882  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0560  CoA-binding domain protein  38.05 
 
 
129 aa  89  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.89222  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0652  CoA-binding domain protein  36.22 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000133994  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1445  CoA-binding domain-containing protein  32.79 
 
 
136 aa  76.6  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1777  CoA-binding domain protein  31.97 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0651  CoA-binding domain-containing protein  39.33 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06185  conserved hypothetical protein  37.27 
 
 
493 aa  72.8  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0429141 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2077  CoA-binding protein  30.33 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0758  CoA-binding domain-containing protein  32.73 
 
 
123 aa  70.1  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1015  CoA-binding domain protein  29.23 
 
 
131 aa  70.1  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1284  CoA-binding domain-containing protein  31.4 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3494  CoA-binding domain-containing protein  30.77 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.965482  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0995  CoA-binding protein  32.8 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2085  CoA-binding domain protein  30.3 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1056  CoA-binding domain protein  32 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1327  CoA-binding domain-containing protein  30.77 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000352253  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5544  CoA-binding domain protein  33.64 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  33.87 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1359  CoA-binding domain-containing protein  32.98 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00343617  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0658  CoA-binding domain-containing protein  27.27 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00210865  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0985  CoA-binding domain protein  32.58 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  32.28 
 
 
134 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  34.38 
 
 
134 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4587  CoA-binding domain protein  32 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55314  predicted protein  26.85 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1052  CoA-binding domain protein  32 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256788  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  31.15 
 
 
144 aa  57.4  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  29.82 
 
 
135 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1388  CoA-binding domain-containing protein  31.48 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.555595  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  31.67 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0728  CoA-binding domain-containing protein  32.8 
 
 
135 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.298785 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  32.71 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1562  CoA-binding domain-containing protein  26.45 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.477139  normal  0.0705808 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3193  CoA-binding domain protein  31.75 
 
 
181 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0989  CoA-binding domain protein  28.46 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  31.09 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0742  CoA-binding domain-containing protein  24.55 
 
 
159 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000457668  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  27.35 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  31.93 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  31.78 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  31.78 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1164  CoA-binding domain protein  35.78 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  31.78 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  31.78 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  31.78 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  31.78 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  29.63 
 
 
133 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3341  CoA-binding domain-containing protein  31.97 
 
 
155 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  31.78 
 
 
137 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  31.78 
 
 
137 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1421  CoA-binding domain-containing protein  25.22 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000954781  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3787  GCN5-related N-acetyltransferase  32.69 
 
 
893 aa  53.5  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.152255  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  27.19 
 
 
134 aa  52.8  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  30.84 
 
 
137 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0566  CoA-binding  34.29 
 
 
688 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.9879  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1891  CoA-binding domain protein  35.29 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.272605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1854  CoA-binding domain-containing protein  29.63 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0446458  normal  0.0146672 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  30.09 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  29.73 
 
 
139 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0530  CoA-binding domain-containing protein  27.73 
 
 
164 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0698  hypothetical protein  27.68 
 
 
128 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000671001  normal  0.0854698 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0886  CoA-binding domain protein  25.74 
 
 
637 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.330543  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1471  CoA-binding  31.03 
 
 
687 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  30.09 
 
 
198 aa  50.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  29.06 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  29.06 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2545  hypothetical protein  29.17 
 
 
138 aa  50.1  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  25.41 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3341  CoA-binding domain-containing protein  29.32 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125699  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0725  CoA-binding domain-containing protein  23.2 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000455945 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2880  hypothetical protein  26.79 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.476591  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  23.68 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1144  CoA-binding  27.78 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1166  CoA-binding  31.19 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365479  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  28.21 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0966  CoA-binding domain protein  23.01 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  31.36 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32 
 
 
699 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  30.63 
 
 
911 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0863  hypothetical protein  27.38 
 
 
707 aa  47.8  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0968097 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  26.67 
 
 
660 aa  47.4  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0554  CoA-binding domain-containing protein  25.6 
 
 
689 aa  47.4  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.794682  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1548  hypothetical protein  27.87 
 
 
122 aa  47.4  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16153  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  32.58 
 
 
929 aa  47  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2948  CoA-binding domain-containing protein  30.11 
 
 
899 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.574552  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1828  hypothetical protein  27.05 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  25.74 
 
 
669 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  21.97 
 
 
537 aa  46.6  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1585  CoA-binding domain-containing protein  30.7 
 
 
697 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.27477 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0162  CoA-binding domain-containing protein  29.79 
 
 
516 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000166188  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2421  CoA-binding  33.85 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000330878  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  30.34 
 
 
709 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>