195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1009 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1009  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 
149 aa  297  4e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1672  CoA-binding domain-containing protein  82.55 
 
 
149 aa  254  4e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0937  CoA-binding domain-containing protein  79.05 
 
 
153 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.962686  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1209  CoA-binding domain-containing protein  50.71 
 
 
145 aa  141  4e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1049  CoA-binding domain protein  42.42 
 
 
138 aa  120  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  30.08 
 
 
137 aa  101  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  29.32 
 
 
137 aa  100  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  30.08 
 
 
137 aa  100  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  28.57 
 
 
137 aa  99  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  33.33 
 
 
176 aa  99.4  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0687  CoA-binding domain-containing protein  36.36 
 
 
138 aa  99.4  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.44778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  28.57 
 
 
137 aa  99  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  28.57 
 
 
137 aa  99  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  28.57 
 
 
137 aa  99  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  28.57 
 
 
137 aa  99  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  28.57 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  28.57 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  28.57 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  28.68 
 
 
137 aa  97.8  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  28.99 
 
 
198 aa  96.7  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  30.08 
 
 
137 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  29.85 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_50959  predicted protein  33.59 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2248  CoA-binding domain-containing protein  35.71 
 
 
137 aa  94  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000439003  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2340  CoA-binding domain protein  32.03 
 
 
179 aa  94  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  30.08 
 
 
138 aa  94  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  30.08 
 
 
138 aa  93.6  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  30.08 
 
 
138 aa  93.6  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1048  CoA-binding domain-containing protein  31.3 
 
 
139 aa  93.2  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.417839  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  36.15 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1976  CoA-binding domain-containing protein  28.97 
 
 
169 aa  92  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485695  normal  0.647487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  31.01 
 
 
140 aa  91.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4825  CoA-binding domain-containing protein  34.38 
 
 
130 aa  91.3  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0989  CoA-binding domain protein  38.21 
 
 
140 aa  90.9  5e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3508  CoA-binding domain protein  29.25 
 
 
154 aa  90.9  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0120178 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  30.6 
 
 
134 aa  90.5  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3286  CoA-binding domain-containing protein  34.13 
 
 
137 aa  90.5  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120452  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3183  CoA-binding domain protein  28.57 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0145  CoA-binding domain protein  30.77 
 
 
181 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  34.11 
 
 
133 aa  89  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  27.82 
 
 
137 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3356  CoA-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
137 aa  88.6  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000642937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3610  CoA binding domain family protein  33.33 
 
 
137 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5882599999999998e-27 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02340  predicted CoA-binding protein  28.91 
 
 
171 aa  88.6  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3707  CoA binding domain family protein  33.33 
 
 
137 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000701886  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3618  CoA-binding domain-containing protein  32.54 
 
 
137 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000227272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3625  CoA binding domain family protein  32.54 
 
 
137 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000648968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3394  CoA-binding domain-containing protein  32.54 
 
 
137 aa  87.4  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0763288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3306  CoA-binding domain-containing protein  32.54 
 
 
137 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.007751  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3659  CoA-binding domain-containing protein  32.54 
 
 
137 aa  87.4  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000120048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1608  CoA binding domain family protein  33.33 
 
 
137 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000441527  hitchhiker  0.00000000000716402 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0390  CoA-binding domain-containing protein  34.09 
 
 
146 aa  87.4  6e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1672  CoA-binding protein  33.08 
 
 
143 aa  87.4  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996781  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2417  CoA-binding domain protein  29.85 
 
 
193 aa  87  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452114  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3313  hypothetical protein  27.21 
 
 
153 aa  86.7  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2489  CoA-binding domain-containing protein  29.1 
 
 
193 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  30.3 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2712  CoA-binding domain protein  29.1 
 
 
193 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350227  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1379  CoA-binding domain protein  29.37 
 
 
161 aa  85.1  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1177  CoA-binding domain-containing protein  28.06 
 
 
205 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4615  CoA-binding domain-containing protein  29.23 
 
 
180 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.305914  normal  0.0136961 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  32.56 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19320  predicted CoA-binding protein  30.16 
 
 
165 aa  84.3  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0866422  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3436  CoA-binding domain protein  30.71 
 
 
180 aa  84  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  30.53 
 
 
139 aa  84.3  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0966  CoA-binding domain protein  38.4 
 
 
129 aa  83.6  8e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4331  CoA-binding domain-containing protein  29.85 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.282355 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2075  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  32.82 
 
 
612 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.313252  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  29.23 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0530  CoA-binding domain-containing protein  30.95 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1616  CoA-binding domain protein  31.01 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000180037  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2358  CoA-binding domain-containing protein  29.63 
 
 
138 aa  82  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0866  CoA-binding domain-containing protein  28.89 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226245  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  30.83 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  27.27 
 
 
144 aa  82  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0742  CoA-binding domain-containing protein  33.58 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000457668  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4595  hypothetical protein  28.36 
 
 
194 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  30.37 
 
 
135 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2574  hypothetical protein  24.06 
 
 
161 aa  80.1  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624453  hitchhiker  0.000000425683 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  35.66 
 
 
537 aa  80.1  0.000000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0747  CoA-binding  31.01 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0309601  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2493  CoA-binding domain-containing protein  28 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.244493  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3824  CoA-binding domain-containing protein  28.26 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2559  CoA-binding domain protein  28.68 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2251  CoA-binding  30.23 
 
 
140 aa  77  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2052  CoA-binding  26.32 
 
 
154 aa  77  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1164  CoA-binding domain protein  25.78 
 
 
140 aa  77  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0375  CoA-binding domain-containing protein  29.55 
 
 
154 aa  76.6  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  0.413983 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2545  hypothetical protein  27.21 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1875  CoA-binding domain protein  25.19 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1948  CoA-binding domain-containing protein  31.34 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  25 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2836  CoA-binding domain-containing protein  25.56 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.758344  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3103  hypothetical protein  30 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.210422  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  29.2 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1854  CoA-binding domain-containing protein  27.34 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0446458  normal  0.0146672 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2525  hypothetical protein  26.52 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.550629  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  25 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5334  CoA-binding protein  26.28 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3363  CoA-binding domain protein  27.73 
 
 
199 aa  74.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0719099  normal  0.0150565 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>