More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2284 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2284  acetolactate synthase catalytic subunit  100 
 
 		 575 aa  1170    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.774039  hitchhiker  0.0072458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3747  acetolactate synthase catalytic subunit  55.15 
 
 		 581 aa  595  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747171  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0336  acetolactate synthase catalytic subunit  57.95 
 
 		 575 aa  593  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5039  acetolactate synthase large subunit  34.95 
 
 		 611 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.818274  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1020  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.58 
 
 		 565 aa  282  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0790  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.93 
 
 		 564 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000243733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1406  acetolactate synthase, large subunit  32.07 
 
 		 563 aa  261  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0875131 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1037  acetolactate synthase, large subunit  31.61 
 
 		 551 aa  261  2e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4081  thiamine pyrophosphate protein central region  29.86 
 
 		 583 aa  242  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721438  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  31.09 
 
 		 599 aa  231  3e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1240  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.95 
 
 		 580 aa  229  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.38 
 
 		 559 aa  229  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.8 
 
 		 554 aa  225  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2846  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.43 
 
 		 574 aa  224  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1968  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.73 
 
 		 581 aa  223  6e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.697399  normal  0.245648 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.52 
 
 		 574 aa  223  9e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0620  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31 
 
 		 560 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.635865  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  30.27 
 
 		 567 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1557  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.37 
 
 		 581 aa  220  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1253  putative acetolactate synthase large subunit  31.24 
 
 		 595 aa  220  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.713143  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  28.68 
 
 		 566 aa  219  7.999999999999999e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.25 
 
 		 558 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5588  thiamine pyrophosphate protein central region  28.4 
 
 		 583 aa  219  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.130518  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001649  acetolactate synthase large subunit  29.06 
 
 		 574 aa  218  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546971  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2706  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.21 
 
 		 573 aa  218  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3455  glyoxylate carboligase  30.84 
 
 		 577 aa  219  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.25 
 
 		 558 aa  218  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.08 
 
 		 569 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.469559  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_737  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.08 
 
 		 569 aa  217  5e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00716267  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.42 
 
 		 563 aa  217  5e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  28.68 
 
 		 542 aa  217  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0752  acetolactate synthase, large subunit  28.9 
 
 		 569 aa  216  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.52 
 
 		 553 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.42 
 
 		 587 aa  214  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.11 
 
 		 552 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1157  glyoxylate carboligase  32.21 
 
 		 594 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2059  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.62 
 
 		 573 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2213  Fis family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 580 aa  212  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.851331  normal  0.770524 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.94 
 
 		 602 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1858  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.59 
 
 		 582 aa  210  5e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.667431  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.23 
 
 		 570 aa  209  9e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  29.98 
 
 		 587 aa  209  9e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05831  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.41 
 
 		 587 aa  209  9e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  27.66 
 
 		 578 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4168  acetolactate synthase  28.47 
 
 		 550 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4208  acetolactate synthase  28.47 
 
 		 550 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2548  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  29.86 
 
 		 570 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.122041 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  29.61 
 
 		 587 aa  208  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29 
 
 		 588 aa  208  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.7 
 
 		 557 aa  209  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  28.44 
 
 		 587 aa  208  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4449  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30 
 
 		 570 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2853  glyoxylate carboligase  30.12 
 
 		 583 aa  207  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0172907  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  27.57 
 
 		 552 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.55 
 
 		 581 aa  207  5e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.35 
 
 		 569 aa  206  8e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  29.04 
 
 		 587 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.88 
 
 		 571 aa  206  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.26 
 
 		 573 aa  206  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1233  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  29.18 
 
 		 627 aa  206  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506  normal  0.463621 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.33 
 
 		 566 aa  205  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29 
 
 		 570 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29 
 
 		 570 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29 
 
 		 570 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3448  glyoxylate carboligase  29.07 
 
 		 596 aa  205  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1928  acetolactate synthase  27.5 
 
 		 545 aa  205  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886275  normal  0.0286883 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1628  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.24 
 
 		 572 aa  205  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.84 
 
 		 593 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.42 
 
 		 581 aa  204  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1114  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.18 
 
 		 562 aa  204  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2279  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.49 
 
 		 572 aa  204  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.7 
 
 		 573 aa  204  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2821  acetolactate synthase large subunit  26.86 
 
 		 581 aa  204  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2490  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.12 
 
 		 572 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.156428  hitchhiker  0.00098132 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1934  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.55 
 
 		 571 aa  203  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.83 
 
 		 570 aa  203  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1707  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.16 
 
 		 571 aa  203  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.14 
 
 		 566 aa  203  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0581  glyoxylate carboligase  30.07 
 
 		 593 aa  203  8e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2122  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.86 
 
 		 572 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  27.89 
 
 		 568 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0634  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.36 
 
 		 573 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0951931  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1973  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.82 
 
 		 572 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417395  hitchhiker  0.0000255584 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00457  glyoxylate carboligase  29.89 
 
 		 593 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.50477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3105  glyoxylate carboligase  29.89 
 
 		 593 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0441  glyoxylate carboligase  29.89 
 
 		 593 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0206883  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00462  hypothetical protein  29.89 
 
 		 593 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.711449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2817  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  29.68 
 
 		 570 aa  202  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109002 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0522  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.26 
 
 		 570 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.96739  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0608  glyoxylate carboligase  29.89 
 
 		 593 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3115  glyoxylate carboligase  29.89 
 
 		 593 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2386  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.82 
 
 		 572 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0890713  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0688  acetolactate synthase  28.6 
 
 		 550 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0527  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.09 
 
 		 608 aa  201  3e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2258  acetolactate synthase, large subunit  29.12 
 
 		 569 aa  201  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2138  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.99 
 
 		 572 aa  201  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.803808  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.73 
 
 		 573 aa  201  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302703  decreased coverage  0.000148215 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0550  glyoxylate carboligase  29.81 
 
 		 593 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.71 
 
 		 566 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1396  glyoxylate carboligase  28.57 
 
 		 591 aa  200  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136829  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>