More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2381 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2381  putative sensor protein  100 
 
 		 456 aa  916    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1255  sensor protein  59.31 
 
 		 464 aa  510  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0678  putative sensor protein  56.55 
 
 		 460 aa  498  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1978  putative sensor protein  44.18 
 
 		 460 aa  305  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0948256 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1951  putative sensor protein  43.97 
 
 		 460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4298  putative sensor protein  41.7 
 
 		 463 aa  301  1e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.204106 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0555  putative sensor protein  44.16 
 
 		 468 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2282  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 637 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.725476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3573  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 650 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.287908 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3576  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 705 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 691 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.582434  normal  0.199494 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0482  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 691 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4723  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 670 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3790  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 689 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.296529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2847  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 668 aa  109  9.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  28.14 
 
 		 770 aa  80.1  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2799  metal dependent phosphohydrolase  20.81 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  29.67 
 
 		 553 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 		 513 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2483  putative PAS/PAC sensor protein  31.55 
 
 		 619 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0261  response regulator  28.98 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.62 
 
 		 508 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  27.75 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  31.91 
 
 		 548 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0745  response regulator/HD domain-containing protein  28.98 
 
 		 481 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0757  response regulator/HD domain-containing protein  28.98 
 
 		 481 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2469  response regulator  28.98 
 
 		 481 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129941  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0923  response regulator  28.98 
 
 		 481 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2689  response regulator  28.98 
 
 		 481 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2388  response regulator  28.98 
 
 		 481 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  31.39 
 
 		 718 aa  73.9  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  27.87 
 
 		 792 aa  73.6  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  25.37 
 
 		 618 aa  73.2  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0615  response regulator  28.87 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.177724  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  26.32 
 
 		 615 aa  73.2  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.73 
 
 		 841 aa  72.8  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2119  metal dependent phosphohydrolase  30.05 
 
 		 388 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0158071  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  26.87 
 
 		 648 aa  72  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0383  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.41 
 
 		 746 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7223  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.41 
 
 		 473 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.58817  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0731  response regulator  31.25 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1662  response regulator  31.42 
 
 		 475 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  26.89 
 
 		 836 aa  70.5  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0599  response regulator  33.65 
 
 		 475 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1716  response regulator  31.42 
 
 		 475 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1923  response regulator  31.42 
 
 		 475 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.537818  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2332  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  27.8 
 
 		 960 aa  70.1  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0711  response regulator  31.42 
 
 		 518 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  28 
 
 		 547 aa  69.7  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  28 
 
 		 547 aa  69.7  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2231  response regulator  31.42 
 
 		 475 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2314  response regulator  31.42 
 
 		 475 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1437  metal dependent phosphohydrolase  27.84 
 
 		 471 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4228  putative sensor protein  27.03 
 
 		 282 aa  67  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3269  response regulator  23.4 
 
 		 600 aa  67  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.633194  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0689  putative PAS/PAC sensor protein  28.5 
 
 		 836 aa  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000235898 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2498  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.38 
 
 		 367 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0780  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.9 
 
 		 520 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0195559  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.06 
 
 		 853 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0138  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.13 
 
 		 1338 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  24.39 
 
 		 487 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3115  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.54 
 
 		 626 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.972183  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  24.24 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1627  metal dependent phosphohydrolase  25.87 
 
 		 470 aa  63.9  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  28.89 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6276  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 469 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2224  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 		 500 aa  63.9  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000178543  decreased coverage  1.10821e-21 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3476  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.13 
 
 		 479 aa  63.9  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5280  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.34 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.273072 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0348  sensory box protein  30.88 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1002  metal dependent phosphohydrolase  26.61 
 
 		 560 aa  63.5  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.1679  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1432  metal dependent phosphohydrolase  33.87 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000116071  normal  0.0291247 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0011  putative PAS/PAC sensor protein  24.88 
 
 		 526 aa  63.5  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.140902  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  27.27 
 
 		 550 aa  63.2  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  28.79 
 
 		 545 aa  63.2  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0823  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.32 
 
 		 755 aa  63.2  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.08 
 
 		 469 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3805  response regulator receiver domain-containing protein  33.04 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  22.93 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1552  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.77 
 
 		 971 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0185  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.57 
 
 		 1125 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  22.77 
 
 		 564 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07490  putative sensor protein  26.52 
 
 		 181 aa  62.4  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1204  metal dependent phosphohydrolase  27.91 
 
 		 553 aa  62  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  29.69 
 
 		 350 aa  62  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 545 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  26.06 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2408  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  24.76 
 
 		 623 aa  61.2  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  23.14 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  23.53 
 
 		 563 aa  61.6  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1099  metal dependent phosphohydrolase  31.67 
 
 		 572 aa  61.2  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00025429  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  28 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  24.08 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0839  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.83 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0810  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.83 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  27.44 
 
 		 632 aa  60.5  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0061  metal dependent phosphohydrolase  31.62 
 
 		 465 aa  60.5  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  32.21 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0880  metal dependent phosphohydrolase  34.03 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45566  normal  0.533895 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  23.19 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>