More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4298 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4298  putative sensor protein  100 
 
 
463 aa  955    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.204106 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1978  putative sensor protein  65 
 
 
460 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0948256 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1951  putative sensor protein  65 
 
 
460 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0555  putative sensor protein  64.13 
 
 
468 aa  594  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1255  sensor protein  43.43 
 
 
464 aa  342  9e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0678  putative sensor protein  40.25 
 
 
460 aa  333  4e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2381  putative sensor protein  42.44 
 
 
456 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0482  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
691 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
691 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.582434  normal  0.199494 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2847  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
668 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3576  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
705 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4723  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  30 
 
 
670 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3573  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
650 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.287908 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2282  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 
637 aa  109  9.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.725476  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3790  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
689 aa  99  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.296529  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  32.76 
 
 
718 aa  99  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2483  putative PAS/PAC sensor protein  36.94 
 
 
619 aa  96.3  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  32 
 
 
792 aa  95.1  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  25.79 
 
 
508 aa  94  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  25.24 
 
 
513 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  28.8 
 
 
770 aa  92.8  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  29.61 
 
 
648 aa  92  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3115  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.47 
 
 
626 aa  91.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.972183  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  31.43 
 
 
836 aa  91.7  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0206  metal-dependent phosphohydrolase  29.72 
 
 
369 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44114  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0148  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.33 
 
 
385 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0150  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.72 
 
 
369 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.61 
 
 
841 aa  90.5  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.53 
 
 
487 aa  90.9  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  26.41 
 
 
334 aa  90.5  6e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  33.55 
 
 
618 aa  90.1  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2119  metal dependent phosphohydrolase  22.66 
 
 
388 aa  89.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0158071  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3285  response regulator receiver  28.82 
 
 
362 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2951  response regulator receiver protein  28.64 
 
 
340 aa  88.6  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.129077 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3141  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.79 
 
 
338 aa  88.6  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28 
 
 
334 aa  88.2  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1158  metal dependent phosphohydrolase  27.67 
 
 
314 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.395393 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0860  response regulator  27.78 
 
 
339 aa  87.4  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 
389 aa  87  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4319  Metal dependent phosphohydrolase with a response regulator receiver protein  31.79 
 
 
382 aa  87  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  27.32 
 
 
615 aa  87  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2203  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  26.86 
 
 
434 aa  86.7  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3504  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 
338 aa  86.3  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0859  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 
338 aa  86.3  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0836  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 
338 aa  86.7  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2799  metal dependent phosphohydrolase  23.38 
 
 
462 aa  86.7  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.32 
 
 
498 aa  86.7  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0871  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 
338 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0737  metal dependent phosphohydrolase  29.13 
 
 
254 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752336  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3418  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 
338 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2545  metal dependent phosphohydrolase  29.63 
 
 
269 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1627  metal dependent phosphohydrolase  28.02 
 
 
470 aa  84.7  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  27.57 
 
 
547 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  27.57 
 
 
547 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  26.67 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  26.69 
 
 
876 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  26.57 
 
 
430 aa  84.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0716  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3306  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.02 
 
 
853 aa  84  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0823  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.55 
 
 
755 aa  83.6  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3977  metal dependent phosphohydrolase  31.29 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.750447 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2945  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.13 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3863  metal dependent phosphohydrolase  31.29 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529266  normal  0.383741 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  32.03 
 
 
452 aa  83.2  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5280  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.03 
 
 
348 aa  83.2  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.273072 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1099  metal dependent phosphohydrolase  26.82 
 
 
572 aa  83.2  0.000000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00025429  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2111  metal dependent phosphohydrolase  30.67 
 
 
201 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0244  metal dependent phosphohydrolase  28.49 
 
 
220 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100694  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  27.64 
 
 
771 aa  81.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1828  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.61 
 
 
379 aa  82.4  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0138  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.17 
 
 
1338 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.32 
 
 
343 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.92 
 
 
480 aa  81.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0348  sensory box protein  29.41 
 
 
212 aa  82  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  28.63 
 
 
448 aa  82  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1875  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.83 
 
 
361 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1141  metal dependent phosphohydrolase  26.7 
 
 
197 aa  81.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000147329  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1432  metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 
207 aa  81.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000116071  normal  0.0291247 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2443  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  26.86 
 
 
912 aa  81.6  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  24.87 
 
 
428 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4105  metal dependent phosphohydrolase  30.49 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000135531  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1406  response regulator  26.63 
 
 
351 aa  80.9  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3313  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.4 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000482447 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0190  metal dependent phosphohydrolase  32.96 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.780552  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1793  metal dependent phosphohydrolase  26.7 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000123225  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0188  metal dependent phosphohydrolase  32.96 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.691401  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0689  putative PAS/PAC sensor protein  30.99 
 
 
836 aa  80.5  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000235898 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0383  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32 
 
 
746 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0488  metal dependent phosphohydrolase  28.82 
 
 
462 aa  80.1  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.354545  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1571  metal dependent phosphohydrolase  29.56 
 
 
401 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000899891 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0007  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.36 
 
 
379 aa  80.1  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.829613  normal  0.0284762 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  27.84 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2862  HDIG domain-containing protein  29.06 
 
 
401 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1344  metal dependent phosphohydrolase  30.06 
 
 
643 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0838  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.16 
 
 
378 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0061  metal dependent phosphohydrolase  31.41 
 
 
465 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2325  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.56 
 
 
362 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.663275  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2382  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.25 
 
 
359 aa  79.7  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  27.19 
 
 
334 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>