More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1960 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2606  glycogen synthase  61.59 
 
 
513 aa  639    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0718737  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2631  glycogen synthase  79.07 
 
 
492 aa  828    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.311536  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1960  glycogen synthase  100 
 
 
492 aa  1030    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.69923 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0872  glycogen synthase  65.18 
 
 
496 aa  657    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.279274 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0845  glycogen synthase  65.18 
 
 
496 aa  657    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4463  glycogen synthase  77.64 
 
 
491 aa  814    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1517  glycogen synthase  60 
 
 
489 aa  614  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0100  glycogen synthase  58.16 
 
 
487 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40458  predicted protein  39.56 
 
 
680 aa  335  1e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0545631  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48511  predicted protein  36.86 
 
 
567 aa  327  3e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0220313  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41853  predicted protein  36.33 
 
 
951 aa  296  6e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0125571  hitchhiker  0.000959296 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.93 
 
 
488 aa  291  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41260  predicted protein  36.44 
 
 
677 aa  289  9e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.710049 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  36.51 
 
 
484 aa  286  9e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.44 
 
 
484 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0726  glycogen synthase  35.32 
 
 
492 aa  281  2e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.81 
 
 
478 aa  280  5e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.43 
 
 
475 aa  280  6e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  36.01 
 
 
480 aa  279  8e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.14 
 
 
486 aa  278  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  35.77 
 
 
476 aa  278  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  36.42 
 
 
480 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  35.98 
 
 
476 aa  276  7e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0856  glycogen synthase  35.54 
 
 
476 aa  276  9e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00244208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.74 
 
 
486 aa  276  9e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  36.21 
 
 
498 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  35.96 
 
 
484 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  35.98 
 
 
476 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  36.2 
 
 
498 aa  274  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  36.07 
 
 
498 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  35.82 
 
 
480 aa  272  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  35.86 
 
 
498 aa  272  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.38 
 
 
484 aa  269  7e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3501  glycogen synthase  35.92 
 
 
478 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  34.7 
 
 
487 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  35.6 
 
 
485 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1386  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.66 
 
 
477 aa  266  5e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011611  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0256  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.07 
 
 
497 aa  264  3e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0015526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.97 
 
 
534 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000776916 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0004  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.57 
 
 
482 aa  262  1e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0707  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.87 
 
 
502 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.29 
 
 
480 aa  261  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.52 
 
 
480 aa  261  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2286  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.13 
 
 
487 aa  258  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.22 
 
 
475 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0293  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  33.98 
 
 
506 aa  257  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0567  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.26 
 
 
518 aa  256  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.81 
 
 
475 aa  256  8e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  32.41 
 
 
482 aa  256  9e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1582  glycogen synthase  32.42 
 
 
491 aa  255  2.0000000000000002e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0042939  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2145  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.29 
 
 
473 aa  254  3e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.619939  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0998  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  33.47 
 
 
489 aa  254  3e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0841  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.53 
 
 
488 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0251481 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.65 
 
 
496 aa  251  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1696  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.33 
 
 
497 aa  251  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506907  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1982  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.48 
 
 
489 aa  251  3e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.78 
 
 
494 aa  250  5e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1047  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  32.67 
 
 
499 aa  249  6e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0870  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.53 
 
 
477 aa  249  7e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.758112  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  31.74 
 
 
484 aa  249  9e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3196  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.54 
 
 
467 aa  249  9e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2043  glycogen synthase  32.22 
 
 
486 aa  248  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405007  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0181  glycogen synthase  33.33 
 
 
474 aa  248  2e-64  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2787  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.26 
 
 
509 aa  248  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2348  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  34.64 
 
 
493 aa  248  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0106928 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  34.27 
 
 
488 aa  248  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  33.53 
 
 
493 aa  247  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1334  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.47 
 
 
481 aa  247  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000402724  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6185  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.71 
 
 
525 aa  247  4e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0114021 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.6 
 
 
486 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.6 
 
 
486 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1221  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.33 
 
 
482 aa  246  6e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.085382  normal  0.2089 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.4 
 
 
485 aa  245  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0555  glycogen synthase  33.8 
 
 
478 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0810  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.71 
 
 
448 aa  245  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.13 
 
 
587 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.13 
 
 
488 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1890  glycogen synthase  33.79 
 
 
487 aa  245  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.601172 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.65 
 
 
491 aa  244  3e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2742  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.56 
 
 
473 aa  243  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.341368  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1241  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.33 
 
 
476 aa  244  3.9999999999999997e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2986  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  32.94 
 
 
508 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.0755351 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2664  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.27 
 
 
480 aa  243  5e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.381394  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.2 
 
 
481 aa  242  9e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0082  glycogen synthase  34.22 
 
 
477 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.93 
 
 
491 aa  241  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1023  glycogen synthase  33.87 
 
 
501 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4501  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.55 
 
 
460 aa  240  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2518  glycogen synthase  34.55 
 
 
465 aa  241  2.9999999999999997e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1839  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.4 
 
 
503 aa  241  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0153  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.4 
 
 
477 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0346  glycogen/starch synthase ADP-glucose type  35.03 
 
 
447 aa  240  5e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1888  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  32.13 
 
 
490 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590252  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0542  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  32.47 
 
 
490 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1081  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34 
 
 
504 aa  239  6.999999999999999e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.24 
 
 
498 aa  237  4e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0781  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.62 
 
 
463 aa  237  4e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  33.2 
 
 
488 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0386  glycogen synthase  33.87 
 
 
483 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  31.33 
 
 
486 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>