More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1517 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1517  glycogen synthase  100 
 
 		 489 aa  1019    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2631  glycogen synthase  60.74 
 
 		 492 aa  617  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.311536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2606  glycogen synthase  59.67 
 
 		 513 aa  600  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0718737  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1960  glycogen synthase  58.78 
 
 		 492 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.69923 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4463  glycogen synthase  57.87 
 
 		 491 aa  591  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0100  glycogen synthase  57.58 
 
 		 487 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0872  glycogen synthase  53.64 
 
 		 496 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.279274 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0845  glycogen synthase  53.64 
 
 		 496 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40458  predicted protein  40.24 
 
 		 680 aa  324  3e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0545631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48511  predicted protein  36.02 
 
 		 567 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0220313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  36.84 
 
 		 487 aa  295  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.74 
 
 		 486 aa  293  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.46 
 
 		 486 aa  292  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  36.48 
 
 		 480 aa  291  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  36.27 
 
 		 476 aa  291  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.41 
 
 		 484 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41853  predicted protein  38.32 
 
 		 951 aa  289  6e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0125571  hitchhiker  0.000959296 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  34.67 
 
 		 488 aa  289  8e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0856  glycogen synthase  37.42 
 
 		 476 aa  288  1e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00244208  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  37.8 
 
 		 484 aa  288  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  38.48 
 
 		 485 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.86 
 
 		 480 aa  286  5e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  36.86 
 
 		 480 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.2 
 
 		 478 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  36.53 
 
 		 484 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  35.66 
 
 		 480 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  35.45 
 
 		 476 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  35.45 
 
 		 498 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  35.98 
 
 		 484 aa  282  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  35.86 
 
 		 476 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  35.25 
 
 		 498 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.17 
 
 		 484 aa  281  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  35.45 
 
 		 498 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  35.32 
 
 		 498 aa  279  6e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  35.04 
 
 		 480 aa  278  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3501  glycogen synthase  34.28 
 
 		 478 aa  276  6e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.69 
 
 		 482 aa  276  7e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0726  glycogen synthase  35.4 
 
 		 492 aa  274  2.0000000000000002e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1047  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.06 
 
 		 499 aa  274  2.0000000000000002e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1334  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.62 
 
 		 481 aa  274  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000402724  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.51 
 
 		 488 aa  273  7e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1386  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.67 
 
 		 477 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011611  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0555  glycogen synthase  35.16 
 
 		 478 aa  268  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.93 
 
 		 496 aa  268  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.65 
 
 		 498 aa  265  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1221  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.34 
 
 		 482 aa  265  2e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.085382  normal  0.2089 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.35 
 
 		 500 aa  265  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6185  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.97 
 
 		 525 aa  262  8.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0114021 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  34.82 
 
 		 488 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2787  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.27 
 
 		 509 aa  261  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2286  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.62 
 
 		 487 aa  260  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0004  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.53 
 
 		 482 aa  259  9e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0567  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.02 
 
 		 518 aa  258  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1241  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.13 
 
 		 476 aa  258  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1081  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.46 
 
 		 504 aa  258  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41260  predicted protein  35.06 
 
 		 677 aa  258  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.710049 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1696  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33 
 
 		 497 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.08 
 
 		 534 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000776916 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0388  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.64 
 
 		 507 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.83 
 
 		 494 aa  255  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0256  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34 
 
 		 497 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0015526  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0998  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  34.76 
 
 		 489 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0293  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.27 
 
 		 506 aa  253  6e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.61 
 
 		 481 aa  253  7e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  35.59 
 
 		 493 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.37 
 
 		 475 aa  252  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.45 
 
 		 491 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0512  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  34.59 
 
 		 494 aa  251  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.55 
 
 		 485 aa  249  7e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0707  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.48 
 
 		 502 aa  249  8e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.47 
 
 		 587 aa  249  9e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2518  glycogen synthase  35.66 
 
 		 465 aa  248  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0559  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.2 
 
 		 496 aa  247  4e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2043  glycogen synthase  35.02 
 
 		 486 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405007  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0150  glycogen synthase  33.6 
 
 		 476 aa  246  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4121  glycogen synthase  33.6 
 
 		 476 aa  246  6.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.533996  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0226  glycogen synthase  34.55 
 
 		 477 aa  246  8e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0346  glycogen/starch synthase ADP-glucose type  36.16 
 
 		 447 aa  246  9.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.53 
 
 		 491 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2145  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  32.31 
 
 		 473 aa  245  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.619939  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0841  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.26 
 
 		 488 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0251481 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0280  glycogen synthase  34.82 
 
 		 477 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3802  glycogen synthase  33.8 
 
 		 477 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3844  glycogen synthase  33.8 
 
 		 477 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0870  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33 
 
 		 477 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.758112  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3725  glycogen synthase  33.8 
 
 		 477 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3905  glycogen synthase  33.8 
 
 		 477 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.794179  normal  0.424827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2742  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.67 
 
 		 473 aa  244  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.341368  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3736  glycogen synthase  33.8 
 
 		 477 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4003  glycogen synthase  34.21 
 
 		 476 aa  244  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0810  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.34 
 
 		 448 aa  244  3e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0082  glycogen synthase  34.07 
 
 		 477 aa  244  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3934  glycogen synthase  34.88 
 
 		 479 aa  244  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1982  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.58 
 
 		 489 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1582  glycogen synthase  32.41 
 
 		 491 aa  243  5e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0042939  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3837  glycogen synthase  33.07 
 
 		 478 aa  243  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2348  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  34.32 
 
 		 493 aa  243  6e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106928 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4133  glycogen synthase  33.6 
 
 		 479 aa  243  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.74 
 
 		 486 aa  242  9e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.74 
 
 		 486 aa  242  9e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>