More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0100 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2606  glycogen synthase  61.35 
 
 		 513 aa  647    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0718737  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0100  glycogen synthase  100 
 
 		 487 aa  1018    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1517  glycogen synthase  57.58 
 
 		 489 aa  583  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2631  glycogen synthase  58.08 
 
 		 492 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.311536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4463  glycogen synthase  57.55 
 
 		 491 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1960  glycogen synthase  58.16 
 
 		 492 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.69923 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0872  glycogen synthase  52.64 
 
 		 496 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.279274 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0845  glycogen synthase  52.64 
 
 		 496 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40458  predicted protein  38.72 
 
 		 680 aa  335  1e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0545631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41853  predicted protein  36.53 
 
 		 951 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0125571  hitchhiker  0.000959296 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48511  predicted protein  37.13 
 
 		 567 aa  315  9.999999999999999e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0220313  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.9 
 
 		 478 aa  304  3.0000000000000004e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  37.37 
 
 		 485 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  35.15 
 
 		 484 aa  298  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  35.54 
 
 		 484 aa  292  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  35.92 
 
 		 480 aa  290  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3501  glycogen synthase  35.76 
 
 		 478 aa  291  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  34.87 
 
 		 488 aa  291  3e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  35.45 
 
 		 480 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  35.51 
 
 		 476 aa  289  6e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.67 
 
 		 480 aa  289  8e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  35.86 
 
 		 498 aa  288  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  36.07 
 
 		 498 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  35.71 
 
 		 476 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.73 
 
 		 484 aa  286  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  35.86 
 
 		 498 aa  286  5e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  35.71 
 
 		 476 aa  286  5e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  35.01 
 
 		 484 aa  286  5.999999999999999e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  35.66 
 
 		 480 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  35.66 
 
 		 498 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.77 
 
 		 487 aa  283  3.0000000000000004e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1386  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.71 
 
 		 477 aa  281  1e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.56 
 
 		 482 aa  280  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.05 
 
 		 480 aa  280  4e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.29 
 
 		 486 aa  280  5e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.29 
 
 		 486 aa  280  5e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.47 
 
 		 486 aa  279  9e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.69 
 
 		 486 aa  278  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1582  glycogen synthase  35.27 
 
 		 491 aa  277  2e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0042939  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0726  glycogen synthase  33.8 
 
 		 492 aa  276  8e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41260  predicted protein  36.25 
 
 		 677 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.710049 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0344  glycogen synthase  36.31 
 
 		 482 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.35 
 
 		 484 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0004  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.55 
 
 		 482 aa  273  5.000000000000001e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1334  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.45 
 
 		 481 aa  273  7e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000402724  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.96 
 
 		 491 aa  272  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.71 
 
 		 496 aa  271  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.29 
 
 		 475 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0856  glycogen synthase  33.27 
 
 		 476 aa  270  4e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00244208  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1696  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.47 
 
 		 497 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1047  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.47 
 
 		 499 aa  266  5e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.74 
 
 		 587 aa  266  5.999999999999999e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2787  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.2 
 
 		 509 aa  266  7e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0612  glycogen synthase  36.51 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  35.09 
 
 		 486 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0132  glycogen synthase  33.99 
 
 		 479 aa  265  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.31 
 
 		 498 aa  264  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2145  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.68 
 
 		 473 aa  264  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.619939  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.33 
 
 		 481 aa  265  2e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1888  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.74 
 
 		 490 aa  264  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590252  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0386  glycogen synthase  35.14 
 
 		 483 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.28 
 
 		 534 aa  263  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000776916 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1221  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.63 
 
 		 482 aa  263  4e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.085382  normal  0.2089 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2496  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.74 
 
 		 478 aa  262  8.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  34.08 
 
 		 493 aa  261  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0441  glycogen synthase  36.18 
 
 		 482 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0567  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.48 
 
 		 518 aa  262  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.86 
 
 		 494 aa  261  3e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0870  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.67 
 
 		 477 aa  260  3e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.758112  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.6 
 
 		 491 aa  260  4e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0555  glycogen synthase  33.8 
 
 		 478 aa  259  6e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0213  glycogen synthase  34.95 
 
 		 483 aa  259  7e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0707  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.41 
 
 		 502 aa  258  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4501  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.5 
 
 		 460 aa  257  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2043  glycogen synthase  34.61 
 
 		 486 aa  257  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405007  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2664  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.4 
 
 		 480 aa  256  5e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.381394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.15 
 
 		 488 aa  256  6e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5024  glycogen synthase  32.65 
 
 		 501 aa  256  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.671586  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1081  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.27 
 
 		 504 aa  256  7e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2286  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.2 
 
 		 487 aa  256  8e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  33.13 
 
 		 499 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2935  glycogen synthase  34.81 
 
 		 486 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.540363 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  33.4 
 
 		 488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4003  glycogen synthase  33.47 
 
 		 476 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1465  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33 
 
 		 549 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  32.06 
 
 		 500 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.48 
 
 		 475 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0082  glycogen synthase  34.76 
 
 		 477 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1105  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.54 
 
 		 483 aa  253  5.000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1982  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.73 
 
 		 489 aa  253  7e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0810  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.53 
 
 		 448 aa  253  8.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4644  glycogen synthase  32.53 
 
 		 477 aa  252  9.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.755031 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0841  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.01 
 
 		 488 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0251481 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0346  glycogen/starch synthase ADP-glucose type  35.05 
 
 		 447 aa  251  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0781  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.69 
 
 		 463 aa  252  1e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  34.18 
 
 		 485 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0293  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.13 
 
 		 506 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0998  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  33.74 
 
 		 489 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3196  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.81 
 
 		 467 aa  250  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1542  glycogen synthase  34.21 
 
 		 486 aa  250  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>