More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0181 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0181  glycogen synthase  100 
 
 		 474 aa  986    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2606  glycogen synthase  33 
 
 		 513 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0718737  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4463  glycogen synthase  31.66 
 
 		 491 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2631  glycogen synthase  33.87 
 
 		 492 aa  254  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.311536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1960  glycogen synthase  33.33 
 
 		 492 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.69923 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1517  glycogen synthase  32.53 
 
 		 489 aa  248  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0100  glycogen synthase  32.53 
 
 		 487 aa  244  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0845  glycogen synthase  31.27 
 
 		 496 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0872  glycogen synthase  31.27 
 
 		 496 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.279274 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.06 
 
 		 478 aa  227  4e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  32.46 
 
 		 498 aa  226  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1334  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.13 
 
 		 481 aa  225  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000402724  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1105  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  32.33 
 
 		 483 aa  225  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30 
 
 		 500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  31.76 
 
 		 496 aa  221  3e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  30.46 
 
 		 488 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3837  glycogen synthase  31.6 
 
 		 478 aa  220  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1047  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  31.5 
 
 		 499 aa  220  5e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48511  predicted protein  31.07 
 
 		 567 aa  220  5e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0220313  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  30.71 
 
 		 485 aa  216  9e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1696  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.32 
 
 		 497 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3762  glycogen synthase  30.71 
 
 		 478 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  32.61 
 
 		 491 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03281  glycogen synthase  30.78 
 
 		 477 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000154159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0285  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.78 
 
 		 477 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000266989  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03234  hypothetical protein  30.78 
 
 		 477 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000325312  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4741  glycogen synthase  30.78 
 
 		 477 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3711  glycogen synthase  30.78 
 
 		 477 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3629  glycogen synthase  30.78 
 
 		 477 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0283  glycogen synthase  30.78 
 
 		 477 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3908  glycogen synthase  30.78 
 
 		 477 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4133  glycogen synthase  31.29 
 
 		 479 aa  212  9e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  31.98 
 
 		 484 aa  212  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  31.41 
 
 		 481 aa  212  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0856  glycogen synthase  32.66 
 
 		 476 aa  211  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00244208  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3844  glycogen synthase  30.88 
 
 		 477 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3736  glycogen synthase  30.88 
 
 		 477 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3802  glycogen synthase  30.88 
 
 		 477 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3725  glycogen synthase  30.88 
 
 		 477 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0280  glycogen synthase  31.86 
 
 		 477 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3905  glycogen synthase  30.88 
 
 		 477 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.794179  normal  0.424827 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0082  glycogen synthase  31.85 
 
 		 477 aa  210  4e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0555  glycogen synthase  33.47 
 
 		 478 aa  210  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2496  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  31.29 
 
 		 478 aa  209  6e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3934  glycogen synthase  31.29 
 
 		 479 aa  209  8e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  31.45 
 
 		 491 aa  208  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4121  glycogen synthase  31.67 
 
 		 476 aa  209  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.533996  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  33.2 
 
 		 484 aa  209  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0150  glycogen synthase  31.67 
 
 		 476 aa  209  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  31.46 
 
 		 484 aa  208  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1888  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  32.21 
 
 		 490 aa  208  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590252  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0226  glycogen synthase  31.2 
 
 		 477 aa  208  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3895  glycogen synthase  30.38 
 
 		 477 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  31.91 
 
 		 487 aa  207  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  31 
 
 		 480 aa  207  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1386  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.14 
 
 		 477 aa  207  4e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011611  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  31.53 
 
 		 587 aa  207  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4003  glycogen synthase  31.67 
 
 		 476 aa  206  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3115  glycogen synthase  30.72 
 
 		 472 aa  206  6e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  31.33 
 
 		 482 aa  206  9e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.35 
 
 		 486 aa  206  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.35 
 
 		 486 aa  206  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  32.6 
 
 		 484 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  30 
 
 		 476 aa  205  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2787  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  31.11 
 
 		 509 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.43 
 
 		 486 aa  204  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4644  glycogen synthase  30.42 
 
 		 477 aa  203  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.755031 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0542  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.08 
 
 		 490 aa  203  6e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.43 
 
 		 486 aa  203  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2145  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  28.83 
 
 		 473 aa  203  7e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.619939  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  30.32 
 
 		 488 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  29.6 
 
 		 476 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1890  glycogen synthase  30.48 
 
 		 487 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.601172 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  29.4 
 
 		 480 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1596  glycogen synthase  30.83 
 
 		 512 aa  201  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  29.6 
 
 		 480 aa  201  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  30.14 
 
 		 499 aa  201  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3652  glycogen synthase  29.78 
 
 		 480 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.577848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3196  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.8 
 
 		 467 aa  200  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  29.2 
 
 		 480 aa  200  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0004  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.12 
 
 		 482 aa  199  6e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2286  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  32.24 
 
 		 487 aa  199  6e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  29.4 
 
 		 498 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1987  glycogen synthase  29.84 
 
 		 510 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1839  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.14 
 
 		 503 aa  199  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  29.4 
 
 		 498 aa  199  9e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  32.01 
 
 		 485 aa  199  9e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0559  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.07 
 
 		 496 aa  199  9e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340162  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  29.4 
 
 		 498 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40458  predicted protein  30.91 
 
 		 680 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0545631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3501  glycogen synthase  29.61 
 
 		 478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2742  glycogen synthase  29.78 
 
 		 480 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  29.2 
 
 		 476 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2025  glycogen synthase  29.64 
 
 		 532 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  31.7 
 
 		 475 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1988  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  31.12 
 
 		 447 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.983075 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  32.2 
 
 		 480 aa  197  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  31.94 
 
 		 475 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  29.2 
 
 		 498 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2302  glycogen synthase  29.64 
 
 		 510 aa  196  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>