99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2980 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2980  mannonate dehydratase  100 
 
 
391 aa  787    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1596  mannonate dehydratase  62.05 
 
 
394 aa  526  1e-148  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.011047  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4112  mannonate dehydratase  63.5 
 
 
394 aa  520  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34220  D-mannonate dehydratase  65.55 
 
 
392 aa  520  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2778  mannonate dehydratase  61.7 
 
 
391 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.492601  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0987  mannonate dehydratase  63.24 
 
 
398 aa  513  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3238  mannonate dehydratase  62.98 
 
 
396 aa  509  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186092 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2767  mannonate dehydratase  60.51 
 
 
396 aa  509  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0275489  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3323  mannonate dehydratase  63.24 
 
 
398 aa  509  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2699  mannonate dehydratase  60.41 
 
 
397 aa  508  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1509  mannonate dehydratase  60.41 
 
 
397 aa  508  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2778  mannonate dehydratase  60.41 
 
 
397 aa  508  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04191  mannonate dehydratase  61.18 
 
 
394 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3675  mannonate dehydratase  61.18 
 
 
394 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4849  mannonate dehydratase  60.93 
 
 
394 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0975  mannonate dehydratase  62.31 
 
 
396 aa  508  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4548  mannonate dehydratase  60.93 
 
 
394 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4920  mannonate dehydratase  60.93 
 
 
394 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04153  hypothetical protein  61.18 
 
 
394 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5828  mannonate dehydratase  60.93 
 
 
394 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3317  mannonate dehydratase  60.93 
 
 
394 aa  504  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0151391  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3480  mannonate dehydratase  60.93 
 
 
394 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3387  mannonate dehydratase  60.93 
 
 
394 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.20257 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3307  mannonate dehydratase  60.93 
 
 
394 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.041841  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3381  mannonate dehydratase  60.93 
 
 
394 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  normal  0.591924 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4792  mannonate dehydratase  60.15 
 
 
394 aa  500  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3742  mannonate dehydratase  60.62 
 
 
389 aa  499  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.179437  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0136  mannonate dehydratase  58.87 
 
 
394 aa  494  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0645545  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4123  mannonate dehydratase  60.46 
 
 
395 aa  478  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1059  mannonate dehydratase  57.18 
 
 
399 aa  462  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.568078 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1501  mannonate dehydratase  57.51 
 
 
393 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4191  mannonate dehydratase  53.9 
 
 
394 aa  448  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.549185  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2123  mannonate hydrolase  57.61 
 
 
398 aa  443  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.517153  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4306  mannonate dehydratase  55.84 
 
 
401 aa  438  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.555799  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3897  mannonate dehydratase  54.59 
 
 
397 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.472347  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1314  mannonate dehydratase  52.32 
 
 
398 aa  436  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0977  mannonate dehydratase  57.87 
 
 
398 aa  438  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0397618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6196  mannonate dehydratase  54.1 
 
 
393 aa  425  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3873  mannonate dehydratase  56.02 
 
 
389 aa  420  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.432429 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1273  mannonate dehydratase  50.77 
 
 
397 aa  418  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00133457  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6490  mannonate dehydratase  51.79 
 
 
395 aa  411  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0814  mannonate dehydratase  51.89 
 
 
401 aa  412  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3648  mannonate dehydratase  50 
 
 
399 aa  412  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.63309  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1891  mannonate dehydratase  51.04 
 
 
395 aa  410  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4843  mannonate dehydratase  52.59 
 
 
925 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0781213  hitchhiker  0.00115783 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0764  mannonate dehydratase  51.39 
 
 
401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3684  mannonate dehydratase  53.57 
 
 
402 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.110179 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6000  mannonate dehydratase  50.77 
 
 
395 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4095  mannonate dehydratase  50.13 
 
 
405 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.780136  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2262  mannonate dehydratase  49.22 
 
 
391 aa  388  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.192874 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4498  mannonate dehydratase  49.12 
 
 
404 aa  383  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0165988  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5061  mannonate dehydratase  49.63 
 
 
402 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.586896 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0773  mannonate dehydratase  51.01 
 
 
406 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0669875  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2429  mannonate dehydratase  50.5 
 
 
406 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.328404  normal  0.0532217 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0406  mannonate dehydratase  52.02 
 
 
404 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1995  mannonate dehydratase  46.63 
 
 
387 aa  368  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1858  mannonate dehydratase  50.9 
 
 
393 aa  345  6e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0429612  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5748  mannonate dehydratase  41.24 
 
 
352 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.118484  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0430  mannonate dehydratase  40.76 
 
 
359 aa  270  4e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.174722 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4047  mannonate dehydratase  38.11 
 
 
345 aa  268  1e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2289  mannonate dehydratase  41.81 
 
 
351 aa  266  5e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0856  mannonate dehydratase  38.89 
 
 
363 aa  265  8.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0947  mannonate dehydratase  39.29 
 
 
348 aa  264  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0702  mannonate dehydratase  38.93 
 
 
348 aa  257  3e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4154  mannonate dehydratase  39.64 
 
 
350 aa  250  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.650866  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5811  mannonate dehydratase  39.13 
 
 
351 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3876  mannonate dehydratase  39.13 
 
 
351 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.854128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4493  mannonate dehydratase  38.83 
 
 
362 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1358  mannonate dehydratase  38.62 
 
 
352 aa  249  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0361193 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0140  mannonate dehydratase  36.36 
 
 
360 aa  249  8e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1674  mannonate dehydratase  35.79 
 
 
348 aa  248  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1306  mannonate dehydratase  36.04 
 
 
352 aa  245  9e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2038  mannonate dehydratase  36.11 
 
 
355 aa  242  1e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1601  mannonate dehydratase  36.48 
 
 
356 aa  239  5e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0855  mannonate dehydratase  37.66 
 
 
360 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0878  mannonate dehydratase  37.66 
 
 
360 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1745  mannonate dehydratase  36.2 
 
 
354 aa  236  7e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2699  mannonate dehydratase  36.11 
 
 
371 aa  229  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1061  mannonate dehydratase  35.03 
 
 
358 aa  216  8e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2667  mannonate dehydratase  36.12 
 
 
373 aa  208  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3895  Mannonate dehydratase  29.13 
 
 
370 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0869  Mannonate dehydratase  30.42 
 
 
314 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4672  Mannonate dehydratase  30.84 
 
 
318 aa  122  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3719  Mannonate dehydratase  29.63 
 
 
353 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.320611  normal  0.458256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0595  Mannonate dehydratase  25.19 
 
 
373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0858512  normal  0.118058 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2239  Mannonate dehydratase  40.76 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.314413 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4207  Mannonate dehydratase  28.07 
 
 
297 aa  120  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.99596  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2506  Mannonate dehydratase  26.91 
 
 
328 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.636671  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1821  mannonate dehydratase  32.47 
 
 
278 aa  104  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.640781  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1160  mannonate dehydratase  25.13 
 
 
342 aa  99.8  8e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4342  mannonate dehydratase  40.26 
 
 
356 aa  87.8  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3907  Mannonate dehydratase  26.73 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00606211  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4211  Mannonate dehydratase  26.09 
 
 
360 aa  72.8  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5616  mannonate dehydratase  32.21 
 
 
337 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4519  D-mannonate dehydratase  32.68 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310044  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1690  Mannonate dehydratase  33.11 
 
 
324 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24599  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1876  Mannonate dehydratase  32.45 
 
 
324 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.463874  normal  0.188716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1069  Mannonate dehydratase  26.32 
 
 
375 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1408  Mannonate dehydratase  24.4 
 
 
375 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0118662  normal  0.71543 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>