97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1273 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1273  mannonate dehydratase  100 
 
 		 397 aa  829    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00133457  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4123  mannonate dehydratase  53.33 
 
 		 395 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2778  mannonate dehydratase  55.06 
 
 		 391 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.492601  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3675  mannonate dehydratase  53.08 
 
 		 394 aa  450  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1059  mannonate dehydratase  51.78 
 
 		 399 aa  449  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.568078 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04153  hypothetical protein  53.08 
 
 		 394 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5828  mannonate dehydratase  52.82 
 
 		 394 aa  449  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04191  mannonate dehydratase  53.08 
 
 		 394 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4849  mannonate dehydratase  52.82 
 
 		 394 aa  449  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4920  mannonate dehydratase  52.82 
 
 		 394 aa  449  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4548  mannonate dehydratase  52.82 
 
 		 394 aa  449  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4792  mannonate dehydratase  52.82 
 
 		 394 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1501  mannonate dehydratase  53.12 
 
 		 393 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4112  mannonate dehydratase  54.81 
 
 		 394 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3742  mannonate dehydratase  52.99 
 
 		 389 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.179437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1596  mannonate dehydratase  52.82 
 
 		 394 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.011047  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3387  mannonate dehydratase  52.05 
 
 		 394 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.20257 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3381  mannonate dehydratase  52.05 
 
 		 394 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  normal  0.591924 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3317  mannonate dehydratase  51.79 
 
 		 394 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0151391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3307  mannonate dehydratase  52.05 
 
 		 394 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.041841  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3480  mannonate dehydratase  52.05 
 
 		 394 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0975  mannonate dehydratase  52.93 
 
 		 396 aa  436  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4191  mannonate dehydratase  51.4 
 
 		 394 aa  435  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.549185  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3648  mannonate dehydratase  53.25 
 
 		 399 aa  437  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.63309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0987  mannonate dehydratase  52.56 
 
 		 398 aa  432  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0136  mannonate dehydratase  53.51 
 
 		 394 aa  432  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0645545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1314  mannonate dehydratase  51.31 
 
 		 398 aa  431  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1891  mannonate dehydratase  52.6 
 
 		 395 aa  429  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2699  mannonate dehydratase  51.28 
 
 		 397 aa  425  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2778  mannonate dehydratase  51.28 
 
 		 397 aa  425  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1509  mannonate dehydratase  51.28 
 
 		 397 aa  425  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3238  mannonate dehydratase  53.08 
 
 		 396 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186092 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4498  mannonate dehydratase  49.12 
 
 		 404 aa  425  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0165988  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3323  mannonate dehydratase  52.05 
 
 		 398 aa  427  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2767  mannonate dehydratase  50.38 
 
 		 396 aa  426  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0275489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2980  mannonate dehydratase  50.77 
 
 		 391 aa  418  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34220  D-mannonate dehydratase  51.02 
 
 		 392 aa  417  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4095  mannonate dehydratase  48.36 
 
 		 405 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.780136  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2123  mannonate hydrolase  48.74 
 
 		 398 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.517153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1858  mannonate dehydratase  52.94 
 
 		 393 aa  402  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0429612  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5061  mannonate dehydratase  47.36 
 
 		 402 aa  403  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.586896 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0977  mannonate dehydratase  49.11 
 
 		 398 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0397618  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0773  mannonate dehydratase  48 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0669875  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4843  mannonate dehydratase  47.41 
 
 		 925 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0781213  hitchhiker  0.00115783 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3684  mannonate dehydratase  47.83 
 
 		 402 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.110179 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3873  mannonate dehydratase  47.46 
 
 		 389 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.432429 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2429  mannonate dehydratase  47.75 
 
 		 406 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.328404  normal  0.0532217 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3897  mannonate dehydratase  47.95 
 
 		 397 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.472347  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0406  mannonate dehydratase  47.24 
 
 		 404 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2262  mannonate dehydratase  46.61 
 
 		 391 aa  385  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.192874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6196  mannonate dehydratase  46.92 
 
 		 393 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4306  mannonate dehydratase  45.52 
 
 		 401 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.555799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1995  mannonate dehydratase  45.71 
 
 		 387 aa  365  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0814  mannonate dehydratase  47.47 
 
 		 401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6490  mannonate dehydratase  44.81 
 
 		 395 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0764  mannonate dehydratase  46.72 
 
 		 401 aa  353  4e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6000  mannonate dehydratase  44.56 
 
 		 395 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4047  mannonate dehydratase  38.01 
 
 		 345 aa  268  1e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0856  mannonate dehydratase  39.04 
 
 		 363 aa  262  6e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1674  mannonate dehydratase  37.19 
 
 		 348 aa  261  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0947  mannonate dehydratase  38.46 
 
 		 348 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1306  mannonate dehydratase  35.07 
 
 		 352 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0430  mannonate dehydratase  38.1 
 
 		 359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.174722 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1358  mannonate dehydratase  38.35 
 
 		 352 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0361193 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4154  mannonate dehydratase  37.97 
 
 		 350 aa  252  7e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.650866  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3876  mannonate dehydratase  37.72 
 
 		 351 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.854128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4493  mannonate dehydratase  37.44 
 
 		 362 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5811  mannonate dehydratase  37.72 
 
 		 351 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0140  mannonate dehydratase  38.58 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2289  mannonate dehydratase  35.97 
 
 		 351 aa  245  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5748  mannonate dehydratase  36.91 
 
 		 352 aa  243  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.118484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0878  mannonate dehydratase  35.82 
 
 		 360 aa  243  6e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0855  mannonate dehydratase  35.82 
 
 		 360 aa  243  6e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0702  mannonate dehydratase  35.37 
 
 		 348 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2699  mannonate dehydratase  35.62 
 
 		 371 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1745  mannonate dehydratase  36.22 
 
 		 354 aa  231  2e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2038  mannonate dehydratase  31.83 
 
 		 355 aa  224  2e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1601  mannonate dehydratase  33.5 
 
 		 356 aa  211  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2667  mannonate dehydratase  35.45 
 
 		 373 aa  202  7e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1061  mannonate dehydratase  32.91 
 
 		 358 aa  192  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0595  Mannonate dehydratase  29.75 
 
 		 373 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0858512  normal  0.118058 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3895  Mannonate dehydratase  29.64 
 
 		 370 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4672  Mannonate dehydratase  28.77 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4207  Mannonate dehydratase  29.34 
 
 		 297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.99596  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2239  Mannonate dehydratase  27.95 
 
 		 317 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.314413 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3719  Mannonate dehydratase  26.42 
 
 		 353 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.320611  normal  0.458256 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0869  Mannonate dehydratase  34.66 
 
 		 314 aa  113  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1821  mannonate dehydratase  35.68 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.640781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2506  Mannonate dehydratase  25.86 
 
 		 328 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.636671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1160  mannonate dehydratase  25.07 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4211  Mannonate dehydratase  24.28 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4342  mannonate dehydratase  36.44 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3907  Mannonate dehydratase  25.76 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00606211  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5616  mannonate dehydratase  37.07 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4519  D-mannonate dehydratase  34.78 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310044  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1690  Mannonate dehydratase  35.34 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1876  Mannonate dehydratase  35.34 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.463874  normal  0.188716 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>