97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3897 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3897  mannonate dehydratase  100 
 
 		 397 aa  813    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.472347  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2123  mannonate hydrolase  59.59 
 
 		 398 aa  487  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.517153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0977  mannonate dehydratase  62.15 
 
 		 398 aa  485  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0397618  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2980  mannonate dehydratase  54.59 
 
 		 391 aa  436  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1314  mannonate dehydratase  50.39 
 
 		 398 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4123  mannonate dehydratase  49.35 
 
 		 395 aa  409  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1596  mannonate dehydratase  49.87 
 
 		 394 aa  410  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.011047  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4095  mannonate dehydratase  50.62 
 
 		 405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.780136  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3387  mannonate dehydratase  48.85 
 
 		 394 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.20257 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3675  mannonate dehydratase  49.1 
 
 		 394 aa  404  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4548  mannonate dehydratase  48.85 
 
 		 394 aa  404  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4920  mannonate dehydratase  48.85 
 
 		 394 aa  404  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3742  mannonate dehydratase  48.96 
 
 		 389 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.179437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4849  mannonate dehydratase  48.85 
 
 		 394 aa  404  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4792  mannonate dehydratase  48.59 
 
 		 394 aa  401  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04153  hypothetical protein  49.1 
 
 		 394 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3381  mannonate dehydratase  48.85 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  normal  0.591924 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3317  mannonate dehydratase  48.85 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0151391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3307  mannonate dehydratase  48.85 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.041841  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3480  mannonate dehydratase  48.85 
 
 		 394 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5828  mannonate dehydratase  48.85 
 
 		 394 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4112  mannonate dehydratase  49.49 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04191  mannonate dehydratase  49.1 
 
 		 394 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2767  mannonate dehydratase  49.1 
 
 		 396 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0275489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2778  mannonate dehydratase  48.7 
 
 		 391 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.492601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0136  mannonate dehydratase  48.96 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0645545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3684  mannonate dehydratase  50.89 
 
 		 402 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.110179 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2699  mannonate dehydratase  47.57 
 
 		 397 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2778  mannonate dehydratase  47.57 
 
 		 397 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1509  mannonate dehydratase  47.57 
 
 		 397 aa  394  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0987  mannonate dehydratase  48.47 
 
 		 398 aa  391  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1273  mannonate dehydratase  47.95 
 
 		 397 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00133457  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3648  mannonate dehydratase  47.73 
 
 		 399 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.63309  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4498  mannonate dehydratase  50.5 
 
 		 404 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0165988  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34220  D-mannonate dehydratase  49.24 
 
 		 392 aa  388  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5061  mannonate dehydratase  48.62 
 
 		 402 aa  388  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.586896 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0975  mannonate dehydratase  47.15 
 
 		 396 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3323  mannonate dehydratase  47.7 
 
 		 398 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3238  mannonate dehydratase  48.85 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186092 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4191  mannonate dehydratase  45.66 
 
 		 394 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.549185  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1059  mannonate dehydratase  46.85 
 
 		 399 aa  382  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.568078 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1501  mannonate dehydratase  45.19 
 
 		 393 aa  375  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6196  mannonate dehydratase  46.61 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4306  mannonate dehydratase  46.15 
 
 		 401 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.555799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3873  mannonate dehydratase  47.57 
 
 		 389 aa  372  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.432429 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0814  mannonate dehydratase  47.13 
 
 		 401 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0764  mannonate dehydratase  46.88 
 
 		 401 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0406  mannonate dehydratase  48.49 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1891  mannonate dehydratase  43.43 
 
 		 395 aa  365  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0773  mannonate dehydratase  48.25 
 
 		 406 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0669875  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2429  mannonate dehydratase  48.25 
 
 		 406 aa  364  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.328404  normal  0.0532217 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6490  mannonate dehydratase  45.43 
 
 		 395 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2262  mannonate dehydratase  43.6 
 
 		 391 aa  345  6e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.192874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4843  mannonate dehydratase  44.16 
 
 		 925 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0781213  hitchhiker  0.00115783 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6000  mannonate dehydratase  44.42 
 
 		 395 aa  342  9e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1858  mannonate dehydratase  48.84 
 
 		 393 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0429612  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1995  mannonate dehydratase  42.86 
 
 		 387 aa  334  2e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4047  mannonate dehydratase  36.96 
 
 		 345 aa  247  3e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0430  mannonate dehydratase  35.7 
 
 		 359 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.174722 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4154  mannonate dehydratase  39.03 
 
 		 350 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.650866  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5748  mannonate dehydratase  36.71 
 
 		 352 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.118484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1674  mannonate dehydratase  35.28 
 
 		 348 aa  239  5e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4493  mannonate dehydratase  37.72 
 
 		 362 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5811  mannonate dehydratase  37.76 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1358  mannonate dehydratase  38.27 
 
 		 352 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0361193 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3876  mannonate dehydratase  37.76 
 
 		 351 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.854128  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0947  mannonate dehydratase  37.24 
 
 		 348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2699  mannonate dehydratase  35.32 
 
 		 371 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2038  mannonate dehydratase  34.26 
 
 		 355 aa  227  3e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1306  mannonate dehydratase  33.59 
 
 		 352 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0140  mannonate dehydratase  34.68 
 
 		 360 aa  223  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0856  mannonate dehydratase  34.18 
 
 		 363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2289  mannonate dehydratase  36.64 
 
 		 351 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0878  mannonate dehydratase  33.5 
 
 		 360 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0855  mannonate dehydratase  33.5 
 
 		 360 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0702  mannonate dehydratase  34.26 
 
 		 348 aa  218  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1745  mannonate dehydratase  34.17 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2667  mannonate dehydratase  34.63 
 
 		 373 aa  206  7e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1601  mannonate dehydratase  32.92 
 
 		 356 aa  205  1e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1061  mannonate dehydratase  34.6 
 
 		 358 aa  202  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3895  Mannonate dehydratase  31.01 
 
 		 370 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0595  Mannonate dehydratase  27.61 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0858512  normal  0.118058 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4207  Mannonate dehydratase  27.54 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.99596  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0869  Mannonate dehydratase  35.45 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2239  Mannonate dehydratase  27.27 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.314413 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4672  Mannonate dehydratase  36.81 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1821  mannonate dehydratase  27.73 
 
 		 278 aa  89  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.640781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3719  Mannonate dehydratase  34.39 
 
 		 353 aa  89  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.320611  normal  0.458256 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1160  mannonate dehydratase  25.28 
 
 		 342 aa  87  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2506  Mannonate dehydratase  38.3 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.636671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4211  Mannonate dehydratase  30.3 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4342  mannonate dehydratase  33.33 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3907  Mannonate dehydratase  30.46 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00606211  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5616  mannonate dehydratase  30.83 
 
 		 337 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4519  D-mannonate dehydratase  30.58 
 
 		 331 aa  54.7  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310044  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1690  Mannonate dehydratase  31.25 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1876  Mannonate dehydratase  30.47 
 
 		 324 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.463874  normal  0.188716 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>