99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1601 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1601  mannonate dehydratase  100 
 
 
356 aa  736    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1061  mannonate dehydratase  57.26 
 
 
358 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0856  mannonate dehydratase  56.3 
 
 
363 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1745  mannonate dehydratase  56.9 
 
 
354 aa  429  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0430  mannonate dehydratase  56.02 
 
 
359 aa  421  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.174722 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0878  mannonate dehydratase  53.78 
 
 
360 aa  420  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0855  mannonate dehydratase  53.78 
 
 
360 aa  420  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0140  mannonate dehydratase  55.93 
 
 
360 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2699  mannonate dehydratase  50.14 
 
 
371 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2038  mannonate dehydratase  50.7 
 
 
355 aa  383  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5748  mannonate dehydratase  50.99 
 
 
352 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.118484  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4493  mannonate dehydratase  50.42 
 
 
362 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5811  mannonate dehydratase  50.7 
 
 
351 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0947  mannonate dehydratase  51.99 
 
 
348 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4047  mannonate dehydratase  51.98 
 
 
345 aa  376  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3876  mannonate dehydratase  50.42 
 
 
351 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.854128  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4154  mannonate dehydratase  49.58 
 
 
350 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.650866  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1358  mannonate dehydratase  49.58 
 
 
352 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0361193 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1674  mannonate dehydratase  48.46 
 
 
348 aa  364  1e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2289  mannonate dehydratase  47.46 
 
 
351 aa  348  6e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0702  mannonate dehydratase  47.34 
 
 
348 aa  348  8e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1306  mannonate dehydratase  47.46 
 
 
352 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2667  mannonate dehydratase  42.43 
 
 
373 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3307  mannonate dehydratase  38.07 
 
 
394 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.041841  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3317  mannonate dehydratase  38.07 
 
 
394 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0151391  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3381  mannonate dehydratase  38.07 
 
 
394 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  normal  0.591924 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3480  mannonate dehydratase  38.07 
 
 
394 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3387  mannonate dehydratase  38.07 
 
 
394 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.20257 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4920  mannonate dehydratase  38.32 
 
 
394 aa  243  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5828  mannonate dehydratase  38.32 
 
 
394 aa  243  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4849  mannonate dehydratase  38.32 
 
 
394 aa  243  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.908596 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04191  mannonate dehydratase  38.32 
 
 
394 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04153  hypothetical protein  38.32 
 
 
394 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3675  mannonate dehydratase  38.32 
 
 
394 aa  243  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4548  mannonate dehydratase  38.32 
 
 
394 aa  243  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3742  mannonate dehydratase  38.5 
 
 
389 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.179437  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2980  mannonate dehydratase  36.48 
 
 
391 aa  239  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4792  mannonate dehydratase  38.07 
 
 
394 aa  238  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1314  mannonate dehydratase  35.97 
 
 
398 aa  237  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2699  mannonate dehydratase  37.47 
 
 
397 aa  235  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1509  mannonate dehydratase  37.47 
 
 
397 aa  235  9e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2778  mannonate dehydratase  37.47 
 
 
397 aa  235  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1501  mannonate dehydratase  35.73 
 
 
393 aa  230  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4306  mannonate dehydratase  34.16 
 
 
401 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.555799  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4843  mannonate dehydratase  35.29 
 
 
925 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0781213  hitchhiker  0.00115783 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2262  mannonate dehydratase  37.05 
 
 
391 aa  226  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.192874 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0975  mannonate dehydratase  35.61 
 
 
396 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4191  mannonate dehydratase  36.3 
 
 
394 aa  224  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.549185  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6196  mannonate dehydratase  35.34 
 
 
393 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4112  mannonate dehydratase  36.18 
 
 
394 aa  223  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3873  mannonate dehydratase  33.59 
 
 
389 aa  223  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.432429 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3238  mannonate dehydratase  35.93 
 
 
396 aa  223  6e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186092 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4123  mannonate dehydratase  35.52 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2778  mannonate dehydratase  35.62 
 
 
391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.492601  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2767  mannonate dehydratase  35.55 
 
 
396 aa  220  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0275489  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1596  mannonate dehydratase  34.59 
 
 
394 aa  218  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.011047  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0987  mannonate dehydratase  34.42 
 
 
398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3323  mannonate dehydratase  34.5 
 
 
398 aa  216  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34220  D-mannonate dehydratase  32.74 
 
 
392 aa  212  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1273  mannonate dehydratase  33.5 
 
 
397 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00133457  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1059  mannonate dehydratase  33.5 
 
 
399 aa  210  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.568078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2123  mannonate hydrolase  33 
 
 
398 aa  209  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.517153  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1995  mannonate dehydratase  35.86 
 
 
387 aa  207  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0136  mannonate dehydratase  33.76 
 
 
394 aa  207  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0645545  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0977  mannonate dehydratase  34.43 
 
 
398 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0397618  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1891  mannonate dehydratase  32.98 
 
 
395 aa  206  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3897  mannonate dehydratase  32.92 
 
 
397 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.472347  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3648  mannonate dehydratase  31.85 
 
 
399 aa  202  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.63309  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3684  mannonate dehydratase  32.58 
 
 
402 aa  192  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.110179 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1858  mannonate dehydratase  32.65 
 
 
393 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0429612  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4498  mannonate dehydratase  31.17 
 
 
404 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0165988  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0406  mannonate dehydratase  30.35 
 
 
404 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4095  mannonate dehydratase  30.71 
 
 
405 aa  179  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.780136  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2429  mannonate dehydratase  30.45 
 
 
406 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.328404  normal  0.0532217 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0773  mannonate dehydratase  30.2 
 
 
406 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0669875  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6490  mannonate dehydratase  30.13 
 
 
395 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6000  mannonate dehydratase  31.23 
 
 
395 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5061  mannonate dehydratase  28.82 
 
 
402 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.586896 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0764  mannonate dehydratase  29.97 
 
 
401 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3895  Mannonate dehydratase  29.28 
 
 
370 aa  163  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0814  mannonate dehydratase  30.4 
 
 
401 aa  162  6e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0595  Mannonate dehydratase  29.17 
 
 
373 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0858512  normal  0.118058 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0869  Mannonate dehydratase  32.5 
 
 
314 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3719  Mannonate dehydratase  27.64 
 
 
353 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.320611  normal  0.458256 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2506  Mannonate dehydratase  29.69 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.636671  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4207  Mannonate dehydratase  28.16 
 
 
297 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.99596  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4672  Mannonate dehydratase  28.39 
 
 
318 aa  123  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2239  Mannonate dehydratase  28.82 
 
 
317 aa  119  7.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.314413 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4342  mannonate dehydratase  27.68 
 
 
356 aa  115  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1160  mannonate dehydratase  24.84 
 
 
342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4211  Mannonate dehydratase  27.55 
 
 
360 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1821  mannonate dehydratase  34.04 
 
 
278 aa  100  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.640781  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3907  Mannonate dehydratase  25.96 
 
 
347 aa  97.4  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00606211  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5616  mannonate dehydratase  26.67 
 
 
337 aa  89.7  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4519  D-mannonate dehydratase  25.15 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310044  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1876  Mannonate dehydratase  25 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.463874  normal  0.188716 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1690  Mannonate dehydratase  25.85 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24599  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1408  Mannonate dehydratase  26.09 
 
 
375 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0118662  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1069  Mannonate dehydratase  23.26 
 
 
375 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>