97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0977 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0977  mannonate dehydratase  100 
 
 		 398 aa  798    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0397618  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2123  mannonate hydrolase  67.43 
 
 		 398 aa  541  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.517153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3897  mannonate dehydratase  62.15 
 
 		 397 aa  485  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.472347  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1596  mannonate dehydratase  54.57 
 
 		 394 aa  450  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.011047  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3675  mannonate dehydratase  54.48 
 
 		 394 aa  443  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04153  hypothetical protein  54.48 
 
 		 394 aa  443  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5828  mannonate dehydratase  54.22 
 
 		 394 aa  442  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4792  mannonate dehydratase  53.96 
 
 		 394 aa  442  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4849  mannonate dehydratase  54.22 
 
 		 394 aa  442  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4920  mannonate dehydratase  54.22 
 
 		 394 aa  442  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4548  mannonate dehydratase  54.22 
 
 		 394 aa  442  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04191  mannonate dehydratase  54.48 
 
 		 394 aa  443  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0975  mannonate dehydratase  55.14 
 
 		 396 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3742  mannonate dehydratase  54.24 
 
 		 389 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.179437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4112  mannonate dehydratase  55.5 
 
 		 394 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2767  mannonate dehydratase  54.14 
 
 		 396 aa  439  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0275489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0987  mannonate dehydratase  55.5 
 
 		 398 aa  436  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2980  mannonate dehydratase  57.87 
 
 		 391 aa  438  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1509  mannonate dehydratase  53.2 
 
 		 397 aa  434  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3307  mannonate dehydratase  52.94 
 
 		 394 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.041841  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3317  mannonate dehydratase  52.94 
 
 		 394 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0151391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3381  mannonate dehydratase  52.94 
 
 		 394 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  normal  0.591924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3387  mannonate dehydratase  53.2 
 
 		 394 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.20257 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2778  mannonate dehydratase  53.2 
 
 		 397 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3480  mannonate dehydratase  53.2 
 
 		 394 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3238  mannonate dehydratase  56.27 
 
 		 396 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186092 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2699  mannonate dehydratase  53.2 
 
 		 397 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3323  mannonate dehydratase  54.73 
 
 		 398 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1314  mannonate dehydratase  52.86 
 
 		 398 aa  422  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4123  mannonate dehydratase  52.84 
 
 		 395 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2778  mannonate dehydratase  51.4 
 
 		 391 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.492601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1501  mannonate dehydratase  50.38 
 
 		 393 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4095  mannonate dehydratase  52.26 
 
 		 405 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.780136  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4191  mannonate dehydratase  48.98 
 
 		 394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.549185  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3648  mannonate dehydratase  50 
 
 		 399 aa  404  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.63309  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6196  mannonate dehydratase  51.3 
 
 		 393 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0136  mannonate dehydratase  50.64 
 
 		 394 aa  404  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0645545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1273  mannonate dehydratase  49.11 
 
 		 397 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00133457  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1059  mannonate dehydratase  50.63 
 
 		 399 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.568078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4306  mannonate dehydratase  49.87 
 
 		 401 aa  395  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.555799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34220  D-mannonate dehydratase  53.3 
 
 		 392 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3873  mannonate dehydratase  51.9 
 
 		 389 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.432429 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5061  mannonate dehydratase  52.26 
 
 		 402 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.586896 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3684  mannonate dehydratase  52.79 
 
 		 402 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.110179 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0773  mannonate dehydratase  51.76 
 
 		 406 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0669875  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4498  mannonate dehydratase  51.01 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0165988  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1891  mannonate dehydratase  47.31 
 
 		 395 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0406  mannonate dehydratase  51.77 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2429  mannonate dehydratase  51.76 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.328404  normal  0.0532217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2262  mannonate dehydratase  46.61 
 
 		 391 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.192874 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1858  mannonate dehydratase  52.42 
 
 		 393 aa  361  2e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0429612  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4843  mannonate dehydratase  46.67 
 
 		 925 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0781213  hitchhiker  0.00115783 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6490  mannonate dehydratase  47.73 
 
 		 395 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6000  mannonate dehydratase  47.73 
 
 		 395 aa  351  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0814  mannonate dehydratase  47.72 
 
 		 401 aa  345  8.999999999999999e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1995  mannonate dehydratase  44.25 
 
 		 387 aa  345  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0764  mannonate dehydratase  46.95 
 
 		 401 aa  342  7e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5811  mannonate dehydratase  43.04 
 
 		 351 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4493  mannonate dehydratase  42.46 
 
 		 362 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3876  mannonate dehydratase  42.78 
 
 		 351 aa  272  9e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.854128  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0947  mannonate dehydratase  40.76 
 
 		 348 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1358  mannonate dehydratase  42.28 
 
 		 352 aa  269  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0361193 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4154  mannonate dehydratase  42.17 
 
 		 350 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.650866  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5748  mannonate dehydratase  41.21 
 
 		 352 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.118484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4047  mannonate dehydratase  37.47 
 
 		 345 aa  256  5e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0430  mannonate dehydratase  38 
 
 		 359 aa  255  8e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.174722 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2289  mannonate dehydratase  40.86 
 
 		 351 aa  252  8.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0856  mannonate dehydratase  38 
 
 		 363 aa  250  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1306  mannonate dehydratase  34.59 
 
 		 352 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2699  mannonate dehydratase  37.28 
 
 		 371 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0140  mannonate dehydratase  36.09 
 
 		 360 aa  233  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1674  mannonate dehydratase  34.09 
 
 		 348 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0702  mannonate dehydratase  35.77 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2038  mannonate dehydratase  33.5 
 
 		 355 aa  228  2e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0855  mannonate dehydratase  35.16 
 
 		 360 aa  227  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0878  mannonate dehydratase  35.16 
 
 		 360 aa  227  2e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1745  mannonate dehydratase  36.13 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1601  mannonate dehydratase  34.43 
 
 		 356 aa  206  4e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1061  mannonate dehydratase  33.17 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2667  mannonate dehydratase  33.58 
 
 		 373 aa  194  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0595  Mannonate dehydratase  30.47 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0858512  normal  0.118058 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3895  Mannonate dehydratase  31.45 
 
 		 370 aa  133  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4207  Mannonate dehydratase  39.55 
 
 		 297 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.99596  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0869  Mannonate dehydratase  35.26 
 
 		 314 aa  113  6e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2239  Mannonate dehydratase  39.2 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.314413 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3719  Mannonate dehydratase  28.49 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.320611  normal  0.458256 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4672  Mannonate dehydratase  36.36 
 
 		 318 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1821  mannonate dehydratase  30.22 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.640781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1160  mannonate dehydratase  26.2 
 
 		 342 aa  98.6  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2506  Mannonate dehydratase  37.08 
 
 		 328 aa  94.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.636671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4211  Mannonate dehydratase  29.41 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4342  mannonate dehydratase  32.5 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3907  Mannonate dehydratase  34.02 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00606211  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4519  D-mannonate dehydratase  26.49 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310044  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1690  Mannonate dehydratase  32.76 
 
 		 324 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1876  Mannonate dehydratase  32.76 
 
 		 324 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.463874  normal  0.188716 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5616  mannonate dehydratase  31.9 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>