97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3684 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3684  mannonate dehydratase  100 
 
 		 402 aa  820    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.110179 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5061  mannonate dehydratase  60.4 
 
 		 402 aa  500  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.586896 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4095  mannonate dehydratase  58.79 
 
 		 405 aa  486  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.780136  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2429  mannonate dehydratase  60 
 
 		 406 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.328404  normal  0.0532217 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0406  mannonate dehydratase  59.05 
 
 		 404 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0773  mannonate dehydratase  59.75 
 
 		 406 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0669875  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4498  mannonate dehydratase  55.94 
 
 		 404 aa  467  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0165988  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3381  mannonate dehydratase  54.29 
 
 		 394 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  normal  0.591924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3387  mannonate dehydratase  54.04 
 
 		 394 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.20257 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3317  mannonate dehydratase  54.29 
 
 		 394 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0151391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3307  mannonate dehydratase  54.29 
 
 		 394 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.041841  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3480  mannonate dehydratase  54.04 
 
 		 394 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0987  mannonate dehydratase  56.63 
 
 		 398 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3323  mannonate dehydratase  56.63 
 
 		 398 aa  444  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04191  mannonate dehydratase  53.03 
 
 		 394 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5828  mannonate dehydratase  53.28 
 
 		 394 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4849  mannonate dehydratase  53.28 
 
 		 394 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4920  mannonate dehydratase  53.28 
 
 		 394 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4548  mannonate dehydratase  53.28 
 
 		 394 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04153  hypothetical protein  53.03 
 
 		 394 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3675  mannonate dehydratase  53.03 
 
 		 394 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4792  mannonate dehydratase  52.78 
 
 		 394 aa  437  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4112  mannonate dehydratase  55.13 
 
 		 394 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3742  mannonate dehydratase  54.29 
 
 		 389 aa  433  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.179437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0975  mannonate dehydratase  53.69 
 
 		 396 aa  425  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2778  mannonate dehydratase  53.57 
 
 		 397 aa  428  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2699  mannonate dehydratase  53.57 
 
 		 397 aa  428  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1509  mannonate dehydratase  53.57 
 
 		 397 aa  428  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1596  mannonate dehydratase  53.83 
 
 		 394 aa  427  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.011047  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3238  mannonate dehydratase  54.08 
 
 		 396 aa  420  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186092 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4191  mannonate dehydratase  48.5 
 
 		 394 aa  408  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.549185  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1501  mannonate dehydratase  50 
 
 		 393 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2767  mannonate dehydratase  51.26 
 
 		 396 aa  411  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0275489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3897  mannonate dehydratase  50.89 
 
 		 397 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.472347  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2980  mannonate dehydratase  53.57 
 
 		 391 aa  402  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4123  mannonate dehydratase  50.77 
 
 		 395 aa  403  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1273  mannonate dehydratase  47.83 
 
 		 397 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00133457  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1891  mannonate dehydratase  47.1 
 
 		 395 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1314  mannonate dehydratase  49.1 
 
 		 398 aa  399  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1059  mannonate dehydratase  49.87 
 
 		 399 aa  399  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.568078 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2778  mannonate dehydratase  49.87 
 
 		 391 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.492601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4306  mannonate dehydratase  49.75 
 
 		 401 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.555799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0136  mannonate dehydratase  48.48 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0645545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6196  mannonate dehydratase  48.21 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0977  mannonate dehydratase  52.79 
 
 		 398 aa  388  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0397618  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2123  mannonate hydrolase  48.98 
 
 		 398 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.517153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2262  mannonate dehydratase  46.58 
 
 		 391 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.192874 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3873  mannonate dehydratase  48.08 
 
 		 389 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.432429 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6490  mannonate dehydratase  49.49 
 
 		 395 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4843  mannonate dehydratase  47.44 
 
 		 925 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0781213  hitchhiker  0.00115783 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34220  D-mannonate dehydratase  49.37 
 
 		 392 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6000  mannonate dehydratase  47.73 
 
 		 395 aa  363  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3648  mannonate dehydratase  46.75 
 
 		 399 aa  361  1e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.63309  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0814  mannonate dehydratase  47.22 
 
 		 401 aa  350  3e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1995  mannonate dehydratase  43.37 
 
 		 387 aa  349  5e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0764  mannonate dehydratase  46.46 
 
 		 401 aa  346  4e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1858  mannonate dehydratase  46.67 
 
 		 393 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0429612  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4047  mannonate dehydratase  37.63 
 
 		 345 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0856  mannonate dehydratase  37.03 
 
 		 363 aa  248  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2289  mannonate dehydratase  39.9 
 
 		 351 aa  244  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0878  mannonate dehydratase  37.63 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0855  mannonate dehydratase  37.63 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0430  mannonate dehydratase  37.37 
 
 		 359 aa  239  8e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.174722 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1306  mannonate dehydratase  34.53 
 
 		 352 aa  235  9e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0947  mannonate dehydratase  37.28 
 
 		 348 aa  233  5e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5748  mannonate dehydratase  37.63 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.118484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2699  mannonate dehydratase  36.25 
 
 		 371 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1674  mannonate dehydratase  33.92 
 
 		 348 aa  223  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0140  mannonate dehydratase  32.93 
 
 		 360 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4493  mannonate dehydratase  36.36 
 
 		 362 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4154  mannonate dehydratase  36.64 
 
 		 350 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.650866  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5811  mannonate dehydratase  36.64 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3876  mannonate dehydratase  36.64 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.854128  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2038  mannonate dehydratase  33.5 
 
 		 355 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1358  mannonate dehydratase  36.13 
 
 		 352 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0361193 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0702  mannonate dehydratase  33.08 
 
 		 348 aa  203  5e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1745  mannonate dehydratase  31.74 
 
 		 354 aa  199  6e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1601  mannonate dehydratase  32.58 
 
 		 356 aa  194  3e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1061  mannonate dehydratase  32.36 
 
 		 358 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2667  mannonate dehydratase  33.17 
 
 		 373 aa  171  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4207  Mannonate dehydratase  29.7 
 
 		 297 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.99596  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0595  Mannonate dehydratase  27.48 
 
 		 373 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0858512  normal  0.118058 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2239  Mannonate dehydratase  40.32 
 
 		 317 aa  124  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.314413 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4672  Mannonate dehydratase  29.77 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0869  Mannonate dehydratase  36.95 
 
 		 314 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3895  Mannonate dehydratase  31.73 
 
 		 370 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1821  mannonate dehydratase  35.08 
 
 		 278 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.640781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3719  Mannonate dehydratase  34.55 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.320611  normal  0.458256 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2506  Mannonate dehydratase  36.32 
 
 		 328 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.636671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1160  mannonate dehydratase  31.12 
 
 		 342 aa  95.9  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4342  mannonate dehydratase  37.78 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4211  Mannonate dehydratase  32.04 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3907  Mannonate dehydratase  28.31 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00606211  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5616  mannonate dehydratase  34.45 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1690  Mannonate dehydratase  32.77 
 
 		 324 aa  57  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1876  Mannonate dehydratase  32.77 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.463874  normal  0.188716 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4519  D-mannonate dehydratase  32.2 
 
 		 331 aa  54.3  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>