99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3895 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3895  Mannonate dehydratase  100 
 
 		 370 aa  772    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0595  Mannonate dehydratase  70.7 
 
 		 373 aa  564  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0858512  normal  0.118058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3719  Mannonate dehydratase  46.71 
 
 		 353 aa  301  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.320611  normal  0.458256 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4672  Mannonate dehydratase  47.06 
 
 		 318 aa  295  8e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2506  Mannonate dehydratase  49.82 
 
 		 328 aa  294  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.636671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4207  Mannonate dehydratase  45.52 
 
 		 297 aa  269  5.9999999999999995e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.99596  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0869  Mannonate dehydratase  43.13 
 
 		 314 aa  257  2e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2239  Mannonate dehydratase  43.73 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.314413 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1160  mannonate dehydratase  41.28 
 
 		 342 aa  233  4.0000000000000004e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1358  mannonate dehydratase  37.88 
 
 		 352 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0361193 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4493  mannonate dehydratase  37.88 
 
 		 362 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3876  mannonate dehydratase  37.88 
 
 		 351 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.854128  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5811  mannonate dehydratase  37.88 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5748  mannonate dehydratase  35.45 
 
 		 352 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.118484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0430  mannonate dehydratase  34.64 
 
 		 359 aa  206  6e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.174722 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4154  mannonate dehydratase  37.27 
 
 		 350 aa  205  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.650866  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0855  mannonate dehydratase  34.83 
 
 		 360 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0878  mannonate dehydratase  34.83 
 
 		 360 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0856  mannonate dehydratase  35.12 
 
 		 363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0947  mannonate dehydratase  36.23 
 
 		 348 aa  199  9e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0140  mannonate dehydratase  34.83 
 
 		 360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0702  mannonate dehydratase  36.11 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2289  mannonate dehydratase  34.2 
 
 		 351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1821  mannonate dehydratase  41.91 
 
 		 278 aa  190  2.9999999999999997e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.640781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2699  mannonate dehydratase  31.55 
 
 		 371 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3907  Mannonate dehydratase  36.17 
 
 		 347 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00606211  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1674  mannonate dehydratase  31.27 
 
 		 348 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4211  Mannonate dehydratase  40.62 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4047  mannonate dehydratase  33.03 
 
 		 345 aa  180  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2038  mannonate dehydratase  32.36 
 
 		 355 aa  179  4.999999999999999e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1745  mannonate dehydratase  31.74 
 
 		 354 aa  179  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4519  D-mannonate dehydratase  33.96 
 
 		 331 aa  177  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310044  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1061  mannonate dehydratase  32.41 
 
 		 358 aa  166  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5616  mannonate dehydratase  32.46 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1876  Mannonate dehydratase  32.36 
 
 		 324 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.463874  normal  0.188716 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1601  mannonate dehydratase  29.28 
 
 		 356 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1891  mannonate dehydratase  32.76 
 
 		 395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1690  Mannonate dehydratase  31.72 
 
 		 324 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4342  mannonate dehydratase  31.44 
 
 		 356 aa  161  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1314  mannonate dehydratase  29.89 
 
 		 398 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34220  D-mannonate dehydratase  31.09 
 
 		 392 aa  155  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4191  mannonate dehydratase  31.33 
 
 		 394 aa  152  8.999999999999999e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.549185  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3897  mannonate dehydratase  31.01 
 
 		 397 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.472347  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1306  mannonate dehydratase  30.25 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0136  mannonate dehydratase  30.56 
 
 		 394 aa  146  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0645545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1273  mannonate dehydratase  29.64 
 
 		 397 aa  145  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00133457  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04153  hypothetical protein  30.83 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5828  mannonate dehydratase  30.83 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04191  mannonate dehydratase  30.83 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3675  mannonate dehydratase  30.83 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4548  mannonate dehydratase  30.83 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4920  mannonate dehydratase  30.83 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4849  mannonate dehydratase  30.83 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4792  mannonate dehydratase  30.56 
 
 		 394 aa  143  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4123  mannonate dehydratase  29.28 
 
 		 395 aa  142  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6196  mannonate dehydratase  31.95 
 
 		 393 aa  142  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2767  mannonate dehydratase  31.01 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0275489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2980  mannonate dehydratase  29.13 
 
 		 391 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3742  mannonate dehydratase  30.59 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.179437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1501  mannonate dehydratase  30.23 
 
 		 393 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4843  mannonate dehydratase  29.58 
 
 		 925 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0781213  hitchhiker  0.00115783 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0975  mannonate dehydratase  29.66 
 
 		 396 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4112  mannonate dehydratase  30.45 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3873  mannonate dehydratase  29.03 
 
 		 389 aa  137  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.432429 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2262  mannonate dehydratase  28.65 
 
 		 391 aa  136  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.192874 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0987  mannonate dehydratase  30 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1408  Mannonate dehydratase  29.88 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0118662  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0977  mannonate dehydratase  31.45 
 
 		 398 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0397618  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1509  mannonate dehydratase  28.04 
 
 		 397 aa  132  9e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2778  mannonate dehydratase  28.04 
 
 		 397 aa  132  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1069  Mannonate dehydratase  28.87 
 
 		 375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2667  mannonate dehydratase  32.28 
 
 		 373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2123  mannonate hydrolase  30.59 
 
 		 398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.517153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1059  mannonate dehydratase  27.42 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.568078 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5061  mannonate dehydratase  28.1 
 
 		 402 aa  129  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.586896 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3238  mannonate dehydratase  28.81 
 
 		 396 aa  129  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186092 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2429  mannonate dehydratase  29.11 
 
 		 406 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.328404  normal  0.0532217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4306  mannonate dehydratase  31.29 
 
 		 401 aa  129  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.555799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0773  mannonate dehydratase  28.82 
 
 		 406 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0669875  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6000  mannonate dehydratase  27.13 
 
 		 395 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3323  mannonate dehydratase  27.78 
 
 		 398 aa  123  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1596  mannonate dehydratase  28.33 
 
 		 394 aa  122  9e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.011047  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3648  mannonate dehydratase  35.21 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.63309  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3317  mannonate dehydratase  29.17 
 
 		 394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0151391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6490  mannonate dehydratase  26.06 
 
 		 395 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0764  mannonate dehydratase  27.11 
 
 		 401 aa  119  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0406  mannonate dehydratase  28.12 
 
 		 404 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3480  mannonate dehydratase  34.95 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3307  mannonate dehydratase  34.95 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.041841  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3381  mannonate dehydratase  34.95 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  normal  0.591924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3387  mannonate dehydratase  34.95 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.20257 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3684  mannonate dehydratase  31.73 
 
 		 402 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.110179 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2699  mannonate dehydratase  35.2 
 
 		 397 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1858  mannonate dehydratase  34.2 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0429612  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2778  mannonate dehydratase  29.72 
 
 		 391 aa  109  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.492601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4095  mannonate dehydratase  33.5 
 
 		 405 aa  109  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.780136  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4498  mannonate dehydratase  32.99 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0165988  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1995  mannonate dehydratase  27.95 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0814  mannonate dehydratase  32.46 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>