79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1069 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1069  Mannonate dehydratase  100 
 
 		 375 aa  783    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1408  Mannonate dehydratase  79.62 
 
 		 375 aa  634    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0118662  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1690  Mannonate dehydratase  39.82 
 
 		 324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4519  D-mannonate dehydratase  39.04 
 
 		 331 aa  252  9.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310044  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5616  mannonate dehydratase  39.22 
 
 		 337 aa  248  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1876  Mannonate dehydratase  38.55 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.463874  normal  0.188716 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2239  Mannonate dehydratase  33.66 
 
 		 317 aa  135  9e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.314413 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0595  Mannonate dehydratase  31.46 
 
 		 373 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0858512  normal  0.118058 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0869  Mannonate dehydratase  30.29 
 
 		 314 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2506  Mannonate dehydratase  34 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.636671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4342  mannonate dehydratase  31.51 
 
 		 356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3895  Mannonate dehydratase  29.2 
 
 		 370 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4672  Mannonate dehydratase  33.46 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3719  Mannonate dehydratase  30.3 
 
 		 353 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.320611  normal  0.458256 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4211  Mannonate dehydratase  30.8 
 
 		 360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0878  mannonate dehydratase  28.66 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0855  mannonate dehydratase  28.66 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3907  Mannonate dehydratase  27.95 
 
 		 347 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00606211  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4207  Mannonate dehydratase  31.62 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.99596  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4047  mannonate dehydratase  31.43 
 
 		 345 aa  97.4  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5811  mannonate dehydratase  29.92 
 
 		 351 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3876  mannonate dehydratase  29.53 
 
 		 351 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.854128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4493  mannonate dehydratase  29.76 
 
 		 362 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0702  mannonate dehydratase  28.74 
 
 		 348 aa  93.2  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4154  mannonate dehydratase  27.95 
 
 		 350 aa  93.2  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.650866  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1358  mannonate dehydratase  28.74 
 
 		 352 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0361193 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0947  mannonate dehydratase  25.39 
 
 		 348 aa  89.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0140  mannonate dehydratase  27.07 
 
 		 360 aa  88.6  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0856  mannonate dehydratase  29.02 
 
 		 363 aa  87  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0430  mannonate dehydratase  26.49 
 
 		 359 aa  86.7  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.174722 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1821  mannonate dehydratase  32.8 
 
 		 278 aa  86.7  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.640781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1160  mannonate dehydratase  26.92 
 
 		 342 aa  85.9  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1674  mannonate dehydratase  26.78 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1061  mannonate dehydratase  27.38 
 
 		 358 aa  79.3  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2038  mannonate dehydratase  22.7 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5748  mannonate dehydratase  24.92 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.118484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2699  mannonate dehydratase  23.25 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2289  mannonate dehydratase  29.08 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2667  mannonate dehydratase  29.41 
 
 		 373 aa  72  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1745  mannonate dehydratase  24.02 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1306  mannonate dehydratase  24.45 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1601  mannonate dehydratase  23.26 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2767  mannonate dehydratase  31.65 
 
 		 396 aa  55.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0275489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3307  mannonate dehydratase  31.16 
 
 		 394 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.041841  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3480  mannonate dehydratase  31.16 
 
 		 394 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3387  mannonate dehydratase  31.16 
 
 		 394 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.20257 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3317  mannonate dehydratase  31.16 
 
 		 394 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0151391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3381  mannonate dehydratase  31.16 
 
 		 394 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  normal  0.591924 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3742  mannonate dehydratase  31.16 
 
 		 389 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.179437  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04191  mannonate dehydratase  31.16 
 
 		 394 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04153  hypothetical protein  31.16 
 
 		 394 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3675  mannonate dehydratase  31.16 
 
 		 394 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6196  mannonate dehydratase  30.25 
 
 		 393 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2699  mannonate dehydratase  30.83 
 
 		 397 aa  53.9  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4849  mannonate dehydratase  31.16 
 
 		 394 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4548  mannonate dehydratase  31.16 
 
 		 394 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4920  mannonate dehydratase  31.16 
 
 		 394 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1509  mannonate dehydratase  30.83 
 
 		 397 aa  53.9  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2778  mannonate dehydratase  30.83 
 
 		 397 aa  53.9  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1501  mannonate dehydratase  32.03 
 
 		 393 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5828  mannonate dehydratase  31.16 
 
 		 394 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0975  mannonate dehydratase  30.83 
 
 		 396 aa  53.9  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3238  mannonate dehydratase  30.83 
 
 		 396 aa  53.1  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186092 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4306  mannonate dehydratase  30.07 
 
 		 401 aa  53.1  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.555799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1891  mannonate dehydratase  28.65 
 
 		 395 aa  53.1  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1995  mannonate dehydratase  28.33 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1596  mannonate dehydratase  30 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.011047  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4792  mannonate dehydratase  30.43 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2980  mannonate dehydratase  26.32 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4123  mannonate dehydratase  31.13 
 
 		 395 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1059  mannonate dehydratase  28.4 
 
 		 399 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.568078 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4112  mannonate dehydratase  29.32 
 
 		 394 aa  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0136  mannonate dehydratase  28.99 
 
 		 394 aa  47.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0645545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2262  mannonate dehydratase  24.81 
 
 		 391 aa  46.6  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.192874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1314  mannonate dehydratase  26.87 
 
 		 398 aa  46.2  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0987  mannonate dehydratase  24.43 
 
 		 398 aa  46.6  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3323  mannonate dehydratase  24.43 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3873  mannonate dehydratase  32.05 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.432429 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2778  mannonate dehydratase  29.1 
 
 		 391 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.492601  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>