More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5501 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5501  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
343 aa  713    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.206869  hitchhiker  0.000501285 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6347  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.67 
 
 
363 aa  313  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5550  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.86 
 
 
358 aa  310  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.088188  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3487  NADH:flavin oxidoreductase family protein  45.17 
 
 
362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2082  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.48 
 
 
358 aa  300  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1567  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.17 
 
 
359 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1649  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.91 
 
 
354 aa  290  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0323163  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1438  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.04 
 
 
361 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2348  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.16 
 
 
358 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492677  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0353  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.25 
 
 
366 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.798317 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0306  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.1 
 
 
358 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126794  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4760  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.68 
 
 
365 aa  278  7e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000142373  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1519  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.17 
 
 
369 aa  276  5e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4347  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.4 
 
 
355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0189212 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1813  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.59 
 
 
362 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1258  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.24 
 
 
371 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1883  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.06 
 
 
359 aa  271  2e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5552  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.06 
 
 
358 aa  269  5.9999999999999995e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0106  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.56 
 
 
362 aa  266  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0473  NADH:flavin oxidoreductase  43.62 
 
 
368 aa  261  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1468  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.96 
 
 
371 aa  258  9e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2240  N-ethylmaleimide reductase, FMN-linked  43.93 
 
 
365 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3087  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.51 
 
 
370 aa  256  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0089  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.33 
 
 
370 aa  256  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.789966 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3689  GTN reductase  41.61 
 
 
360 aa  255  8e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000261  N-ethylmaleimide reductase  41.09 
 
 
366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5285  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.17 
 
 
370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0423  FMN oxidoreductase protein  42.52 
 
 
364 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0473  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.21 
 
 
378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2906  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.9 
 
 
369 aa  253  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2819  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  41.9 
 
 
369 aa  253  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.726773  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0902  oxidoreductase, FMN-binding  42.56 
 
 
371 aa  252  6e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0454  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.91 
 
 
378 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0845  oxidoreductase, FMN-binding  42.56 
 
 
371 aa  252  6e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05639  N-ethylmaleimide reductase  39.58 
 
 
366 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1368  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.72 
 
 
367 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2682  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.25 
 
 
372 aa  251  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0627  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.41 
 
 
369 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0104  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.98 
 
 
369 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3360  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.87 
 
 
356 aa  249  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.20425 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5482  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.82 
 
 
404 aa  249  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.62329  normal  0.848973 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1830  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40 
 
 
358 aa  249  6e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.028835  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.83 
 
 
366 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2094  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.95 
 
 
368 aa  248  9e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26130  morphinone reductase  41.82 
 
 
369 aa  248  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243745  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1539  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.05 
 
 
358 aa  248  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.31269  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1721  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.93 
 
 
363 aa  248  1e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4062  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.86 
 
 
462 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00355793  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0101  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.69 
 
 
369 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.70129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2616  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.35 
 
 
365 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0492  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.01 
 
 
357 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0475  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.81 
 
 
365 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.261593  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4210  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.88 
 
 
372 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21900  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.62 
 
 
356 aa  248  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6900  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.86 
 
 
404 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6853  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.18 
 
 
367 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.401791  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0507  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.82 
 
 
363 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1157  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.51 
 
 
362 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10298  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0988  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.59 
 
 
359 aa  245  6.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000470926 
 
 
-
 
NC_003296  RS00904  NADH-dependent flavin oxidoreductase protein  41.69 
 
 
359 aa  245  8e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.890942 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2277  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.74 
 
 
363 aa  245  8e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.178772 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3683  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.69 
 
 
368 aa  245  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3869  putative oxidoreductase  44.83 
 
 
359 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0759  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.46 
 
 
373 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.882539  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1240  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.46 
 
 
373 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.62 
 
 
364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5128  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.09 
 
 
371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01763  GTN Reductase  40.99 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553032  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2805  putative NADH-flavin oxidoreductase  42.51 
 
 
362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3143  oxidoreductase  40.3 
 
 
371 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.683924  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4103  N-ethylmaleimide reductase  39.64 
 
 
369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.8 
 
 
363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3425  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.63 
 
 
368 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2243  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.22 
 
 
354 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1494  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.51 
 
 
362 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1245  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.76 
 
 
373 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.298722 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0527  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.16 
 
 
364 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000582324  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6328  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.32 
 
 
363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1691  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.96 
 
 
365 aa  242  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.410088  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6908  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.39 
 
 
369 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4899  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.39 
 
 
369 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2099  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.58 
 
 
366 aa  242  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.732064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3264  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.39 
 
 
369 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3698  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.08 
 
 
364 aa  242  6e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2479  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.55 
 
 
366 aa  242  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4436  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.39 
 
 
369 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1673  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.96 
 
 
365 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0639  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  40.06 
 
 
372 aa  241  9e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0503  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.56 
 
 
373 aa  241  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.93 
 
 
364 aa  241  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15352  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5123  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.05 
 
 
362 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0709  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.14 
 
 
359 aa  241  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.361607  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5219  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.91 
 
 
380 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40 
 
 
363 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.789599  hitchhiker  0.00631395 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0217  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.29 
 
 
358 aa  239  5e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2445  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.88 
 
 
371 aa  239  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3133  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.53 
 
 
375 aa  239  6.999999999999999e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.656366  normal  0.303319 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4927  xenobiotic reductase  41.01 
 
 
350 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0063  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.72 
 
 
366 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.27 
 
 
358 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416223  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>