More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3869 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_3869  putative oxidoreductase  100 
 
 
359 aa  728    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0492  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  80.91 
 
 
357 aa  587  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00904  NADH-dependent flavin oxidoreductase protein  81.07 
 
 
359 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.890942 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6328  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  79.26 
 
 
363 aa  568  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0476  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  72.7 
 
 
354 aa  523  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0709  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  74.86 
 
 
359 aa  521  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.361607  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4722  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  70.09 
 
 
356 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36990  NADH:flavin oxidoreductase  58.07 
 
 
357 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.610852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4896  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  57.64 
 
 
357 aa  343  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0563  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.87 
 
 
357 aa  339  4e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000270418 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3384  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.98 
 
 
363 aa  333  3e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000502558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1149  oxidoreductase  54.13 
 
 
355 aa  332  4e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2277  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.14 
 
 
363 aa  328  8e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.178772 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.6 
 
 
363 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.7 
 
 
364 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15352  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4210  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.3 
 
 
372 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3689  GTN reductase  49.03 
 
 
360 aa  316  3e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2479  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.35 
 
 
366 aa  317  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5779  morphinone reductase  50.56 
 
 
364 aa  315  7e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.240978  normal  0.391278 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.3 
 
 
366 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2006  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.58 
 
 
364 aa  314  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.34 
 
 
363 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.789599  hitchhiker  0.00631395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.21 
 
 
364 aa  311  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6347  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.47 
 
 
363 aa  308  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2240  N-ethylmaleimide reductase, FMN-linked  48.6 
 
 
365 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1258  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.35 
 
 
371 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4062  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.75 
 
 
462 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00355793  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1368  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.54 
 
 
367 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1830  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.18 
 
 
358 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.028835  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1865  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  46.5 
 
 
360 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5271  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.74 
 
 
360 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4736  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.46 
 
 
360 aa  298  7e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1438  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.18 
 
 
361 aa  298  1e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01763  GTN Reductase  47.63 
 
 
372 aa  297  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553032  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3487  NADH:flavin oxidoreductase family protein  44.29 
 
 
362 aa  297  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1002  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.91 
 
 
357 aa  296  4e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4103  N-ethylmaleimide reductase  45.03 
 
 
369 aa  295  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1172  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.82 
 
 
359 aa  293  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.210538 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4877  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.83 
 
 
368 aa  292  5e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0637583 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2459  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.46 
 
 
361 aa  291  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0104  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.92 
 
 
369 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2082  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.05 
 
 
358 aa  290  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0101  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.65 
 
 
369 aa  288  8e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.70129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4347  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.22 
 
 
355 aa  288  9e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0189212 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1813  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.8 
 
 
362 aa  288  9e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0593  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.44 
 
 
363 aa  288  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4760  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.13 
 
 
365 aa  288  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000142373  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0473  NADH:flavin oxidoreductase  46.69 
 
 
368 aa  288  1e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3698  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.67 
 
 
364 aa  288  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014573 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1539  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.86 
 
 
358 aa  287  2e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.31269  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0503  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.21 
 
 
373 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0152  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.46 
 
 
359 aa  285  7e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.5134  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5550  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.17 
 
 
358 aa  285  8e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.088188  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1883  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.68 
 
 
359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5123  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.56 
 
 
362 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1689  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.76 
 
 
368 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.79 
 
 
358 aa  282  8.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416223  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1778  N-ethylmaleimide reductase  44.93 
 
 
385 aa  281  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1099  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.48 
 
 
360 aa  280  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.106909  normal  0.659732 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1138  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.66 
 
 
368 aa  279  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0230317  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0759  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.08 
 
 
373 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.882539  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1240  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.08 
 
 
373 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1242  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.88 
 
 
371 aa  279  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102798  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3889  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.39 
 
 
366 aa  279  7e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.212192  normal  0.106591 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10483  flavoprotein NADH-dependent oxidoreductase  42.42 
 
 
379 aa  278  8e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.614886  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0481  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.58 
 
 
369 aa  278  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2725  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.16 
 
 
374 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.245117  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3133  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.28 
 
 
375 aa  278  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.656366  normal  0.303319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1046  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.66 
 
 
368 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758573  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05639  N-ethylmaleimide reductase  44.66 
 
 
366 aa  277  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2445  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.72 
 
 
371 aa  277  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0217  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.1 
 
 
358 aa  276  4e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1721  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.26 
 
 
363 aa  276  4e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000261  N-ethylmaleimide reductase  44.69 
 
 
366 aa  276  4e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0306  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.63 
 
 
358 aa  276  5e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126794  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3143  oxidoreductase  42.78 
 
 
371 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.683924  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4063  N-ethylmaleimide reductase, putative  44.02 
 
 
367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5069  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.53 
 
 
368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.169096  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1649  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.76 
 
 
354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0323163  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2986  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.16 
 
 
374 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0351108 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1202  flavoprotein NADH-dependent oxidoreductase  46.83 
 
 
378 aa  273  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0423  FMN oxidoreductase protein  46.45 
 
 
364 aa  273  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1871  N-ethylmaleimide reductase  42.51 
 
 
365 aa  273  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554959  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2565  N-ethylmaleimide reductase  42.51 
 
 
365 aa  273  4.0000000000000004e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111821  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1762  N-ethylmaleimide reductase  42.51 
 
 
365 aa  273  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139789  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1567  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.23 
 
 
359 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5552  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.26 
 
 
358 aa  273  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2805  putative NADH-flavin oxidoreductase  46.07 
 
 
362 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2348  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.8 
 
 
358 aa  272  6e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492677  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0627  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.67 
 
 
369 aa  272  6e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1213  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.52 
 
 
373 aa  272  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0639  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  45.23 
 
 
372 aa  271  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000624  N-ethylmaleimide reductase  42.51 
 
 
374 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0473  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.97 
 
 
378 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1494  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.79 
 
 
362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3683  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.41 
 
 
368 aa  269  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4153  N-ethylmaleimide reductase, putative  43.78 
 
 
378 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0920  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.75 
 
 
349 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3087  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.31 
 
 
370 aa  268  7e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4581  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.28 
 
 
368 aa  269  7e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.936787  normal  0.154521 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>