239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2038 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  100 
 
 
245 aa  509  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.371359  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3403  pyridoxine 5'-phosphate synthase  65.56 
 
 
238 aa  323  2e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.735952 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4990  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  64.73 
 
 
245 aa  315  4e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4728  pyridoxine 5'-phosphate synthase  65.29 
 
 
239 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1041  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.48 
 
 
238 aa  305  5.0000000000000004e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3677  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.92 
 
 
240 aa  289  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1695  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.09 
 
 
237 aa  288  7e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04340  putative pyridoxine biosynthesis protein  57.26 
 
 
237 aa  281  5.000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0630  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.15 
 
 
238 aa  279  3e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.377308 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2318  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.98 
 
 
255 aa  223  3e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2616  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.93 
 
 
259 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2794  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.4 
 
 
250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0224689  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3263  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.93 
 
 
259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0574921 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2768  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.61 
 
 
250 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180597  normal  0.550753 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.53 
 
 
241 aa  216  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0014  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.39 
 
 
247 aa  216  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104614 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03472  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.97 
 
 
255 aa  214  7e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0653  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.91 
 
 
265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0178796  normal  0.245911 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0595  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.97 
 
 
268 aa  212  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1752  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.61 
 
 
252 aa  211  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.736096  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1493  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.27 
 
 
248 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1199  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.35 
 
 
258 aa  210  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.39444  decreased coverage  0.00461164 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2344  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.33 
 
 
262 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.954303  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2512  pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.58 
 
 
250 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1341  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.89 
 
 
246 aa  206  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000107326  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1810  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.25 
 
 
245 aa  206  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1385  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.47 
 
 
246 aa  203  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0165798  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0046  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.93 
 
 
260 aa  201  8e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.93 
 
 
260 aa  201  9e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0740712  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1982  pyridoxine 5'-phosphate synthase  43.14 
 
 
250 aa  199  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5258  pyridoxine 5'-phosphate synthase  43.8 
 
 
257 aa  199  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1405  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.39 
 
 
254 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3632  pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.62 
 
 
271 aa  188  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757255  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0918  pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.53 
 
 
244 aa  188  8e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.184744  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1713  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.12 
 
 
251 aa  186  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3058  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.82 
 
 
276 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0409  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.79 
 
 
248 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3259  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.3 
 
 
255 aa  166  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0370  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39 
 
 
264 aa  164  9e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.225374  normal  0.0276101 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0867  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.83 
 
 
240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0203459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1011  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.83 
 
 
240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0377  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.49 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0844615  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0336  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.19 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.48 
 
 
236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.357932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2717  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.5 
 
 
243 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02458  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  37.5 
 
 
243 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1104  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  37.5 
 
 
243 aa  160  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548705  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1113  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.5 
 
 
243 aa  160  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1385  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  37.08 
 
 
250 aa  161  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2850  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.5 
 
 
243 aa  160  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.445885  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02422  hypothetical protein  37.5 
 
 
243 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2719  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.5 
 
 
243 aa  160  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3800  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.5 
 
 
243 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2929  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.5 
 
 
243 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.513928  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.3 
 
 
254 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147174  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0252  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  38.33 
 
 
245 aa  158  9e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2781  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.67 
 
 
243 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1733  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.68 
 
 
264 aa  157  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2821  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.67 
 
 
243 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3051  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.5 
 
 
243 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.397726  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.67 
 
 
243 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.776191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2956  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.67 
 
 
243 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.586125  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.3 
 
 
248 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3068  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.08 
 
 
243 aa  156  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.867372  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7366  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.22 
 
 
252 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00681415  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1804  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.57 
 
 
239 aa  155  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.207619  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0484  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.77 
 
 
235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00217083  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0911  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.1 
 
 
247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0316197  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1678  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.55 
 
 
240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0488  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.55 
 
 
251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2563  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.82 
 
 
252 aa  155  7e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117328  hitchhiker  0.00154499 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3458  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.14 
 
 
249 aa  155  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.67158 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0422  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.51 
 
 
244 aa  155  8e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.644654  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2740  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.25 
 
 
243 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1759  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.04 
 
 
265 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1207  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.67 
 
 
243 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1690  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.34 
 
 
236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.368912  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1733  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.98 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0933039  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2309  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.44 
 
 
250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0100361  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1265  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.66 
 
 
240 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2248  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.48 
 
 
236 aa  152  4e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4547  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.83 
 
 
240 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.336001  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2444  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.36 
 
 
260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0657  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.72 
 
 
258 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1137  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.72 
 
 
258 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1071  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  36.93 
 
 
243 aa  151  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.989266  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0516  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.98 
 
 
248 aa  151  8.999999999999999e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2526  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.04 
 
 
239 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.248479  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2415  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.87 
 
 
260 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_002978  WD0064  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.3 
 
 
235 aa  150  2e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.757519  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0546  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.3 
 
 
257 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.795821  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2892  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.3 
 
 
257 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2837  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.3 
 
 
257 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2818  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.3 
 
 
257 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1088  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.02 
 
 
254 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1076  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.02 
 
 
246 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2871  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.1 
 
 
265 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0175747 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1139  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.67 
 
 
243 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10801  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.95 
 
 
243 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.521124  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2463  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.3 
 
 
257 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>