239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1041 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1041  pyridoxine 5'-phosphate synthase  100 
 
 
238 aa  489  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1695  pyridoxine 5'-phosphate synthase  70.76 
 
 
237 aa  354  5.999999999999999e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04340  putative pyridoxine biosynthesis protein  69.07 
 
 
237 aa  347  7e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3403  pyridoxine 5'-phosphate synthase  69.49 
 
 
238 aa  342  2e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.735952 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4990  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  64.41 
 
 
245 aa  330  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4728  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.98 
 
 
239 aa  322  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3677  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.98 
 
 
240 aa  319  3e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.48 
 
 
245 aa  305  4.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.371359  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_002950  PG0630  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.81 
 
 
238 aa  298  5e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.377308 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0014  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.77 
 
 
247 aa  221  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104614 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03472  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.15 
 
 
255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3263  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.06 
 
 
259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0574921 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2616  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.64 
 
 
259 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.93 
 
 
241 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0653  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.97 
 
 
265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0178796  normal  0.245911 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2318  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.06 
 
 
255 aa  211  9e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5258  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.03 
 
 
257 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2344  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.06 
 
 
262 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.954303  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1752  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.12 
 
 
252 aa  203  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.736096  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0595  pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.58 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1405  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.9 
 
 
254 aa  198  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.72 
 
 
260 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0740712  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0046  pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.72 
 
 
260 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1199  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.34 
 
 
258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.39444  decreased coverage  0.00461164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3632  pyridoxine 5'-phosphate synthase  43.67 
 
 
271 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757255  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2794  pyridoxine 5'-phosphate synthase  43.39 
 
 
250 aa  191  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0224689  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1493  pyridoxine 5'-phosphate synthase  42.32 
 
 
248 aa  189  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3058  pyridoxine 5'-phosphate synthase  42.15 
 
 
276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1810  pyridoxine 5'-phosphate synthase  42.98 
 
 
245 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1713  pyridoxine 5'-phosphate synthase  41.98 
 
 
251 aa  176  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1341  pyridoxine 5'-phosphate synthase  42.63 
 
 
246 aa  176  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000107326  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2768  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.57 
 
 
250 aa  175  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180597  normal  0.550753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3259  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  42.98 
 
 
255 aa  175  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_004310  BR1385  pyridoxine 5'-phosphate synthase  42.23 
 
 
246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0165798  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2512  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.16 
 
 
250 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1982  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.83 
 
 
250 aa  168  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0918  pyridoxine 5'-phosphate synthase  41.18 
 
 
244 aa  167  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.184744  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0409  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.09 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0484  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.16 
 
 
235 aa  155  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00217083  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.77 
 
 
236 aa  155  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.357932  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10801  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.09 
 
 
243 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.521124  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1207  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.62 
 
 
246 aa  152  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0336  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.21 
 
 
264 aa  150  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1414  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.52 
 
 
249 aa  150  3e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0370  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.21 
 
 
264 aa  149  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.225374  normal  0.0276101 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1573  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.93 
 
 
247 aa  149  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.313613  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2526  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.19 
 
 
239 aa  148  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.248479  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2248  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.91 
 
 
236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2717  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02458  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  37 
 
 
243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1104  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  37 
 
 
243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548705  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2850  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37 
 
 
243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.445885  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02422  hypothetical protein  37 
 
 
243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2719  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37 
 
 
243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1113  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37 
 
 
243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3800  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37 
 
 
243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1634  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.28 
 
 
270 aa  145  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0172383  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0488  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.06 
 
 
251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1759  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.32 
 
 
265 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1678  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.06 
 
 
240 aa  145  8.000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3666  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.89 
 
 
243 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2929  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.56 
 
 
243 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.513928  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1265  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.36 
 
 
240 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2781  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.24 
 
 
243 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2821  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.24 
 
 
243 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0646  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.06 
 
 
240 aa  144  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192361  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2956  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.24 
 
 
243 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.586125  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.24 
 
 
243 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.776191 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0546  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.53 
 
 
257 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.795821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1786  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.53 
 
 
257 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2892  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.53 
 
 
257 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1690  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.37 
 
 
236 aa  143  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.368912  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0377  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.19 
 
 
255 aa  143  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0844615  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2818  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.53 
 
 
257 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2776  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.53 
 
 
257 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1733  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.02 
 
 
264 aa  142  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2837  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.53 
 
 
257 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2463  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.53 
 
 
257 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1436  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.78 
 
 
246 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.532201  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0737  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.8 
 
 
248 aa  142  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548789  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1733  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.37 
 
 
257 aa  142  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0933039  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0064  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.78 
 
 
235 aa  142  5e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.757519  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0975  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.96 
 
 
248 aa  142  5e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2740  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.24 
 
 
243 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1008  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.96 
 
 
248 aa  141  8e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4371  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.35 
 
 
246 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.194442 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0643  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.22 
 
 
244 aa  141  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2415  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.53 
 
 
260 aa  141  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1657  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.22 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0320  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.36 
 
 
244 aa  141  9.999999999999999e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4285  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.35 
 
 
240 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0911  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.22 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0316197  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09561  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.35 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.361641 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0252  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  36.32 
 
 
245 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3458  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.48 
 
 
249 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.67158 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12131  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.48 
 
 
238 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1804  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.78 
 
 
239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.207619  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.65 
 
 
248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0281  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.91 
 
 
241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.32709 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2257  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.93 
 
 
239 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>