239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2318 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2318  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  100 
 
 
255 aa  516  1e-146  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2616  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.82 
 
 
259 aa  300  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3263  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.82 
 
 
259 aa  298  6e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0574921 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2344  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.32 
 
 
262 aa  290  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.954303  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0595  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.27 
 
 
268 aa  289  3e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1752  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.04 
 
 
252 aa  285  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.736096  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5258  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.84 
 
 
257 aa  282  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0653  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.76 
 
 
265 aa  280  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0178796  normal  0.245911 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1199  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.61 
 
 
258 aa  274  8e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.39444  decreased coverage  0.00461164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3632  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.57 
 
 
271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757255  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3058  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.96 
 
 
276 aa  268  7e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1405  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.84 
 
 
254 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1713  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.63 
 
 
251 aa  253  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.78 
 
 
241 aa  248  5e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.38 
 
 
260 aa  241  6e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0740712  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0630  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.3 
 
 
238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.377308 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0046  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.98 
 
 
260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03472  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.99 
 
 
255 aa  239  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0014  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.28 
 
 
247 aa  232  5e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104614 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2794  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.03 
 
 
250 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0224689  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1695  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.15 
 
 
237 aa  228  5e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1493  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.5 
 
 
248 aa  226  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4728  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50 
 
 
239 aa  223  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.98 
 
 
245 aa  223  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.371359  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2768  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.83 
 
 
250 aa  221  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180597  normal  0.550753 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3677  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.62 
 
 
240 aa  221  9e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2512  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.05 
 
 
250 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1982  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.37 
 
 
250 aa  215  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3403  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.08 
 
 
238 aa  215  5e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.735952 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04340  putative pyridoxine biosynthesis protein  45.27 
 
 
237 aa  215  5e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0918  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.76 
 
 
244 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.184744  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1341  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.74 
 
 
246 aa  214  9e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000107326  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4990  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  47.52 
 
 
245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1810  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.74 
 
 
245 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1385  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.32 
 
 
246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0165798  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1041  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.06 
 
 
238 aa  211  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3259  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.17 
 
 
255 aa  195  6e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3666  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.02 
 
 
243 aa  148  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0446  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.46 
 
 
235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.86215  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2956  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.6 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.586125  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.6 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.776191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2821  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.6 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2781  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.6 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2740  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.19 
 
 
243 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0252  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  38.93 
 
 
245 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2717  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.78 
 
 
243 aa  142  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2929  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.78 
 
 
243 aa  141  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.513928  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02458  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  36.36 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1104  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  36.36 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02422  hypothetical protein  36.36 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1113  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.36 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3800  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.36 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2719  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.36 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2850  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.36 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.445885  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2629  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.17 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1675  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.27 
 
 
243 aa  140  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0370  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.08 
 
 
264 aa  140  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.225374  normal  0.0276101 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0867  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.14 
 
 
240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0203459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1011  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.14 
 
 
240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1265  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.68 
 
 
240 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.97 
 
 
247 aa  139  6e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1678  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.02 
 
 
240 aa  139  6e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0488  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.02 
 
 
251 aa  138  7e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0643  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.12 
 
 
244 aa  138  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03533  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.42 
 
 
243 aa  137  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1634  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.4 
 
 
270 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0172383  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1385  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  35.12 
 
 
250 aa  138  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1403  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.36 
 
 
241 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0320  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.98 
 
 
244 aa  137  2e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1124  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.36 
 
 
241 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.595561  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0409  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.1 
 
 
248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0336  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.6 
 
 
264 aa  136  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1478  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.42 
 
 
248 aa  135  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323845  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03404  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.6 
 
 
250 aa  135  8e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.405613  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0795  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.1 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2455  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.39 
 
 
242 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.39 
 
 
242 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.498379  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0805  pyridoxine 5'-phosphate synthase  32.5 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.916602  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1573  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.37 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.313613  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2036  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.83 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2367  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.39 
 
 
242 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1207  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.25 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.12 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3051  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.71 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.397726  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2167  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.25 
 
 
258 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761233  normal  0.284873 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0377  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.07 
 
 
255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0844615  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3709  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.54 
 
 
245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3458  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.68 
 
 
249 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.67158 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2782  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  35.54 
 
 
243 aa  132  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0911  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.29 
 
 
247 aa  131  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0316197  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2522  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.42 
 
 
243 aa  132  7.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13808  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1071  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  35.12 
 
 
243 aa  132  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.989266  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3068  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.54 
 
 
243 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.867372  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1017  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.83 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1139  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.8 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10801  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.75 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.521124  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0657  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.67 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1137  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.67 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1095  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.08 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2896  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.58 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849823  normal  0.107907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>