239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2794 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2794  pyridoxine 5'-phosphate synthase  100 
 
 
250 aa  507  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0224689  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2768  pyridoxine 5'-phosphate synthase  76.71 
 
 
250 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180597  normal  0.550753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2512  pyridoxine 5'-phosphate synthase  76.61 
 
 
250 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1493  pyridoxine 5'-phosphate synthase  74.8 
 
 
248 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1982  pyridoxine 5'-phosphate synthase  73.2 
 
 
250 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1810  pyridoxine 5'-phosphate synthase  70.25 
 
 
245 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1341  pyridoxine 5'-phosphate synthase  70.66 
 
 
246 aa  317  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000107326  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1385  pyridoxine 5'-phosphate synthase  70.25 
 
 
246 aa  314  8e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0165798  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0918  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.2 
 
 
244 aa  270  1e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.184744  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2318  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.03 
 
 
255 aa  230  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1713  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.61 
 
 
251 aa  221  9e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.4 
 
 
245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.371359  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_002950  PG0630  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.55 
 
 
238 aa  215  5.9999999999999996e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.377308 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2616  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.31 
 
 
259 aa  214  8e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1752  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.62 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.736096  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3263  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.9 
 
 
259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0574921 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0653  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.95 
 
 
265 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0178796  normal  0.245911 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3403  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.45 
 
 
238 aa  210  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.735952 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5258  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.13 
 
 
257 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1199  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.5 
 
 
258 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.39444  decreased coverage  0.00461164 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03472  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.19 
 
 
255 aa  203  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2344  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.58 
 
 
262 aa  201  8e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.954303  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4728  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.68 
 
 
239 aa  201  9e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.06 
 
 
241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3677  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.13 
 
 
240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4990  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  45.68 
 
 
245 aa  199  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04340  putative pyridoxine biosynthesis protein  41.22 
 
 
237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1041  pyridoxine 5'-phosphate synthase  43.39 
 
 
238 aa  191  7e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0595  pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.31 
 
 
268 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.77 
 
 
260 aa  189  4e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0740712  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3632  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.38 
 
 
271 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757255  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1695  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.91 
 
 
237 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1405  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.53 
 
 
254 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0046  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.37 
 
 
260 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0014  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.75 
 
 
247 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104614 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3058  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.59 
 
 
276 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3259  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  43.8 
 
 
255 aa  158  9e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3051  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.33 
 
 
243 aa  149  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.397726  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0488  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.83 
 
 
251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1678  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.83 
 
 
240 aa  145  5e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2717  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.08 
 
 
243 aa  143  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2956  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.5 
 
 
243 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.586125  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.5 
 
 
243 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.776191 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2781  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.5 
 
 
243 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2821  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.5 
 
 
243 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02458  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  37.08 
 
 
243 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1104  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  37.08 
 
 
243 aa  142  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548705  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3800  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.08 
 
 
243 aa  142  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1113  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.08 
 
 
243 aa  142  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02422  hypothetical protein  37.08 
 
 
243 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2719  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.08 
 
 
243 aa  142  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2850  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.08 
 
 
243 aa  142  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.445885  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2740  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.5 
 
 
243 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2929  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.67 
 
 
243 aa  142  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.513928  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.66 
 
 
247 aa  141  8e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2036  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.4 
 
 
243 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.17 
 
 
243 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09561  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.04 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.361641 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0279  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.47 
 
 
243 aa  135  4e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1118  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.61 
 
 
238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0749349  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3068  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.51 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.867372  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0737  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.39 
 
 
248 aa  133  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548789  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03533  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.73 
 
 
243 aa  132  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1207  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.1 
 
 
243 aa  132  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2782  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  36.6 
 
 
243 aa  131  7.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0320  pyridoxine 5'-phosphate synthase  30.58 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1265  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.68 
 
 
240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1675  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.61 
 
 
243 aa  130  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2522  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.42 
 
 
243 aa  129  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3709  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.82 
 
 
245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2257  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.29 
 
 
239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2927  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.08 
 
 
245 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4015  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.55 
 
 
235 aa  128  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4053  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.55 
 
 
235 aa  128  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.539524  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1414  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.39 
 
 
249 aa  128  9.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1657  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.85 
 
 
249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12141  pyridoxine 5'-phosphate synthase  32.92 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.224342  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12131  pyridoxine 5'-phosphate synthase  32.78 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0064  pyridoxine 5'-phosphate synthase  29.58 
 
 
235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.757519  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2845  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.66 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.992291  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54290  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.14 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1860  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.4 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.220115  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0975  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.25 
 
 
248 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1124  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35 
 
 
241 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.595561  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0422  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.21 
 
 
244 aa  126  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.644654  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1403  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35 
 
 
241 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1071  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  36.51 
 
 
243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.989266  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1733  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.08 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0933039  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1281  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.66 
 
 
245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.661895  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1008  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.25 
 
 
248 aa  125  5e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1351  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.66 
 
 
245 aa  125  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1040  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.92 
 
 
245 aa  125  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.526796  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0252  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  34.29 
 
 
245 aa  125  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1248  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.66 
 
 
245 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0135283  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4547  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.55 
 
 
240 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.336001  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2763  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.08 
 
 
245 aa  125  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.105389  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2776  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.24 
 
 
257 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3023  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.66 
 
 
245 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.316333  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1057  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.17 
 
 
245 aa  125  9e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0546  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.24 
 
 
257 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.795821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>