239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1493 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1493  pyridoxine 5'-phosphate synthase  100 
 
 
248 aa  505  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2794  pyridoxine 5'-phosphate synthase  74.8 
 
 
250 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0224689  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1982  pyridoxine 5'-phosphate synthase  73.58 
 
 
250 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2768  pyridoxine 5'-phosphate synthase  73.98 
 
 
250 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180597  normal  0.550753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2512  pyridoxine 5'-phosphate synthase  73.98 
 
 
250 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1341  pyridoxine 5'-phosphate synthase  73.58 
 
 
246 aa  336  1.9999999999999998e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000107326  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1385  pyridoxine 5'-phosphate synthase  73.17 
 
 
246 aa  333  1e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0165798  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1810  pyridoxine 5'-phosphate synthase  72.76 
 
 
245 aa  331  8e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0918  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.74 
 
 
244 aa  280  1e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.184744  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1752  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.23 
 
 
252 aa  228  8e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.736096  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2318  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.5 
 
 
255 aa  226  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0653  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.24 
 
 
265 aa  223  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0178796  normal  0.245911 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5258  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.68 
 
 
257 aa  222  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1713  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.02 
 
 
251 aa  222  6e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2616  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.74 
 
 
259 aa  221  8e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2344  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.82 
 
 
262 aa  219  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.954303  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3263  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.32 
 
 
259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0574921 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1199  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.41 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.39444  decreased coverage  0.00461164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.27 
 
 
245 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.371359  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.44 
 
 
241 aa  202  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3632  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.36 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757255  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3403  pyridoxine 5'-phosphate synthase  43.75 
 
 
238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.735952 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0595  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.74 
 
 
268 aa  199  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4728  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.53 
 
 
239 aa  198  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0630  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.11 
 
 
238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.377308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4990  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  45.08 
 
 
245 aa  195  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03472  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46 
 
 
255 aa  193  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1405  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.53 
 
 
254 aa  192  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.96 
 
 
260 aa  192  5e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0740712  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0046  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.56 
 
 
260 aa  190  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04340  putative pyridoxine biosynthesis protein  40.98 
 
 
237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1041  pyridoxine 5'-phosphate synthase  42.32 
 
 
238 aa  189  5e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3677  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.45 
 
 
240 aa  188  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0014  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.78 
 
 
247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104614 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1695  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.75 
 
 
237 aa  182  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3058  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.95 
 
 
276 aa  183  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3259  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  43.27 
 
 
255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0320  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.74 
 
 
244 aa  145  4.0000000000000006e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3051  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.24 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.397726  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1678  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.03 
 
 
240 aa  139  3e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0488  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.03 
 
 
251 aa  140  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.13 
 
 
247 aa  137  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2717  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.45 
 
 
243 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2929  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.45 
 
 
243 aa  136  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.513928  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02458  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  37.45 
 
 
243 aa  135  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1104  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  37.45 
 
 
243 aa  135  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548705  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2719  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.45 
 
 
243 aa  135  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2850  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.45 
 
 
243 aa  135  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.445885  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1113  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.45 
 
 
243 aa  135  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3800  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.45 
 
 
243 aa  135  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02422  hypothetical protein  37.45 
 
 
243 aa  135  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.45 
 
 
243 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.776191 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2781  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.45 
 
 
243 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2956  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.45 
 
 
243 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.586125  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2821  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.45 
 
 
243 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0446  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.27 
 
 
235 aa  132  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.86215  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2036  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.71 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2740  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.45 
 
 
243 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0409  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.44 
 
 
248 aa  128  7.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1040  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.97 
 
 
245 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.526796  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0646  pyridoxine 5'-phosphate synthase  31.69 
 
 
240 aa  128  7.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192361  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3458  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.01 
 
 
249 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.67158 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0975  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.82 
 
 
248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1733  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.68 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1008  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.82 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2522  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.55 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13808  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1675  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.17 
 
 
243 aa  125  6e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2248  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.68 
 
 
236 aa  125  7e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.02 
 
 
243 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0279  pyridoxine 5'-phosphate synthase  31.91 
 
 
243 aa  123  2e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.68 
 
 
236 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.357932  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12131  pyridoxine 5'-phosphate synthase  31.25 
 
 
238 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03533  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.6 
 
 
243 aa  123  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2782  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  34.47 
 
 
243 aa  123  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1118  pyridoxine 5'-phosphate synthase  31.25 
 
 
238 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0749349  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0336  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.73 
 
 
264 aa  122  5e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12141  pyridoxine 5'-phosphate synthase  31.36 
 
 
323 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.224342  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0484  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.3 
 
 
235 aa  122  7e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00217083  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1436  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.39 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.532201  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10801  pyridoxine 5'-phosphate synthase  31.82 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.521124  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0737  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.61 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548789  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0867  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.61 
 
 
240 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0203459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1011  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.61 
 
 
240 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1265  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.45 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3666  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.21 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0064  pyridoxine 5'-phosphate synthase  29.41 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.757519  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09561  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.45 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.361641 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1351  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.93 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3948  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.55 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0805  pyridoxine 5'-phosphate synthase  30.13 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.916602  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4285  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.39 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1573  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.85 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.313613  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0997  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.08 
 
 
247 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1657  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 
249 aa  120  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2609  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.47 
 
 
254 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0258596  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1478  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.55 
 
 
248 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323845  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1139  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.32 
 
 
243 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4214  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  37.55 
 
 
246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256384  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1192  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.32 
 
 
243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3614  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.32 
 
 
243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>