239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2344 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2344  pyridoxine 5'-phosphate synthase  100 
 
 
262 aa  531  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.954303  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2616  pyridoxine 5'-phosphate synthase  79.92 
 
 
259 aa  404  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3263  pyridoxine 5'-phosphate synthase  79.51 
 
 
259 aa  402  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0574921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5258  pyridoxine 5'-phosphate synthase  78.17 
 
 
257 aa  375  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1199  pyridoxine 5'-phosphate synthase  76.73 
 
 
258 aa  374  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.39444  decreased coverage  0.00461164 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0595  pyridoxine 5'-phosphate synthase  68.05 
 
 
268 aa  353  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1752  pyridoxine 5'-phosphate synthase  70.56 
 
 
252 aa  351  8e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.736096  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3058  pyridoxine 5'-phosphate synthase  68.56 
 
 
276 aa  336  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0653  pyridoxine 5'-phosphate synthase  68.7 
 
 
265 aa  335  2.9999999999999997e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0178796  normal  0.245911 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3632  pyridoxine 5'-phosphate synthase  65.89 
 
 
271 aa  331  9e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757255  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1405  pyridoxine 5'-phosphate synthase  69.88 
 
 
254 aa  322  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2318  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.32 
 
 
255 aa  302  3.0000000000000004e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03472  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.54 
 
 
255 aa  246  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.83 
 
 
241 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1713  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.85 
 
 
251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0014  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.1 
 
 
247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104614 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4990  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  49.58 
 
 
245 aa  231  7.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_002950  PG0630  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50 
 
 
238 aa  225  7e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.377308 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1493  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.82 
 
 
248 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.4 
 
 
260 aa  222  4e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0740712  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0046  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.4 
 
 
260 aa  222  4e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3677  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.58 
 
 
240 aa  221  8e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.33 
 
 
245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.371359  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4728  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.74 
 
 
239 aa  218  6e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1041  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.06 
 
 
238 aa  215  5.9999999999999996e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1695  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.64 
 
 
237 aa  211  7.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3403  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.41 
 
 
238 aa  211  9e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.735952 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04340  putative pyridoxine biosynthesis protein  45.64 
 
 
237 aa  211  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1341  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.83 
 
 
246 aa  208  8e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000107326  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2794  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.58 
 
 
250 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0224689  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1810  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.63 
 
 
245 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2768  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.9 
 
 
250 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180597  normal  0.550753 
 
 
-
 
NC_004310  BR1385  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.42 
 
 
246 aa  206  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0165798  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1982  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.22 
 
 
250 aa  202  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2512  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.06 
 
 
250 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3259  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.26 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0918  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.61 
 
 
244 aa  186  4e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.184744  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0377  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.14 
 
 
255 aa  150  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0844615  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0320  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.08 
 
 
244 aa  149  4e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1634  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.15 
 
 
270 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0172383  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0336  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.18 
 
 
264 aa  144  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0446  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.24 
 
 
235 aa  143  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.86215  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0370  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.99 
 
 
264 aa  142  4e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.225374  normal  0.0276101 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.93 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0997  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.23 
 
 
247 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4746  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.56 
 
 
248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314773  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0867  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.45 
 
 
240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0203459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1011  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.45 
 
 
240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54290  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.56 
 
 
248 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2629  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.67 
 
 
241 aa  135  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3948  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.44 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4214  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  36.86 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256384  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1478  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.23 
 
 
248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323845  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0643  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.36 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0409  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.48 
 
 
248 aa  132  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1759  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.2 
 
 
265 aa  132  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0252  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  37.71 
 
 
245 aa  131  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1573  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.55 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.313613  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1436  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.93 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.532201  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3666  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.36 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1385  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  34.96 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0646  pyridoxine 5'-phosphate synthase  32.51 
 
 
240 aa  129  3e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192361  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1265  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.76 
 
 
240 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4371  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.93 
 
 
246 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.194442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1076  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.93 
 
 
246 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1733  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.54 
 
 
264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4285  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.93 
 
 
240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3458  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.87 
 
 
249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.67158 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0805  pyridoxine 5'-phosphate synthase  32.05 
 
 
239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.916602  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.2 
 
 
247 aa  129  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1118  pyridoxine 5'-phosphate synthase  31.82 
 
 
238 aa  128  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0749349  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0488  pyridoxine 5'-phosphate synthase  32.63 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2242  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.43 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.626957  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12131  pyridoxine 5'-phosphate synthase  31.8 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0484  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.56 
 
 
235 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00217083  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1678  pyridoxine 5'-phosphate synthase  32.76 
 
 
240 aa  125  5e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1944  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  33.88 
 
 
255 aa  125  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.35633  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3051  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.29 
 
 
243 aa  125  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.397726  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2782  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  35.93 
 
 
243 aa  125  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2717  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.24 
 
 
243 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1860  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.08 
 
 
243 aa  125  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.220115  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12141  pyridoxine 5'-phosphate synthase  31.4 
 
 
323 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.224342  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1675  pyridoxine 5'-phosphate synthase  32.77 
 
 
243 aa  123  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10801  pyridoxine 5'-phosphate synthase  32.48 
 
 
243 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.521124  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.15 
 
 
236 aa  123  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.357932  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02458  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  35.81 
 
 
243 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1104  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  35.81 
 
 
243 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548705  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.77 
 
 
243 aa  123  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1017  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.66 
 
 
258 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02422  hypothetical protein  35.81 
 
 
243 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0273  pyridoxine 5'-phosphate synthase  30.64 
 
 
238 aa  123  3e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2850  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.81 
 
 
243 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.445885  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1113  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.81 
 
 
243 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0516  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.73 
 
 
248 aa  123  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3800  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.81 
 
 
243 aa  123  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2719  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.81 
 
 
243 aa  123  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1013  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.66 
 
 
258 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2036  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.87 
 
 
243 aa  122  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2896  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.74 
 
 
254 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849823  normal  0.107907 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2929  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.51 
 
 
243 aa  122  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.513928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>