239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1675 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1675  pyridoxine 5'-phosphate synthase  100 
 
 
243 aa  490  1e-137  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0646  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.92 
 
 
240 aa  281  6.000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192361  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0737  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.09 
 
 
248 aa  265  5.999999999999999e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548789  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3051  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.75 
 
 
243 aa  262  4e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.397726  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09561  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.94 
 
 
245 aa  261  8e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.361641 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3666  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.09 
 
 
243 aa  259  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02458  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  59.58 
 
 
243 aa  259  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1104  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  59.58 
 
 
243 aa  259  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02422  hypothetical protein  59.58 
 
 
243 aa  259  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1113  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.58 
 
 
243 aa  259  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2719  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.58 
 
 
243 aa  259  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3800  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.58 
 
 
243 aa  259  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2850  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.58 
 
 
243 aa  259  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.445885  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0446  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.85 
 
 
235 aa  258  7e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.86215  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2717  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.17 
 
 
243 aa  258  7e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1118  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.6 
 
 
238 aa  256  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0749349  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2929  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.17 
 
 
243 aa  256  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.513928  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12131  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.6 
 
 
238 aa  256  2e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0377  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.83 
 
 
255 aa  256  3e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0844615  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2821  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.33 
 
 
243 aa  255  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.33 
 
 
243 aa  255  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.776191 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2781  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.33 
 
 
243 aa  255  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2956  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.33 
 
 
243 aa  255  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.586125  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2740  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.92 
 
 
243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1678  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.61 
 
 
240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0488  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.61 
 
 
251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1414  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.87 
 
 
249 aa  252  3e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11981  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.32 
 
 
238 aa  252  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.526754  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3068  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.02 
 
 
243 aa  251  5.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.867372  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14741  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.43 
 
 
245 aa  251  6e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.44969  normal  0.931321 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1192  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.43 
 
 
243 aa  251  9.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1139  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.43 
 
 
243 aa  251  9.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3614  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.43 
 
 
243 aa  251  9.000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.62 
 
 
236 aa  250  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.357932  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12141  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.17 
 
 
323 aa  250  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.224342  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0642  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.02 
 
 
245 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.869515  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1207  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.6 
 
 
243 aa  250  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0484  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.16 
 
 
235 aa  249  3e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00217083  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1088  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.17 
 
 
254 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0409  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.11 
 
 
248 aa  248  4e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2333  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.7 
 
 
242 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1657  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.3 
 
 
249 aa  248  6e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2896  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.17 
 
 
254 aa  248  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849823  normal  0.107907 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0279  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.79 
 
 
243 aa  248  8e-65  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2367  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.45 
 
 
242 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2455  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.45 
 
 
242 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.45 
 
 
242 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.498379  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2522  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.85 
 
 
243 aa  247  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13808  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0422  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.84 
 
 
244 aa  247  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.644654  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1944  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  51.65 
 
 
255 aa  247  1e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.35633  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2782  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  53.53 
 
 
243 aa  246  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1071  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  54.77 
 
 
243 aa  246  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.989266  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10801  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.17 
 
 
243 aa  246  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.521124  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.58 
 
 
254 aa  245  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147174  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1759  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.91 
 
 
265 aa  245  4e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0336  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.04 
 
 
264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3709  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.43 
 
 
245 aa  244  8e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1634  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55 
 
 
270 aa  244  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0172383  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1002  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.81 
 
 
239 aa  242  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148363  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1385  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  53.33 
 
 
250 aa  242  3e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3458  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.98 
 
 
249 aa  242  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.67158 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03533  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.6 
 
 
243 aa  241  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1733  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.52 
 
 
264 aa  241  9e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.19 
 
 
243 aa  241  9e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2629  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.24 
 
 
241 aa  241  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1008  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.33 
 
 
248 aa  240  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0805  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.26 
 
 
239 aa  240  1e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.916602  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0911  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.79 
 
 
247 aa  240  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0316197  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1265  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.77 
 
 
240 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2444  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.2 
 
 
260 aa  239  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1351  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.68 
 
 
245 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1573  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.61 
 
 
247 aa  239  4e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.313613  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1804  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.12 
 
 
239 aa  238  5e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.207619  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0273  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.34 
 
 
238 aa  238  5.999999999999999e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3873  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.87 
 
 
241 aa  238  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.532548  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1672  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.81 
 
 
252 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0305  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.81 
 
 
252 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2845  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.68 
 
 
245 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.992291  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0975  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.92 
 
 
248 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0867  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.11 
 
 
240 aa  237  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0203459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1011  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.11 
 
 
240 aa  237  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4119  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.37 
 
 
246 aa  236  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.019832  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2083  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.23 
 
 
246 aa  236  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.301818  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0795  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.87 
 
 
246 aa  236  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2526  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.32 
 
 
239 aa  236  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.248479  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4547  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.27 
 
 
240 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.336001  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0370  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.2 
 
 
264 aa  235  4e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.225374  normal  0.0276101 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2927  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.26 
 
 
245 aa  235  4e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0643  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.92 
 
 
244 aa  235  4e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1690  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50 
 
 
236 aa  235  5.0000000000000005e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.368912  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54290  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.3 
 
 
248 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2036  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.6 
 
 
243 aa  235  6e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1162  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.85 
 
 
245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.331804  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0064  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.62 
 
 
235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.757519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2032  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.240988  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3109  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.85 
 
 
245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00124308  normal  0.0210238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1076  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.26 
 
 
246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1281  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.85 
 
 
245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.661895  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1204  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.85 
 
 
245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0207409  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2309  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.22 
 
 
250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0100361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>