239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1944 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1944  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  100 
 
 
255 aa  513  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.35633  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1095  pyridoxine 5'-phosphate synthase  69.8 
 
 
246 aa  321  5e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.533412  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2740  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.51 
 
 
243 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.28 
 
 
247 aa  277  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1678  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.74 
 
 
240 aa  275  3e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0488  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.74 
 
 
251 aa  276  3e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2929  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.26 
 
 
243 aa  274  9e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.513928  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.09 
 
 
243 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.776191 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2717  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.26 
 
 
243 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2956  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.09 
 
 
243 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.586125  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2781  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.09 
 
 
243 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2821  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.09 
 
 
243 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1385  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  58.58 
 
 
250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02458  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  56.85 
 
 
243 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1104  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  56.85 
 
 
243 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02422  hypothetical protein  56.85 
 
 
243 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1113  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.85 
 
 
243 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2719  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.85 
 
 
243 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3800  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.85 
 
 
243 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2850  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.85 
 
 
243 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.445885  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3068  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.26 
 
 
243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.867372  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2782  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  56.43 
 
 
243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54290  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.74 
 
 
248 aa  268  7e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1207  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.85 
 
 
243 aa  267  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.6 
 
 
243 aa  265  5.999999999999999e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3051  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.02 
 
 
243 aa  265  7e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.397726  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1071  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  56.43 
 
 
243 aa  265  7e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.989266  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0795  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.38 
 
 
246 aa  261  4.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0196  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.91 
 
 
254 aa  262  4.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1008  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.58 
 
 
248 aa  259  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1403  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.07 
 
 
241 aa  260  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03533  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.94 
 
 
243 aa  260  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2563  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.15 
 
 
252 aa  259  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117328  hitchhiker  0.00154499 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1139  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.6 
 
 
243 aa  259  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1124  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.07 
 
 
241 aa  260  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.595561  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1192  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.6 
 
 
243 aa  259  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3614  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.6 
 
 
243 aa  259  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4746  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.32 
 
 
248 aa  258  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314773  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1634  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.92 
 
 
270 aa  258  5.0000000000000005e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0172383  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3666  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.43 
 
 
243 aa  258  7e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0975  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.16 
 
 
248 aa  258  8e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3709  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.97 
 
 
245 aa  258  8e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2036  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.77 
 
 
243 aa  257  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0279  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.92 
 
 
243 aa  256  2e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0737  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.47 
 
 
248 aa  256  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548789  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2083  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.43 
 
 
246 aa  255  5e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.301818  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0516  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.94 
 
 
248 aa  255  6e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0422  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.79 
 
 
244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.644654  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.02 
 
 
248 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2629  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.83 
 
 
241 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.88 
 
 
254 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147174  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1407  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.44 
 
 
248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.670509  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2522  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.53 
 
 
243 aa  250  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13808  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0911  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.32 
 
 
247 aa  250  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0316197  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2896  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.04 
 
 
254 aa  250  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849823  normal  0.107907 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1672  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.61 
 
 
252 aa  249  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0867  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.47 
 
 
240 aa  249  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0203459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1011  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.47 
 
 
240 aa  249  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1088  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.04 
 
 
254 aa  249  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2415  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.3 
 
 
260 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0305  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.61 
 
 
252 aa  249  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1246  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.81 
 
 
245 aa  249  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000778837  unclonable  0.0000000131093 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2367  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.75 
 
 
242 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.75 
 
 
242 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.498379  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2845  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.65 
 
 
245 aa  249  4e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.992291  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2455  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.75 
 
 
242 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4119  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.69 
 
 
246 aa  248  9e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.019832  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1350  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.79 
 
 
261 aa  248  9e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0751637  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1076  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.87 
 
 
246 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0997  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.87 
 
 
247 aa  247  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2927  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.65 
 
 
245 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2871  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.92 
 
 
265 aa  247  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0175747 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0409  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.24 
 
 
248 aa  246  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3873  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.32 
 
 
241 aa  246  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.532548  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1759  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.47 
 
 
265 aa  247  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1281  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.65 
 
 
245 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.661895  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1057  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.77 
 
 
245 aa  246  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2574  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.92 
 
 
249 aa  245  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0294223 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1162  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.65 
 
 
245 aa  245  4e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.331804  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2242  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.3 
 
 
244 aa  245  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.626957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3109  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.65 
 
 
245 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00124308  normal  0.0210238 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2926  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.65 
 
 
265 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1248  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.65 
 
 
245 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0135283  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4371  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.46 
 
 
246 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.194442 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1436  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.87 
 
 
246 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.532201  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3023  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.23 
 
 
245 aa  245  6e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.316333  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2444  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.82 
 
 
260 aa  245  6e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2333  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.08 
 
 
242 aa  244  8e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1351  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.81 
 
 
245 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3948  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.05 
 
 
246 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3458  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.2 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.67158 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1040  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.65 
 
 
245 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.526796  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03404  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.33 
 
 
250 aa  244  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.405613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1204  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.23 
 
 
245 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0207409  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0377  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.72 
 
 
255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0844615  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1854  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.19 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1478  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.46 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323845  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0031  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.3 
 
 
244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2892  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.29 
 
 
257 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4285  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.24 
 
 
240 aa  242  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>